More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1335 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1267  ATPase central domain-containing protein  95.66 
 
 
392 aa  753    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1335  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 
392 aa  806    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0648  ATPase central domain-containing protein  87.76 
 
 
392 aa  726    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1372  ATPase central domain-containing protein  96.89 
 
 
392 aa  771    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.776421  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3012  AAA ATPase central domain protein  99.23 
 
 
392 aa  800    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0560147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2812  ATPase central domain-containing protein  92.75 
 
 
392 aa  741    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1346  ATPase central domain-containing protein  99.66 
 
 
294 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1349  ATPase central domain-containing protein  98.99 
 
 
99 aa  199  9e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47614  predicted protein  30.74 
 
 
443 aa  117  3e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.80881  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04110  AAA family ATPase, putative  29.82 
 
 
516 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2241  AAA ATPase  26.61 
 
 
415 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.85938 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03131  mitochondrial chaperone BCS1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13000)  25.82 
 
 
497 aa  100  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.011149  normal  0.228986 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06397  conserved hypothetical protein  29.15 
 
 
518 aa  87.4  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0341883 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07549  BCS1-like ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14760)  31.1 
 
 
650 aa  79.3  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.543729  hitchhiker  0.000156969 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  34.33 
 
 
393 aa  70.1  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  32.03 
 
 
405 aa  69.3  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  34.56 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0272  peptidase M41, FtsH  32.4 
 
 
639 aa  67  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.520053  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  32.03 
 
 
379 aa  67  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2182  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.83 
 
 
621 aa  66.2  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.863514  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0706  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.87 
 
 
618 aa  65.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.437381 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  33.33 
 
 
389 aa  65.5  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2959  AAA ATPase central domain protein  40.44 
 
 
466 aa  65.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.968368 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  32.84 
 
 
400 aa  65.1  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  35.51 
 
 
394 aa  64.3  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  34.29 
 
 
412 aa  64.7  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.6 
 
 
719 aa  64.7  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0625  methyltransferase type 11  33.85 
 
 
826 aa  64.3  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  29.63 
 
 
422 aa  64.3  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  32.09 
 
 
416 aa  63.9  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32455  predicted protein  29.35 
 
 
353 aa  63.5  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0900951  normal  0.127323 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.78 
 
 
617 aa  63.9  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00193369  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  32.59 
 
 
421 aa  63.5  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1229  cell division protein  30.68 
 
 
646 aa  63.5  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211886  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1606  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.82 
 
 
660 aa  63.2  0.000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  34.04 
 
 
413 aa  63.2  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  33.09 
 
 
386 aa  63.2  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.97 
 
 
630 aa  62.8  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000142168  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1012  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.77 
 
 
616 aa  62.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.09 
 
 
650 aa  62.4  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.997433  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3248  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.33 
 
 
616 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  34.04 
 
 
426 aa  62.8  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  29.89 
 
 
607 aa  62  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.69 
 
 
639 aa  62  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.67 
 
 
757 aa  61.6  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7198  Microtubule-severing ATPase  30.83 
 
 
663 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0849577  normal  0.0429658 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  29.1 
 
 
410 aa  62.4  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.88 
 
 
738 aa  62  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.53 
 
 
773 aa  61.6  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.47 
 
 
633 aa  61.6  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33311  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32090  membrane protease FtsH catalytic subunit  29.7 
 
 
684 aa  61.2  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf856  cell division protein FtsH  33.8 
 
 
744 aa  61.2  0.00000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.14 
 
 
727 aa  61.2  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4836  Microtubule-severing ATPase  28.98 
 
 
641 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2987  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.92 
 
 
669 aa  61.2  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.832035  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2049  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.09 
 
 
577 aa  61.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000035713  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.83 
 
 
852 aa  61.2  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.65 
 
 
754 aa  60.5  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.03 
 
 
754 aa  60.8  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3828  AAA ATPase central domain protein  39.26 
 
 
458 aa  60.8  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.191922  normal  0.0134445 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  25.69 
 
 
684 aa  60.8  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.14 
 
 
721 aa  60.8  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2884  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.2 
 
 
623 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.402765  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0444  Mername-AA223 peptidase  30.59 
 
 
681 aa  60.8  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0660  ATP-dependent metalloprotease FtsH  26.47 
 
 
620 aa  60.5  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.464509  normal  0.415833 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.58 
 
 
730 aa  60.5  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1322  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.09 
 
 
631 aa  60.5  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.131641 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0627  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.05 
 
 
682 aa  60.5  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0250398  normal  0.798069 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.09 
 
 
640 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1422  ATPase central domain-containing protein  28.06 
 
 
715 aa  60.1  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  32.39 
 
 
438 aa  60.5  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09061  cell division protein FtsH4  32.59 
 
 
577 aa  60.1  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0625866  hitchhiker  0.0000226946 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.35 
 
 
641 aa  60.1  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9090  predicted protein  33.81 
 
 
431 aa  60.1  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.33 
 
 
760 aa  60.5  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.09 
 
 
642 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.09 
 
 
642 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  31.85 
 
 
639 aa  60.1  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.09 
 
 
642 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  30.56 
 
 
415 aa  59.7  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.17 
 
 
620 aa  59.7  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  28.71 
 
 
464 aa  59.7  0.00000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  31.62 
 
 
764 aa  59.7  0.00000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41778  predicted protein  31.88 
 
 
284 aa  59.7  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0751976  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2636  cell division protein FtsH  31.39 
 
 
641 aa  59.7  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235612  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2262  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.39 
 
 
641 aa  59.7  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000538209  hitchhiker  0.0000000171199 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04236  hypothetical protein similar to TAT-binding protein 1 (Broad)  30.97 
 
 
465 aa  58.9  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.110869 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0648  AAA ATPase central domain protein  31.85 
 
 
585 aa  58.9  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0518  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.84 
 
 
636 aa  58.9  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000475149  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0483  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.96 
 
 
631 aa  59.7  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000161272  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0128  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.37 
 
 
614 aa  58.9  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.464101 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0674  Adenosinetriphosphatase  29.12 
 
 
737 aa  59.3  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.444846  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.14 
 
 
638 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3837  AAA ATPase central domain protein  32.61 
 
 
715 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1848  ATP-dependent Zn protease  31.72 
 
 
697 aa  59.3  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.702512  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32343  predicted protein  33.82 
 
 
425 aa  58.9  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0415891  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  32.84 
 
 
404 aa  59.7  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3438  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.06 
 
 
607 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.588898  hitchhiker  0.000161563 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.08 
 
 
735 aa  59.3  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24780  membrane protease FtsH catalytic subunit  29.61 
 
 
698 aa  59.7  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>