73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0863 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0863  glycosyl hydrolase family 88  100 
 
 		 744 aa  1532    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0962  glycosy hydrolase family protein  44.41 
 
 		 369 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2294  glycosyl hydrolase family 88  39.02 
 
 		 433 aa  275  3e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  hitchhiker  0.00963008 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1282  hypothetical protein  39.37 
 
 		 427 aa  271  4e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000326624  normal  0.558668 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1289  glycosyl hydrolase family 88  39.95 
 
 		 372 aa  269  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3978  glycosyl hydrolase family 88  42.82 
 
 		 368 aa  262  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.380372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1376  glycosy hydrolase family protein  38.96 
 
 		 823 aa  244  5e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0639822  normal  0.967141 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3946  hypothetical protein  40.19 
 
 		 389 aa  239  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2306  glycosyl hydrolase family 88  37.54 
 
 		 386 aa  234  5e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.375805  normal  0.0432907 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2300  glycosyl hydrolase family 88  35.8 
 
 		 363 aa  231  4e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00753245  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4265  hypothetical protein  37.5 
 
 		 430 aa  219  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4187  hypothetical protein  33.59 
 
 		 389 aa  204  6e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155794  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3368  glycosy hydrolase family protein  36.42 
 
 		 352 aa  191  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.65377 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0933  glycosy hydrolase family protein  36.42 
 
 		 352 aa  191  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0986  glycosy hydrolase family protein  36.42 
 
 		 352 aa  191  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2943  hypothetical protein  32.48 
 
 		 378 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1806  glycosyl hydrolase family 88  35.45 
 
 		 378 aa  168  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2469  Pectinesterase  33.07 
 
 		 746 aa  167  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.151342  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4236  glycosy hydrolase family protein  30.89 
 
 		 374 aa  161  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6826  hypothetical protein  29.59 
 
 		 379 aa  159  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1578  glycosyl hydrolase family 88  31.95 
 
 		 379 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.998372 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2117  glycosyl hydrolase family 88  34.82 
 
 		 623 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0449  glycosyl hydrolase family 88  29.73 
 
 		 410 aa  97.8  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0456  glycosyl hydrolase family 88  29.65 
 
 		 462 aa  94.7  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5409  glycosyl hydrolase family 88  28.33 
 
 		 376 aa  85.9  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000034973  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1344  glycosy hydrolase family protein  28.9 
 
 		 473 aa  84  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1360  glycosy hydrolase family protein  28.76 
 
 		 753 aa  80.9  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576113  normal  0.691294 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0846  hypothetical protein  30.45 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3541  glycosyl hydrolase family 88  29.7 
 
 		 379 aa  75.1  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.591399  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0661  glycosyl hydrolase family 88  32.32 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2126  glycosyl hydrolase, family 88  29.02 
 
 		 379 aa  75.1  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000763601 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2443  glycosy hydrolase family protein  30.65 
 
 		 379 aa  74.3  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1211  glycosyl hydrolase, family 88  29.02 
 
 		 379 aa  74.3  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2071  glycosyl hydrolase, family 88  29.02 
 
 		 379 aa  74.3  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000233336 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03196  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  28.93 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.389014 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5758  hypothetical protein  28.41 
 
 		 364 aa  73.9  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.489527  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3379  glycosyl hydrolase family 88  29.21 
 
 		 379 aa  73.9  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2470  glycosyl hydrolase family 88  26.27 
 
 		 393 aa  73.6  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1335  glycosyl hydrolase, family 88  29.02 
 
 		 379 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103644 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2066  glycosyl hydrolase, family 88  29.02 
 
 		 379 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.0470712 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3108  glycosyl hydrolase family 88  26.57 
 
 		 574 aa  72  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285148  normal  0.618959 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3783  glycosyl hydrolase family 88  27.78 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5505  glycosyl hydrolase family 88  26.01 
 
 		 629 aa  70.9  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0777464  hitchhiker  0.00601524 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0820  glycosyl hydrolase family 88  29.21 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2704  glycosy hydrolase family protein  29.83 
 
 		 358 aa  70.5  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.592912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1281  hypothetical protein  22.17 
 
 		 416 aa  69.7  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000210096  normal  0.378196 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4039  glycosyl hydrolase family 88  25.94 
 
 		 346 aa  68.9  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4252  glycosy hydrolase family protein  25.46 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239169  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0854  glycosyl hydrolase family 88  29.21 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0951  DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit  25.57 
 
 		 827 aa  67.8  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607652  hitchhiker  0.00000495983 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0713  glycosyl hydrolase family 88  31 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0452  glycosyl hydrolase family 88  25.89 
 
 		 381 aa  67.4  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5358  glycosyl hydrolase family 88  27.36 
 
 		 364 aa  66.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.622605  normal  0.178388 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5078  glycosyl hydrolase family 88  26.87 
 
 		 364 aa  64.7  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.958101  normal  0.117982 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4685  glycosyl hydrolase family 88  29.17 
 
 		 349 aa  63.5  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.558962  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4250  glycosy hydrolase family protein  25.23 
 
 		 397 aa  63.5  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.478117  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2540  glycosyl hydrolase family 88  26.04 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2741  glycosyl hydrolase family 88  22.45 
 
 		 639 aa  63.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.578666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3524  glycosyl hydrolase family 88  30 
 
 		 368 aa  61.6  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4251  glycosy hydrolase family protein  24.68 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166912  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09383  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  26.67 
 
 		 378 aa  59.7  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.318478 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3673  glycosyl hydrolase family 88  30 
 
 		 368 aa  59.3  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2808  hypothetical protein  26.79 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000299929 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0696  glycosyl hydrolase family 88  22.84 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1024  glycosyl hydrolase family 88  24.11 
 
 		 644 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2882  glycosyl hydrolase family 88  22.46 
 
 		 392 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  21.29 
 
 		 865 aa  53.9  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07828  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  24.39 
 
 		 383 aa  52  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.091215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2841  glycosyl hydrolase family 88  25.32 
 
 		 612 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.137267  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1750  glycosy hydrolase family protein  22.03 
 
 		 319 aa  48.5  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5387  glycosyl hydrolase family 88  26.8 
 
 		 391 aa  47.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0230208 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0203  glycosy hydrolase family protein  23.21 
 
 		 375 aa  47  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000431819  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2381  glycosyl hydrolase family 88  20.96 
 
 		 373 aa  47  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>