71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0449 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0449  glycosyl hydrolase family 88  100 
 
 		 410 aa  856    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0456  glycosyl hydrolase family 88  40.26 
 
 		 462 aa  281  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1344  glycosy hydrolase family protein  34.69 
 
 		 473 aa  250  3e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3108  glycosyl hydrolase family 88  37.16 
 
 		 574 aa  243  6e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285148  normal  0.618959 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1360  glycosy hydrolase family protein  33.14 
 
 		 753 aa  189  8e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576113  normal  0.691294 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2470  glycosyl hydrolase family 88  28.73 
 
 		 393 aa  150  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4251  glycosy hydrolase family protein  34.63 
 
 		 401 aa  140  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166912  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3379  glycosyl hydrolase family 88  32.44 
 
 		 379 aa  139  8.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2126  glycosyl hydrolase, family 88  33.46 
 
 		 379 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000763601 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3541  glycosyl hydrolase family 88  32.88 
 
 		 379 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.591399  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2443  glycosy hydrolase family protein  33.08 
 
 		 379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2071  glycosyl hydrolase, family 88  33.46 
 
 		 379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000233336 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1211  glycosyl hydrolase, family 88  33.46 
 
 		 379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0452  glycosyl hydrolase family 88  32.64 
 
 		 381 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  27.22 
 
 		 865 aa  137  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1335  glycosyl hydrolase, family 88  33.46 
 
 		 379 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103644 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2066  glycosyl hydrolase, family 88  33.46 
 
 		 379 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.0470712 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03196  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  33.47 
 
 		 370 aa  134  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.389014 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2841  glycosyl hydrolase family 88  28.96 
 
 		 612 aa  132  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.137267  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0820  glycosyl hydrolase family 88  35.75 
 
 		 379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4250  glycosy hydrolase family protein  34.05 
 
 		 397 aa  130  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.478117  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0846  hypothetical protein  33.62 
 
 		 374 aa  130  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1024  glycosyl hydrolase family 88  31.94 
 
 		 644 aa  129  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5387  glycosyl hydrolase family 88  33.74 
 
 		 391 aa  129  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0230208 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5505  glycosyl hydrolase family 88  27.62 
 
 		 629 aa  129  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0777464  hitchhiker  0.00601524 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5409  glycosyl hydrolase family 88  34.8 
 
 		 376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000034973  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0854  glycosyl hydrolase family 88  32.75 
 
 		 379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3783  glycosyl hydrolase family 88  28.39 
 
 		 363 aa  124  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2741  glycosyl hydrolase family 88  30.83 
 
 		 639 aa  124  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.578666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4685  glycosyl hydrolase family 88  31.8 
 
 		 349 aa  123  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.558962  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1289  glycosyl hydrolase family 88  33.07 
 
 		 372 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2381  glycosyl hydrolase family 88  25.07 
 
 		 373 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2306  glycosyl hydrolase family 88  31.03 
 
 		 386 aa  113  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.375805  normal  0.0432907 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0962  glycosy hydrolase family protein  34.08 
 
 		 369 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0951  DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit  28.24 
 
 		 827 aa  108  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607652  hitchhiker  0.00000495983 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3524  glycosyl hydrolase family 88  25.92 
 
 		 368 aa  107  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3978  glycosyl hydrolase family 88  30.56 
 
 		 368 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.380372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3673  glycosyl hydrolase family 88  25.13 
 
 		 368 aa  105  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4252  glycosy hydrolase family protein  28.57 
 
 		 399 aa  104  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239169  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0713  glycosyl hydrolase family 88  25.81 
 
 		 362 aa  103  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5078  glycosyl hydrolase family 88  28.45 
 
 		 364 aa  103  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.958101  normal  0.117982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2294  glycosyl hydrolase family 88  29.88 
 
 		 433 aa  102  9e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  hitchhiker  0.00963008 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0203  glycosy hydrolase family protein  25.68 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000431819  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1750  glycosy hydrolase family protein  26.79 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3946  hypothetical protein  31.51 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1919  glycosy hydrolase family protein  30.45 
 
 		 345 aa  102  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0661  glycosyl hydrolase family 88  24.59 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4039  glycosyl hydrolase family 88  29.36 
 
 		 346 aa  100  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5358  glycosyl hydrolase family 88  28.06 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.622605  normal  0.178388 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2704  glycosy hydrolase family protein  27.83 
 
 		 358 aa  100  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.592912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0863  glycosyl hydrolase family 88  29.73 
 
 		 744 aa  97.8  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08260  conserved hypothetical protein  26.11 
 
 		 458 aa  96.3  8e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.632375  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0933  glycosy hydrolase family protein  30 
 
 		 352 aa  95.9  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0986  glycosy hydrolase family protein  30 
 
 		 352 aa  95.9  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3368  glycosy hydrolase family protein  29.91 
 
 		 352 aa  94.4  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.65377 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2117  glycosyl hydrolase family 88  30.42 
 
 		 623 aa  92.8  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0696  glycosyl hydrolase family 88  24.08 
 
 		 362 aa  91.7  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1282  hypothetical protein  24.52 
 
 		 427 aa  90.9  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000326624  normal  0.558668 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2300  glycosyl hydrolase family 88  27 
 
 		 363 aa  90.5  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00753245  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2808  hypothetical protein  28.63 
 
 		 402 aa  89.7  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000299929 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5758  hypothetical protein  26.22 
 
 		 364 aa  90.1  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.489527  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4236  glycosy hydrolase family protein  28.89 
 
 		 374 aa  89.7  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1806  glycosyl hydrolase family 88  28.57 
 
 		 378 aa  87.4  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2540  glycosyl hydrolase family 88  25.13 
 
 		 402 aa  87  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2882  glycosyl hydrolase family 88  26.16 
 
 		 392 aa  86.3  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09383  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  27.13 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.318478 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1376  glycosy hydrolase family protein  27.44 
 
 		 823 aa  82.4  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0639822  normal  0.967141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1578  glycosyl hydrolase family 88  25.23 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.998372 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1549  glycosyl hydrolase family 88  29.17 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07828  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  28.36 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.091215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5981  di-transpoly-cis-decaprenylcistransferase  23.35 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>