73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0203 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0203  glycosy hydrolase family protein  100 
 
 		 375 aa  773    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000431819  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0696  glycosyl hydrolase family 88  50 
 
 		 362 aa  353  2e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2841  glycosyl hydrolase family 88  46.65 
 
 		 612 aa  316  4e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.137267  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4250  glycosy hydrolase family protein  44.25 
 
 		 397 aa  307  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.478117  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5505  glycosyl hydrolase family 88  43.5 
 
 		 629 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0777464  hitchhiker  0.00601524 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1024  glycosyl hydrolase family 88  44.03 
 
 		 644 aa  305  6e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2741  glycosyl hydrolase family 88  45.13 
 
 		 639 aa  305  7e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.578666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2381  glycosyl hydrolase family 88  45.22 
 
 		 373 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4251  glycosy hydrolase family protein  42.77 
 
 		 401 aa  302  6.000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166912  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2470  glycosyl hydrolase family 88  41.6 
 
 		 393 aa  300  2e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2540  glycosyl hydrolase family 88  43.64 
 
 		 402 aa  283  4.0000000000000003e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4252  glycosy hydrolase family protein  40.46 
 
 		 399 aa  280  4e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239169  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0951  DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit  39.05 
 
 		 827 aa  249  5e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607652  hitchhiker  0.00000495983 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  36.54 
 
 		 865 aa  249  5e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09383  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  36.89 
 
 		 378 aa  226  5.0000000000000005e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.318478 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5981  di-transpoly-cis-decaprenylcistransferase  35.38 
 
 		 371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07828  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  34.92 
 
 		 383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.091215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5387  glycosyl hydrolase family 88  32.16 
 
 		 391 aa  170  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0230208 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10505  cell wall glycosyl hydrolase YteR, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14630)  31.97 
 
 		 367 aa  162  9e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.841717 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2808  hypothetical protein  28.66 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000299929 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3108  glycosyl hydrolase family 88  28.06 
 
 		 574 aa  123  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285148  normal  0.618959 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2882  glycosyl hydrolase family 88  25.56 
 
 		 392 aa  113  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0449  glycosyl hydrolase family 88  25.68 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4685  glycosyl hydrolase family 88  26.88 
 
 		 349 aa  94  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.558962  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0456  glycosyl hydrolase family 88  29.18 
 
 		 462 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0854  glycosyl hydrolase family 88  23.84 
 
 		 379 aa  87.8  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0820  glycosyl hydrolase family 88  24.42 
 
 		 379 aa  87.4  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3379  glycosyl hydrolase family 88  24.41 
 
 		 379 aa  86.3  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4039  glycosyl hydrolase family 88  25.26 
 
 		 346 aa  82.8  0.000000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3541  glycosyl hydrolase family 88  24.38 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.591399  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0846  hypothetical protein  23.84 
 
 		 374 aa  80.9  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1344  glycosy hydrolase family protein  24.48 
 
 		 473 aa  79  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1360  glycosy hydrolase family protein  25.27 
 
 		 753 aa  78.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576113  normal  0.691294 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03196  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  23.83 
 
 		 370 aa  77.4  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.389014 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3783  glycosyl hydrolase family 88  24.91 
 
 		 363 aa  77.4  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2126  glycosyl hydrolase, family 88  23.98 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000763601 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1211  glycosyl hydrolase, family 88  23.98 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2066  glycosyl hydrolase, family 88  23.98 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.0470712 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2443  glycosy hydrolase family protein  22.89 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1335  glycosyl hydrolase, family 88  23.68 
 
 		 379 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103644 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2071  glycosyl hydrolase, family 88  23.68 
 
 		 379 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000233336 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5758  hypothetical protein  25.82 
 
 		 364 aa  74.3  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.489527  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5358  glycosyl hydrolase family 88  26.37 
 
 		 364 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.622605  normal  0.178388 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1806  glycosyl hydrolase family 88  25.07 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1549  glycosyl hydrolase family 88  25.6 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5078  glycosyl hydrolase family 88  24.88 
 
 		 364 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.958101  normal  0.117982 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0933  glycosy hydrolase family protein  24.89 
 
 		 352 aa  67  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0986  glycosy hydrolase family protein  24.89 
 
 		 352 aa  67  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3368  glycosy hydrolase family protein  24.89 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.65377 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1919  glycosy hydrolase family protein  19.39 
 
 		 345 aa  66.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0962  glycosy hydrolase family protein  22.56 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0452  glycosyl hydrolase family 88  26.28 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2737  glycosy hydrolase family protein  31.29 
 
 		 294 aa  62.4  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.72818  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5409  glycosyl hydrolase family 88  26.32 
 
 		 376 aa  60.1  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000034973  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08260  conserved hypothetical protein  24.76 
 
 		 458 aa  59.3  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.632375  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1578  glycosyl hydrolase family 88  23.68 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.998372 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3946  hypothetical protein  24.05 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1289  glycosyl hydrolase family 88  23.5 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4236  glycosy hydrolase family protein  24.09 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0661  glycosyl hydrolase family 88  23.53 
 
 		 369 aa  57  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3978  glycosyl hydrolase family 88  26.27 
 
 		 368 aa  57  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.380372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3524  glycosyl hydrolase family 88  25.14 
 
 		 368 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1750  glycosy hydrolase family protein  22.08 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3673  glycosyl hydrolase family 88  24.23 
 
 		 368 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2300  glycosyl hydrolase family 88  23.55 
 
 		 363 aa  53.5  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00753245  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2294  glycosyl hydrolase family 88  21.67 
 
 		 433 aa  52.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  hitchhiker  0.00963008 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2117  glycosyl hydrolase family 88  23.67 
 
 		 623 aa  51.6  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0713  glycosyl hydrolase family 88  21.57 
 
 		 362 aa  50.8  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2704  glycosy hydrolase family protein  23.08 
 
 		 358 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.592912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2306  glycosyl hydrolase family 88  23.26 
 
 		 386 aa  47  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.375805  normal  0.0432907 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0863  glycosyl hydrolase family 88  21.99 
 
 		 744 aa  47  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1282  hypothetical protein  24.47 
 
 		 427 aa  46.2  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000326624  normal  0.558668 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1376  glycosy hydrolase family protein  23.28 
 
 		 823 aa  43.9  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0639822  normal  0.967141 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>