22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL06720 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006681  CNL06720  expressed protein  100 
 
 		 422 aa  854    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1750  glycosy hydrolase family protein  27.9 
 
 		 319 aa  120  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02080  hypothetical protein  27.75 
 
 		 541 aa  113  5e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.237802  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4685  glycosyl hydrolase family 88  28.63 
 
 		 349 aa  93.2  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.558962  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1549  glycosyl hydrolase family 88  26.92 
 
 		 345 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4039  glycosyl hydrolase family 88  23.81 
 
 		 346 aa  62.4  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2882  glycosyl hydrolase family 88  24.47 
 
 		 392 aa  57  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5358  glycosyl hydrolase family 88  26.92 
 
 		 364 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.622605  normal  0.178388 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3783  glycosyl hydrolase family 88  26.64 
 
 		 363 aa  56.2  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5078  glycosyl hydrolase family 88  25.63 
 
 		 364 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.958101  normal  0.117982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5409  glycosyl hydrolase family 88  21.84 
 
 		 376 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000034973  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0854  glycosyl hydrolase family 88  25.96 
 
 		 379 aa  54.3  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0951  DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit  31.03 
 
 		 827 aa  53.9  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607652  hitchhiker  0.00000495983 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5758  hypothetical protein  23.91 
 
 		 364 aa  53.5  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.489527  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0846  hypothetical protein  25.3 
 
 		 374 aa  52.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0452  glycosyl hydrolase family 88  19.66 
 
 		 381 aa  50.8  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0820  glycosyl hydrolase family 88  25 
 
 		 379 aa  49.7  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5387  glycosyl hydrolase family 88  40.23 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0230208 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2470  glycosyl hydrolase family 88  31.4 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2704  glycosy hydrolase family protein  21 
 
 		 358 aa  47  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.592912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5505  glycosyl hydrolase family 88  27.59 
 
 		 629 aa  46.6  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0777464  hitchhiker  0.00601524 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  27.43 
 
 		 865 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>