71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0846 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0846  hypothetical protein  100 
 
 		 374 aa  778    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3541  glycosyl hydrolase family 88  71.62 
 
 		 379 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.591399  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3379  glycosyl hydrolase family 88  71.62 
 
 		 379 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0854  glycosyl hydrolase family 88  71.77 
 
 		 379 aa  574  1.0000000000000001e-162  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0820  glycosyl hydrolase family 88  70.98 
 
 		 379 aa  570  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2126  glycosyl hydrolase, family 88  67.03 
 
 		 379 aa  541  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000763601 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2071  glycosyl hydrolase, family 88  67.03 
 
 		 379 aa  541  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000233336 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1335  glycosyl hydrolase, family 88  66.76 
 
 		 379 aa  538  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103644 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1211  glycosyl hydrolase, family 88  67.03 
 
 		 379 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2066  glycosyl hydrolase, family 88  67.03 
 
 		 379 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.0470712 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2443  glycosy hydrolase family protein  65.95 
 
 		 379 aa  533  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03196  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  63.03 
 
 		 370 aa  460  9.999999999999999e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.389014 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3783  glycosyl hydrolase family 88  59.59 
 
 		 363 aa  449  1e-125  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5358  glycosyl hydrolase family 88  47.27 
 
 		 364 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.622605  normal  0.178388 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5078  glycosyl hydrolase family 88  46.95 
 
 		 364 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.958101  normal  0.117982 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5758  hypothetical protein  44.62 
 
 		 364 aa  292  7e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.489527  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08260  conserved hypothetical protein  41.5 
 
 		 458 aa  290  2e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.632375  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0661  glycosyl hydrolase family 88  44.01 
 
 		 369 aa  279  6e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3673  glycosyl hydrolase family 88  44.16 
 
 		 368 aa  272  5.000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4039  glycosyl hydrolase family 88  42.77 
 
 		 346 aa  272  7e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3524  glycosyl hydrolase family 88  43.85 
 
 		 368 aa  271  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0713  glycosyl hydrolase family 88  41.75 
 
 		 362 aa  265  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1919  glycosy hydrolase family protein  29.02 
 
 		 345 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0449  glycosyl hydrolase family 88  33.62 
 
 		 410 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2470  glycosyl hydrolase family 88  29.87 
 
 		 393 aa  119  9e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4685  glycosyl hydrolase family 88  28.08 
 
 		 349 aa  115  8.999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.558962  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2841  glycosyl hydrolase family 88  27.78 
 
 		 612 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.137267  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3108  glycosyl hydrolase family 88  28.63 
 
 		 574 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285148  normal  0.618959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5505  glycosyl hydrolase family 88  28.77 
 
 		 629 aa  106  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0777464  hitchhiker  0.00601524 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0456  glycosyl hydrolase family 88  30.8 
 
 		 462 aa  106  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1344  glycosy hydrolase family protein  32.03 
 
 		 473 aa  106  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4251  glycosy hydrolase family protein  27.19 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166912  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4250  glycosy hydrolase family protein  25.4 
 
 		 397 aa  104  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.478117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5387  glycosyl hydrolase family 88  28.06 
 
 		 391 aa  96.7  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0230208 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0951  DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit  29.96 
 
 		 827 aa  95.5  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607652  hitchhiker  0.00000495983 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2882  glycosyl hydrolase family 88  27.22 
 
 		 392 aa  95.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1024  glycosyl hydrolase family 88  29.72 
 
 		 644 aa  93.2  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4252  glycosy hydrolase family protein  24.18 
 
 		 399 aa  93.2  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239169  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2741  glycosyl hydrolase family 88  26.15 
 
 		 639 aa  92.8  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.578666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2381  glycosyl hydrolase family 88  25.52 
 
 		 373 aa  92.4  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  28.23 
 
 		 865 aa  89.7  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5409  glycosyl hydrolase family 88  29.13 
 
 		 376 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000034973  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0962  glycosy hydrolase family protein  24.78 
 
 		 369 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2704  glycosy hydrolase family protein  27.46 
 
 		 358 aa  82  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.592912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0203  glycosy hydrolase family protein  23.84 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000431819  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1360  glycosy hydrolase family protein  26.59 
 
 		 753 aa  80.5  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576113  normal  0.691294 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0863  glycosyl hydrolase family 88  30.45 
 
 		 744 aa  77.8  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2808  hypothetical protein  24.18 
 
 		 402 aa  76.3  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000299929 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0933  glycosy hydrolase family protein  30.04 
 
 		 352 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0986  glycosy hydrolase family protein  30.04 
 
 		 352 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3368  glycosy hydrolase family protein  29.6 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.65377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1549  glycosyl hydrolase family 88  29.63 
 
 		 345 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0696  glycosyl hydrolase family 88  22.54 
 
 		 362 aa  71.2  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0452  glycosyl hydrolase family 88  23.1 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09383  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  25.78 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.318478 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3978  glycosyl hydrolase family 88  26.94 
 
 		 368 aa  67.8  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.380372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1289  glycosyl hydrolase family 88  24.16 
 
 		 372 aa  65.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1750  glycosy hydrolase family protein  24.52 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4236  glycosy hydrolase family protein  22.79 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1806  glycosyl hydrolase family 88  25.32 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3946  hypothetical protein  31.55 
 
 		 389 aa  62  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1282  hypothetical protein  24.62 
 
 		 427 aa  59.7  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000326624  normal  0.558668 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2306  glycosyl hydrolase family 88  24.44 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.375805  normal  0.0432907 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1578  glycosyl hydrolase family 88  26.51 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.998372 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2294  glycosyl hydrolase family 88  22.82 
 
 		 433 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  hitchhiker  0.00963008 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5981  di-transpoly-cis-decaprenylcistransferase  30.13 
 
 		 371 aa  53.9  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06720  expressed protein  25.3 
 
 		 422 aa  53.1  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1376  glycosy hydrolase family protein  22.08 
 
 		 823 aa  50.4  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0639822  normal  0.967141 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07828  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  26.56 
 
 		 383 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.091215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2300  glycosyl hydrolase family 88  28.57 
 
 		 363 aa  46.2  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00753245  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2117  glycosyl hydrolase family 88  33.33 
 
 		 623 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>