65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0713 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0713  glycosyl hydrolase family 88  100 
 
 		 362 aa  739    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0661  glycosyl hydrolase family 88  87.91 
 
 		 369 aa  655    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3524  glycosyl hydrolase family 88  81.27 
 
 		 368 aa  593  1e-168  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3673  glycosyl hydrolase family 88  80.72 
 
 		 368 aa  588  1e-167  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5078  glycosyl hydrolase family 88  56.14 
 
 		 364 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.958101  normal  0.117982 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5358  glycosyl hydrolase family 88  55.56 
 
 		 364 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.622605  normal  0.178388 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5758  hypothetical protein  55.85 
 
 		 364 aa  373  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.489527  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3783  glycosyl hydrolase family 88  44.62 
 
 		 363 aa  287  2e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0820  glycosyl hydrolase family 88  44.34 
 
 		 379 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0854  glycosyl hydrolase family 88  43.37 
 
 		 379 aa  279  5e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3379  glycosyl hydrolase family 88  42.39 
 
 		 379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3541  glycosyl hydrolase family 88  42.07 
 
 		 379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.591399  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0846  hypothetical protein  41.75 
 
 		 374 aa  265  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1335  glycosyl hydrolase, family 88  39.27 
 
 		 379 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103644 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2071  glycosyl hydrolase, family 88  38.98 
 
 		 379 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000233336 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1211  glycosyl hydrolase, family 88  38.98 
 
 		 379 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2066  glycosyl hydrolase, family 88  38.98 
 
 		 379 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.0470712 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2126  glycosyl hydrolase, family 88  38.98 
 
 		 379 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000763601 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2443  glycosy hydrolase family protein  40.78 
 
 		 379 aa  260  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4039  glycosyl hydrolase family 88  40.73 
 
 		 346 aa  251  1e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03196  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  40.26 
 
 		 370 aa  232  9e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.389014 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08260  conserved hypothetical protein  40.26 
 
 		 458 aa  188  1e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.632375  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1919  glycosy hydrolase family protein  31.53 
 
 		 345 aa  158  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3108  glycosyl hydrolase family 88  33.65 
 
 		 574 aa  116  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285148  normal  0.618959 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0449  glycosyl hydrolase family 88  25.81 
 
 		 410 aa  103  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4685  glycosyl hydrolase family 88  28.99 
 
 		 349 aa  96.3  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.558962  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0456  glycosyl hydrolase family 88  30.58 
 
 		 462 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2470  glycosyl hydrolase family 88  32.23 
 
 		 393 aa  90.1  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2882  glycosyl hydrolase family 88  29.39 
 
 		 392 aa  85.5  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1344  glycosy hydrolase family protein  30 
 
 		 473 aa  77.4  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0696  glycosyl hydrolase family 88  22.36 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1360  glycosy hydrolase family protein  28.96 
 
 		 753 aa  74.3  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576113  normal  0.691294 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5387  glycosyl hydrolase family 88  27.18 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0230208 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1750  glycosy hydrolase family protein  23.91 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1549  glycosyl hydrolase family 88  28.79 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2741  glycosyl hydrolase family 88  27 
 
 		 639 aa  69.7  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.578666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4252  glycosy hydrolase family protein  23.15 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239169  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0951  DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit  27.84 
 
 		 827 aa  67.8  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607652  hitchhiker  0.00000495983 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  32.42 
 
 		 865 aa  67.4  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0863  glycosyl hydrolase family 88  31 
 
 		 744 aa  67.8  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2381  glycosyl hydrolase family 88  26.32 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5409  glycosyl hydrolase family 88  26.67 
 
 		 376 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000034973  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5505  glycosyl hydrolase family 88  28.3 
 
 		 629 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0777464  hitchhiker  0.00601524 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0962  glycosy hydrolase family protein  26.89 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4250  glycosy hydrolase family protein  23.85 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.478117  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4251  glycosy hydrolase family protein  24.04 
 
 		 401 aa  63.2  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166912  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3978  glycosyl hydrolase family 88  28.12 
 
 		 368 aa  61.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.380372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0452  glycosyl hydrolase family 88  25.22 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1024  glycosyl hydrolase family 88  27.36 
 
 		 644 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2306  glycosyl hydrolase family 88  23.61 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.375805  normal  0.0432907 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2841  glycosyl hydrolase family 88  26.79 
 
 		 612 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.137267  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2294  glycosyl hydrolase family 88  25.17 
 
 		 433 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  hitchhiker  0.00963008 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2704  glycosy hydrolase family protein  26.61 
 
 		 358 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.592912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0933  glycosy hydrolase family protein  26.29 
 
 		 352 aa  53.9  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0986  glycosy hydrolase family protein  26.29 
 
 		 352 aa  53.9  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3368  glycosy hydrolase family protein  26.29 
 
 		 352 aa  53.5  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.65377 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3946  hypothetical protein  27.13 
 
 		 389 aa  52.8  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0203  glycosy hydrolase family protein  21.57 
 
 		 375 aa  50.8  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000431819  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4236  glycosy hydrolase family protein  26.35 
 
 		 374 aa  50.1  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1806  glycosyl hydrolase family 88  25.79 
 
 		 378 aa  49.7  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2300  glycosyl hydrolase family 88  28.44 
 
 		 363 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00753245  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1289  glycosyl hydrolase family 88  28.04 
 
 		 372 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09383  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  28.26 
 
 		 378 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.318478 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06720  expressed protein  24.42 
 
 		 422 aa  44.7  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2808  hypothetical protein  20.13 
 
 		 402 aa  43.5  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000299929 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>