56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2540 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2540  glycosyl hydrolase family 88  100 
 
 		 402 aa  817    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2381  glycosyl hydrolase family 88  46.37 
 
 		 373 aa  318  2e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2841  glycosyl hydrolase family 88  44.41 
 
 		 612 aa  312  7.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.137267  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2741  glycosyl hydrolase family 88  42.55 
 
 		 639 aa  311  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.578666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2470  glycosyl hydrolase family 88  44.41 
 
 		 393 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4251  glycosy hydrolase family protein  39.21 
 
 		 401 aa  296  3e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166912  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5505  glycosyl hydrolase family 88  42.82 
 
 		 629 aa  291  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0777464  hitchhiker  0.00601524 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1024  glycosyl hydrolase family 88  39.53 
 
 		 644 aa  290  4e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0203  glycosy hydrolase family protein  43.64 
 
 		 375 aa  283  5.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000431819  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4250  glycosy hydrolase family protein  40.79 
 
 		 397 aa  283  6.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.478117  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  36.63 
 
 		 865 aa  250  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0696  glycosyl hydrolase family 88  37.39 
 
 		 362 aa  251  2e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4252  glycosy hydrolase family protein  34.7 
 
 		 399 aa  241  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239169  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0951  DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit  37.17 
 
 		 827 aa  228  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607652  hitchhiker  0.00000495983 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09383  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  36.76 
 
 		 378 aa  220  3.9999999999999997e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.318478 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07828  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  36.81 
 
 		 383 aa  211  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.091215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5981  di-transpoly-cis-decaprenylcistransferase  39.94 
 
 		 371 aa  209  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5387  glycosyl hydrolase family 88  33.6 
 
 		 391 aa  181  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0230208 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2808  hypothetical protein  32.7 
 
 		 402 aa  160  5e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000299929 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10505  cell wall glycosyl hydrolase YteR, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14630)  32.99 
 
 		 367 aa  139  7e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.841717 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2882  glycosyl hydrolase family 88  23.99 
 
 		 392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1344  glycosy hydrolase family protein  29.01 
 
 		 473 aa  99  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3108  glycosyl hydrolase family 88  28.42 
 
 		 574 aa  90.5  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285148  normal  0.618959 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0449  glycosyl hydrolase family 88  25.13 
 
 		 410 aa  87  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5409  glycosyl hydrolase family 88  26.32 
 
 		 376 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000034973  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0452  glycosyl hydrolase family 88  25.34 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1360  glycosy hydrolase family protein  25.53 
 
 		 753 aa  81.3  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576113  normal  0.691294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0456  glycosyl hydrolase family 88  25.56 
 
 		 462 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4685  glycosyl hydrolase family 88  28.86 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.558962  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0863  glycosyl hydrolase family 88  26.04 
 
 		 744 aa  62.4  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2300  glycosyl hydrolase family 88  23.9 
 
 		 363 aa  59.3  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00753245  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1919  glycosy hydrolase family protein  25.55 
 
 		 345 aa  59.3  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2704  glycosy hydrolase family protein  26.16 
 
 		 358 aa  58.9  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.592912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1549  glycosyl hydrolase family 88  27.27 
 
 		 345 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2294  glycosyl hydrolase family 88  22.7 
 
 		 433 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  hitchhiker  0.00963008 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4236  glycosy hydrolase family protein  22.56 
 
 		 374 aa  53.5  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4039  glycosyl hydrolase family 88  22.46 
 
 		 346 aa  51.2  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3978  glycosyl hydrolase family 88  22.46 
 
 		 368 aa  50.8  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.380372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3541  glycosyl hydrolase family 88  25.37 
 
 		 379 aa  50.8  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.591399  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2071  glycosyl hydrolase, family 88  25.64 
 
 		 379 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000233336 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1211  glycosyl hydrolase, family 88  26.64 
 
 		 379 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0820  glycosyl hydrolase family 88  26.26 
 
 		 379 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1282  hypothetical protein  23.84 
 
 		 427 aa  48.9  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000326624  normal  0.558668 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0962  glycosy hydrolase family protein  24.03 
 
 		 369 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2443  glycosy hydrolase family protein  26.67 
 
 		 379 aa  48.5  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2066  glycosyl hydrolase, family 88  26.74 
 
 		 379 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.0470712 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3379  glycosyl hydrolase family 88  25.82 
 
 		 379 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1289  glycosyl hydrolase family 88  21.74 
 
 		 372 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1806  glycosyl hydrolase family 88  28.65 
 
 		 378 aa  47.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1335  glycosyl hydrolase, family 88  26.37 
 
 		 379 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103644 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2126  glycosyl hydrolase, family 88  26.28 
 
 		 379 aa  46.6  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000763601 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0854  glycosyl hydrolase family 88  25.09 
 
 		 379 aa  46.6  0.0009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03196  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  22.84 
 
 		 370 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.389014 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1376  glycosy hydrolase family protein  24.83 
 
 		 823 aa  44.3  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0639822  normal  0.967141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1578  glycosyl hydrolase family 88  24.58 
 
 		 379 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.998372 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5758  hypothetical protein  25.39 
 
 		 364 aa  44.3  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.489527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>