72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2808 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2808  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  838    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000299929 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2470  glycosyl hydrolase family 88  36.1 
 
 		 393 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5505  glycosyl hydrolase family 88  31.73 
 
 		 629 aa  199  6e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0777464  hitchhiker  0.00601524 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2381  glycosyl hydrolase family 88  31.83 
 
 		 373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4252  glycosy hydrolase family protein  37.03 
 
 		 399 aa  196  8.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239169  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4250  glycosy hydrolase family protein  35.02 
 
 		 397 aa  192  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.478117  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4251  glycosy hydrolase family protein  34.81 
 
 		 401 aa  191  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166912  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2741  glycosyl hydrolase family 88  31.83 
 
 		 639 aa  187  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.578666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2841  glycosyl hydrolase family 88  34.49 
 
 		 612 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.137267  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5387  glycosyl hydrolase family 88  32.02 
 
 		 391 aa  180  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0230208 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  32.02 
 
 		 865 aa  177  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0951  DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit  35.27 
 
 		 827 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607652  hitchhiker  0.00000495983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1024  glycosyl hydrolase family 88  33.66 
 
 		 644 aa  168  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2540  glycosyl hydrolase family 88  32.7 
 
 		 402 aa  160  5e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0696  glycosyl hydrolase family 88  28.85 
 
 		 362 aa  140  6e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0203  glycosy hydrolase family protein  28.66 
 
 		 375 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000431819  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09383  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  31.25 
 
 		 378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.318478 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07828  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  27.27 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.091215  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10505  cell wall glycosyl hydrolase YteR, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14630)  33.06 
 
 		 367 aa  101  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.841717 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5981  di-transpoly-cis-decaprenylcistransferase  27.3 
 
 		 371 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4685  glycosyl hydrolase family 88  27.13 
 
 		 349 aa  97.8  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.558962  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2882  glycosyl hydrolase family 88  26.09 
 
 		 392 aa  90.9  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1344  glycosy hydrolase family protein  32.6 
 
 		 473 aa  90.5  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0449  glycosyl hydrolase family 88  28.63 
 
 		 410 aa  89.7  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1360  glycosy hydrolase family protein  26.48 
 
 		 753 aa  86.3  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576113  normal  0.691294 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3946  hypothetical protein  33.54 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0820  glycosyl hydrolase family 88  22.93 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0456  glycosyl hydrolase family 88  28.39 
 
 		 462 aa  79.7  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03196  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  23.22 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.389014 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0854  glycosyl hydrolase family 88  22.75 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3108  glycosyl hydrolase family 88  29.89 
 
 		 574 aa  76.6  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285148  normal  0.618959 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0846  hypothetical protein  24.18 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2443  glycosy hydrolase family protein  22.74 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3379  glycosyl hydrolase family 88  21.82 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2126  glycosyl hydrolase, family 88  22.7 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000763601 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1211  glycosyl hydrolase, family 88  22.7 
 
 		 379 aa  72.8  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2066  glycosyl hydrolase, family 88  22.7 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.0470712 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3541  glycosyl hydrolase family 88  21.55 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.591399  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2071  glycosyl hydrolase, family 88  22.7 
 
 		 379 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000233336 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1335  glycosyl hydrolase, family 88  22.39 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103644 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1376  glycosy hydrolase family protein  30.51 
 
 		 823 aa  70.9  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0639822  normal  0.967141 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3783  glycosyl hydrolase family 88  21.58 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2294  glycosyl hydrolase family 88  23.18 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  hitchhiker  0.00963008 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1919  glycosy hydrolase family protein  24.69 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0962  glycosy hydrolase family protein  25.61 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4236  glycosy hydrolase family protein  31.85 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2306  glycosyl hydrolase family 88  26.74 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.375805  normal  0.0432907 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0452  glycosyl hydrolase family 88  27.68 
 
 		 381 aa  60.8  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5078  glycosyl hydrolase family 88  23.35 
 
 		 364 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.958101  normal  0.117982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1578  glycosyl hydrolase family 88  30.94 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.998372 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5358  glycosyl hydrolase family 88  23.48 
 
 		 364 aa  59.7  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.622605  normal  0.178388 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1806  glycosyl hydrolase family 88  28.49 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0863  glycosyl hydrolase family 88  26.79 
 
 		 744 aa  58.2  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3673  glycosyl hydrolase family 88  24.37 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3978  glycosyl hydrolase family 88  26.16 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.380372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1282  hypothetical protein  29.13 
 
 		 427 aa  55.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000326624  normal  0.558668 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2704  glycosy hydrolase family protein  25.55 
 
 		 358 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.592912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1289  glycosyl hydrolase family 88  23.5 
 
 		 372 aa  54.3  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5409  glycosyl hydrolase family 88  27.36 
 
 		 376 aa  53.9  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000034973  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4039  glycosyl hydrolase family 88  19.16 
 
 		 346 aa  53.5  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2117  glycosyl hydrolase family 88  24.86 
 
 		 623 aa  53.5  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3524  glycosyl hydrolase family 88  22.84 
 
 		 368 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1549  glycosyl hydrolase family 88  24.64 
 
 		 345 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2300  glycosyl hydrolase family 88  25.68 
 
 		 363 aa  51.6  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00753245  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3368  glycosy hydrolase family protein  30.84 
 
 		 352 aa  50.8  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.65377 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0933  glycosy hydrolase family protein  30.84 
 
 		 352 aa  50.8  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5758  hypothetical protein  23.91 
 
 		 364 aa  50.8  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.489527  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0986  glycosy hydrolase family protein  30.84 
 
 		 352 aa  50.8  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08260  conserved hypothetical protein  23.53 
 
 		 458 aa  48.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.632375  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1750  glycosy hydrolase family protein  24.67 
 
 		 319 aa  47.4  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0661  glycosyl hydrolase family 88  20.75 
 
 		 369 aa  47.4  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0713  glycosyl hydrolase family 88  20.13 
 
 		 362 aa  43.5  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>