63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5387 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5387  glycosyl hydrolase family 88  100 
 
 		 391 aa  804    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0230208 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2741  glycosyl hydrolase family 88  36.01 
 
 		 639 aa  239  5e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.578666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5505  glycosyl hydrolase family 88  38.01 
 
 		 629 aa  232  8.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0777464  hitchhiker  0.00601524 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2470  glycosyl hydrolase family 88  34.81 
 
 		 393 aa  231  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2381  glycosyl hydrolase family 88  35.54 
 
 		 373 aa  225  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2841  glycosyl hydrolase family 88  37.98 
 
 		 612 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.137267  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4250  glycosy hydrolase family protein  35.28 
 
 		 397 aa  216  8e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.478117  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4251  glycosy hydrolase family protein  31.33 
 
 		 401 aa  209  6e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166912  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1024  glycosyl hydrolase family 88  35.95 
 
 		 644 aa  209  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4252  glycosy hydrolase family protein  34.02 
 
 		 399 aa  190  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239169  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  31.6 
 
 		 865 aa  188  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0951  DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit  36.67 
 
 		 827 aa  188  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607652  hitchhiker  0.00000495983 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2808  hypothetical protein  31.37 
 
 		 402 aa  183  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000299929 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2540  glycosyl hydrolase family 88  33.6 
 
 		 402 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0203  glycosy hydrolase family protein  31.07 
 
 		 375 aa  170  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000431819  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0696  glycosyl hydrolase family 88  30.79 
 
 		 362 aa  170  5e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09383  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  34.59 
 
 		 378 aa  165  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.318478 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5981  di-transpoly-cis-decaprenylcistransferase  29.83 
 
 		 371 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07828  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  31.44 
 
 		 383 aa  145  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.091215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0449  glycosyl hydrolase family 88  33.74 
 
 		 410 aa  129  8.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2882  glycosyl hydrolase family 88  25.63 
 
 		 392 aa  123  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5409  glycosyl hydrolase family 88  26.36 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000034973  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2126  glycosyl hydrolase, family 88  29.3 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000763601 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3541  glycosyl hydrolase family 88  29.17 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.591399  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1335  glycosyl hydrolase, family 88  29.39 
 
 		 379 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103644 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3379  glycosyl hydrolase family 88  29.17 
 
 		 379 aa  105  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0820  glycosyl hydrolase family 88  30.45 
 
 		 379 aa  105  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1211  glycosyl hydrolase, family 88  28.98 
 
 		 379 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2071  glycosyl hydrolase, family 88  28.98 
 
 		 379 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000233336 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2066  glycosyl hydrolase, family 88  29.07 
 
 		 379 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.0470712 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0854  glycosyl hydrolase family 88  29.49 
 
 		 379 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0452  glycosyl hydrolase family 88  23.89 
 
 		 381 aa  99  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0456  glycosyl hydrolase family 88  31.85 
 
 		 462 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0846  hypothetical protein  28.53 
 
 		 374 aa  97.1  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1360  glycosy hydrolase family protein  31.6 
 
 		 753 aa  96.3  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576113  normal  0.691294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3108  glycosyl hydrolase family 88  28.81 
 
 		 574 aa  95.5  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285148  normal  0.618959 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03196  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  27.94 
 
 		 370 aa  93.2  6e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.389014 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10505  cell wall glycosyl hydrolase YteR, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14630)  28.57 
 
 		 367 aa  92  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.841717 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4685  glycosyl hydrolase family 88  31.25 
 
 		 349 aa  90.1  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.558962  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2443  glycosy hydrolase family protein  27.36 
 
 		 379 aa  90.1  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1344  glycosy hydrolase family protein  28.98 
 
 		 473 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5078  glycosyl hydrolase family 88  27.46 
 
 		 364 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.958101  normal  0.117982 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3783  glycosyl hydrolase family 88  27.04 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4039  glycosyl hydrolase family 88  27.3 
 
 		 346 aa  79.3  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5358  glycosyl hydrolase family 88  26.55 
 
 		 364 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.622605  normal  0.178388 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0661  glycosyl hydrolase family 88  27.18 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0713  glycosyl hydrolase family 88  27.18 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3673  glycosyl hydrolase family 88  27.27 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1549  glycosyl hydrolase family 88  31.25 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1750  glycosy hydrolase family protein  22.57 
 
 		 319 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2704  glycosy hydrolase family protein  23.41 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.592912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3524  glycosyl hydrolase family 88  26.52 
 
 		 368 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5758  hypothetical protein  26.62 
 
 		 364 aa  66.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.489527  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1919  glycosy hydrolase family protein  25.71 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1578  glycosyl hydrolase family 88  22.03 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.998372 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2300  glycosyl hydrolase family 88  23.55 
 
 		 363 aa  51.2  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00753245  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1289  glycosyl hydrolase family 88  23.55 
 
 		 372 aa  50.1  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0962  glycosy hydrolase family protein  25.16 
 
 		 369 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06720  expressed protein  40.23 
 
 		 422 aa  48.9  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0863  glycosyl hydrolase family 88  26.8 
 
 		 744 aa  47  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1806  glycosyl hydrolase family 88  21.55 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2737  glycosy hydrolase family protein  23.98 
 
 		 294 aa  44.3  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.72818  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4236  glycosy hydrolase family protein  23.46 
 
 		 374 aa  43.1  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>