More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1372 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_0648  ATPase central domain-containing protein  88.05 
 
 
392 aa  716    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3012  AAA ATPase central domain protein  96.63 
 
 
392 aa  745    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0560147 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1267  ATPase central domain-containing protein  95.85 
 
 
392 aa  747    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2812  ATPase central domain-containing protein  92.86 
 
 
392 aa  755    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1372  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 
392 aa  805    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.776421  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1335  ATPase central domain-containing protein  96.89 
 
 
392 aa  771    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1346  ATPase central domain-containing protein  97.56 
 
 
294 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1349  ATPase central domain-containing protein  95.92 
 
 
99 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04110  AAA family ATPase, putative  30.55 
 
 
516 aa  117  3e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47614  predicted protein  30.04 
 
 
443 aa  114  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.80881  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2241  AAA ATPase  26.33 
 
 
415 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.85938 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03131  mitochondrial chaperone BCS1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13000)  26.55 
 
 
497 aa  106  8e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.011149  normal  0.228986 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06397  conserved hypothetical protein  29.15 
 
 
518 aa  86.3  8e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0341883 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07549  BCS1-like ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14760)  30.43 
 
 
650 aa  77.4  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.543729  hitchhiker  0.000156969 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  34.56 
 
 
393 aa  68.6  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  32.03 
 
 
379 aa  67.8  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  34.06 
 
 
389 aa  67.4  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2959  AAA ATPase central domain protein  41.18 
 
 
466 aa  67  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.968368 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  34.29 
 
 
412 aa  65.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  33.58 
 
 
393 aa  65.1  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32455  predicted protein  30.65 
 
 
353 aa  64.7  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0900951  normal  0.127323 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  31.37 
 
 
405 aa  64.3  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  34.04 
 
 
413 aa  63.9  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2182  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.83 
 
 
621 aa  63.9  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.863514  normal  0.57475 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  29.89 
 
 
607 aa  63.2  0.000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0272  peptidase M41, FtsH  32.4 
 
 
639 aa  63.2  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.520053  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  33.09 
 
 
386 aa  62.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2049  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.84 
 
 
577 aa  62.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000035713  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  29.1 
 
 
422 aa  62  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  32.39 
 
 
438 aa  61.2  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0706  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.17 
 
 
618 aa  61.2  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.437381 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41778  predicted protein  31.88 
 
 
284 aa  60.8  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0751976  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.85 
 
 
719 aa  60.8  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1229  cell division protein  30.68 
 
 
646 aa  60.5  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211886  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  28.64 
 
 
718 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  28.71 
 
 
464 aa  60.1  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  32.09 
 
 
400 aa  60.1  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  30.56 
 
 
415 aa  60.5  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  31.16 
 
 
402 aa  60.1  0.00000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf856  cell division protein FtsH  33.1 
 
 
744 aa  59.7  0.00000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  27.96 
 
 
410 aa  59.7  0.00000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04236  hypothetical protein similar to TAT-binding protein 1 (Broad)  30.97 
 
 
465 aa  59.7  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  34.78 
 
 
394 aa  59.3  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3828  AAA ATPase central domain protein  39.26 
 
 
458 aa  59.3  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.191922  normal  0.0134445 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  32.39 
 
 
390 aa  59.3  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  31.34 
 
 
416 aa  59.3  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.06 
 
 
617 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00193369  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  31.69 
 
 
407 aa  58.5  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1606  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.25 
 
 
660 aa  58.9  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.14 
 
 
727 aa  58.5  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.42 
 
 
730 aa  58.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  30.83 
 
 
421 aa  58.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.15 
 
 
757 aa  58.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0113  ATP-dependent zinc metallopeptidase - cell division protein  29.94 
 
 
715 aa  58.2  0.0000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  33.09 
 
 
389 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0625  methyltransferase type 11  32.31 
 
 
826 aa  58.9  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1012  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.2 
 
 
616 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.93 
 
 
701 aa  57.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.32 
 
 
630 aa  57.8  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000142168  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.81 
 
 
760 aa  57.8  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.34 
 
 
773 aa  57.8  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  32.09 
 
 
776 aa  57.8  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.14 
 
 
721 aa  58.2  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3248  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.77 
 
 
616 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30067  predicted protein  35.25 
 
 
403 aa  57.4  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.78 
 
 
754 aa  57.4  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.33 
 
 
650 aa  57.4  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.997433  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0309  AAA ATPase  31.68 
 
 
415 aa  57.4  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.902003  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.11 
 
 
738 aa  57.4  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0674  Adenosinetriphosphatase  28.73 
 
 
737 aa  57.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.444846  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  34.53 
 
 
713 aa  57.4  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  33.33 
 
 
412 aa  57  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  28.35 
 
 
410 aa  57  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32343  predicted protein  33.82 
 
 
425 aa  57  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0415891  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.76 
 
 
731 aa  57  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4836  Microtubule-severing ATPase  26.73 
 
 
641 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0348  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.56 
 
 
812 aa  57  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.845111  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7198  Microtubule-severing ATPase  30.08 
 
 
663 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0849577  normal  0.0429658 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0660  ATP-dependent metalloprotease FtsH  26.6 
 
 
620 aa  57  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.464509  normal  0.415833 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.99 
 
 
639 aa  57.4  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10440  ATPase  28.85 
 
 
728 aa  57  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33894  predicted protein  32.37 
 
 
398 aa  57  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00183921  normal  0.0445175 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  29.46 
 
 
754 aa  57  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32090  membrane protease FtsH catalytic subunit  29.09 
 
 
684 aa  57  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2987  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.31 
 
 
669 aa  56.6  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.832035  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  31.94 
 
 
417 aa  56.6  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  33.33 
 
 
426 aa  56.6  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52887  26S proteasome regulatory subunit  32.12 
 
 
427 aa  56.6  0.0000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  31.16 
 
 
405 aa  56.6  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0444  Mername-AA223 peptidase  30 
 
 
681 aa  56.6  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0979  FtsH peptidase  31.85 
 
 
641 aa  56.6  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.33 
 
 
715 aa  56.6  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3711  Adenosinetriphosphatase  28.66 
 
 
733 aa  56.6  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.77 
 
 
633 aa  56.6  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33311  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0016  cell division protein FtsH  29.94 
 
 
658 aa  56.2  0.0000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  31.62 
 
 
639 aa  56.2  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0404  ATP-dependent Zn protease  29.82 
 
 
700 aa  56.2  0.0000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.083977  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1266  proteasome-activating nucleotidase  30.22 
 
 
404 aa  56.2  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  31.25 
 
 
389 aa  55.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0634  ATPase central domain-containing protein  26.63 
 
 
599 aa  55.8  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.527117  normal  0.730431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>