57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5981 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5981  di-transpoly-cis-decaprenylcistransferase  100 
 
 		 371 aa  755    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2381  glycosyl hydrolase family 88  39.13 
 
 		 373 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0696  glycosyl hydrolase family 88  38.26 
 
 		 362 aa  246  6.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2841  glycosyl hydrolase family 88  38.97 
 
 		 612 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.137267  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2470  glycosyl hydrolase family 88  38.95 
 
 		 393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5505  glycosyl hydrolase family 88  38.11 
 
 		 629 aa  239  5e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0777464  hitchhiker  0.00601524 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2741  glycosyl hydrolase family 88  38.15 
 
 		 639 aa  237  3e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.578666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1024  glycosyl hydrolase family 88  37.68 
 
 		 644 aa  229  7e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0203  glycosy hydrolase family protein  35.38 
 
 		 375 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000431819  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4251  glycosy hydrolase family protein  34.12 
 
 		 401 aa  216  5e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166912  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0951  DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit  34.41 
 
 		 827 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607652  hitchhiker  0.00000495983 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2540  glycosyl hydrolase family 88  39.94 
 
 		 402 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4250  glycosy hydrolase family protein  35.36 
 
 		 397 aa  206  6e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.478117  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  34.33 
 
 		 865 aa  204  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4252  glycosy hydrolase family protein  30.65 
 
 		 399 aa  193  5e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239169  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09383  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  32.27 
 
 		 378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.318478 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5387  glycosyl hydrolase family 88  30.31 
 
 		 391 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0230208 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07828  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  29.28 
 
 		 383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.091215  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10505  cell wall glycosyl hydrolase YteR, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14630)  29.72 
 
 		 367 aa  124  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.841717 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2808  hypothetical protein  27.3 
 
 		 402 aa  110  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000299929 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1344  glycosy hydrolase family protein  27.86 
 
 		 473 aa  91.3  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2882  glycosyl hydrolase family 88  25.09 
 
 		 392 aa  89.4  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0456  glycosyl hydrolase family 88  24.79 
 
 		 462 aa  87  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3379  glycosyl hydrolase family 88  26.83 
 
 		 379 aa  86.3  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3541  glycosyl hydrolase family 88  26.52 
 
 		 379 aa  84.7  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.591399  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1549  glycosyl hydrolase family 88  27.69 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0820  glycosyl hydrolase family 88  27.4 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4039  glycosyl hydrolase family 88  25.25 
 
 		 346 aa  80.9  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03196  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  26.6 
 
 		 370 aa  80.1  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.389014 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0854  glycosyl hydrolase family 88  27.17 
 
 		 379 aa  79.3  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0452  glycosyl hydrolase family 88  21.84 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5409  glycosyl hydrolase family 88  23.12 
 
 		 376 aa  76.3  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000034973  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2066  glycosyl hydrolase, family 88  26.06 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.0470712 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3108  glycosyl hydrolase family 88  23.31 
 
 		 574 aa  73.6  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285148  normal  0.618959 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1335  glycosyl hydrolase, family 88  26.06 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103644 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2071  glycosyl hydrolase, family 88  25.7 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000233336 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2126  glycosyl hydrolase, family 88  25.7 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000763601 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1211  glycosyl hydrolase, family 88  25.7 
 
 		 379 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0449  glycosyl hydrolase family 88  23.35 
 
 		 410 aa  72  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2443  glycosy hydrolase family protein  29.47 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4685  glycosyl hydrolase family 88  28.85 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.558962  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5758  hypothetical protein  24.73 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.489527  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1360  glycosy hydrolase family protein  27.27 
 
 		 753 aa  67  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576113  normal  0.691294 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5358  glycosyl hydrolase family 88  26.61 
 
 		 364 aa  66.6  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.622605  normal  0.178388 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5078  glycosyl hydrolase family 88  29.94 
 
 		 364 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.958101  normal  0.117982 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3783  glycosyl hydrolase family 88  23.55 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1919  glycosy hydrolase family protein  22.99 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2704  glycosy hydrolase family protein  25 
 
 		 358 aa  59.3  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.592912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0846  hypothetical protein  30.13 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3524  glycosyl hydrolase family 88  26.52 
 
 		 368 aa  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3673  glycosyl hydrolase family 88  25.65 
 
 		 368 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2300  glycosyl hydrolase family 88  22.83 
 
 		 363 aa  50.8  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00753245  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1289  glycosyl hydrolase family 88  23.6 
 
 		 372 aa  49.7  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1806  glycosyl hydrolase family 88  23.21 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3946  hypothetical protein  22.66 
 
 		 389 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3978  glycosyl hydrolase family 88  21.03 
 
 		 368 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.380372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0661  glycosyl hydrolase family 88  23.34 
 
 		 369 aa  43.5  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>