81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0951 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0951  DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit  100 
 
 		 827 aa  1712    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607652  hitchhiker  0.00000495983 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2470  glycosyl hydrolase family 88  46.07 
 
 		 393 aa  332  2e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  43.6 
 
 		 865 aa  322  9.999999999999999e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4250  glycosy hydrolase family protein  43.58 
 
 		 397 aa  317  4e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.478117  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5505  glycosyl hydrolase family 88  45.35 
 
 		 629 aa  313  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0777464  hitchhiker  0.00601524 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2381  glycosyl hydrolase family 88  46.82 
 
 		 373 aa  310  5e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2841  glycosyl hydrolase family 88  44.07 
 
 		 612 aa  304  5.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.137267  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4251  glycosy hydrolase family protein  39.15 
 
 		 401 aa  301  4e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166912  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1024  glycosyl hydrolase family 88  40.26 
 
 		 644 aa  295  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2741  glycosyl hydrolase family 88  42.73 
 
 		 639 aa  293  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.578666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4252  glycosy hydrolase family protein  37.32 
 
 		 399 aa  273  1e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239169  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0203  glycosy hydrolase family protein  39.05 
 
 		 375 aa  249  1e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000431819  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0696  glycosyl hydrolase family 88  39.16 
 
 		 362 aa  245  3e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1281  hypothetical protein  36.39 
 
 		 416 aa  233  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000210096  normal  0.378196 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2540  glycosyl hydrolase family 88  37.17 
 
 		 402 aa  228  3e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5981  di-transpoly-cis-decaprenylcistransferase  34.41 
 
 		 371 aa  209  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09383  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  36.6 
 
 		 378 aa  207  6e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.318478 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07828  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  36.07 
 
 		 383 aa  207  9e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.091215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5387  glycosyl hydrolase family 88  36.16 
 
 		 391 aa  187  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0230208 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2808  hypothetical protein  35.27 
 
 		 402 aa  174  5.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000299929 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10505  cell wall glycosyl hydrolase YteR, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14630)  33.1 
 
 		 367 aa  153  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.841717 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3108  glycosyl hydrolase family 88  28.16 
 
 		 574 aa  117  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285148  normal  0.618959 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0449  glycosyl hydrolase family 88  28.24 
 
 		 410 aa  108  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4685  glycosyl hydrolase family 88  32.26 
 
 		 349 aa  107  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.558962  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2882  glycosyl hydrolase family 88  26.92 
 
 		 392 aa  103  9e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4229  hypothetical protein  26.16 
 
 		 429 aa  102  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5078  glycosyl hydrolase family 88  29.64 
 
 		 364 aa  100  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.958101  normal  0.117982 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3379  glycosyl hydrolase family 88  28.63 
 
 		 379 aa  99  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3541  glycosyl hydrolase family 88  29.03 
 
 		 379 aa  99  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.591399  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0456  glycosyl hydrolase family 88  29.84 
 
 		 462 aa  98.6  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2126  glycosyl hydrolase, family 88  27.11 
 
 		 379 aa  97.8  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000763601 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1211  glycosyl hydrolase, family 88  27.11 
 
 		 379 aa  97.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2071  glycosyl hydrolase, family 88  27.11 
 
 		 379 aa  97.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000233336 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2066  glycosyl hydrolase, family 88  27.11 
 
 		 379 aa  96.3  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.0470712 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0846  hypothetical protein  29.96 
 
 		 374 aa  95.5  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3783  glycosyl hydrolase family 88  29.15 
 
 		 363 aa  95.1  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1335  glycosyl hydrolase, family 88  26.76 
 
 		 379 aa  94.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103644 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5358  glycosyl hydrolase family 88  28.46 
 
 		 364 aa  94.4  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.622605  normal  0.178388 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2443  glycosy hydrolase family protein  26.59 
 
 		 379 aa  94  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0854  glycosyl hydrolase family 88  28.09 
 
 		 379 aa  92  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0820  glycosyl hydrolase family 88  27.23 
 
 		 379 aa  90.1  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4039  glycosyl hydrolase family 88  27.07 
 
 		 346 aa  87.8  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1360  glycosy hydrolase family protein  27 
 
 		 753 aa  86.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576113  normal  0.691294 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03196  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  27.17 
 
 		 370 aa  86.7  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.389014 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2469  Pectinesterase  25.3 
 
 		 746 aa  85.1  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.151342  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1344  glycosy hydrolase family protein  28.3 
 
 		 473 aa  83.6  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5758  hypothetical protein  25.1 
 
 		 364 aa  82.8  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.489527  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1549  glycosyl hydrolase family 88  28.91 
 
 		 345 aa  79.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4265  hypothetical protein  27.27 
 
 		 430 aa  78.6  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3673  glycosyl hydrolase family 88  31.25 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1750  glycosy hydrolase family protein  27.8 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3524  glycosyl hydrolase family 88  30.77 
 
 		 368 aa  77.4  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0661  glycosyl hydrolase family 88  28.97 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2943  hypothetical protein  27.82 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08260  conserved hypothetical protein  27 
 
 		 458 aa  69.7  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.632375  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3978  glycosyl hydrolase family 88  28.21 
 
 		 368 aa  70.1  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.380372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0452  glycosyl hydrolase family 88  27 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2294  glycosyl hydrolase family 88  26.03 
 
 		 433 aa  69.3  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  hitchhiker  0.00963008 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4236  glycosy hydrolase family protein  27.92 
 
 		 374 aa  68.9  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5409  glycosyl hydrolase family 88  25.32 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000034973  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0713  glycosyl hydrolase family 88  27.84 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0863  glycosyl hydrolase family 88  25.57 
 
 		 744 aa  67.8  0.0000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1282  hypothetical protein  26.4 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000326624  normal  0.558668 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0986  glycosy hydrolase family protein  28.57 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0933  glycosy hydrolase family protein  28.57 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3368  glycosy hydrolase family protein  28.57 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.65377 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2306  glycosyl hydrolase family 88  22.38 
 
 		 386 aa  62.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.375805  normal  0.0432907 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3122  hypothetical protein  25.23 
 
 		 283 aa  63.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2704  glycosy hydrolase family protein  24.55 
 
 		 358 aa  62  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.592912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1289  glycosyl hydrolase family 88  25.82 
 
 		 372 aa  61.2  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1919  glycosy hydrolase family protein  23.39 
 
 		 345 aa  60.5  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0962  glycosy hydrolase family protein  25.2 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1806  glycosyl hydrolase family 88  28.46 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6826  hypothetical protein  24.15 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2300  glycosyl hydrolase family 88  28.88 
 
 		 363 aa  55.5  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00753245  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1578  glycosyl hydrolase family 88  26.92 
 
 		 379 aa  54.3  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.998372 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3946  hypothetical protein  25.77 
 
 		 389 aa  54.7  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06720  expressed protein  31.03 
 
 		 422 aa  53.9  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1376  glycosy hydrolase family protein  23.46 
 
 		 823 aa  52.4  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0639822  normal  0.967141 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2117  glycosyl hydrolase family 88  23.12 
 
 		 623 aa  47  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4187  hypothetical protein  24.83 
 
 		 389 aa  46.6  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>