72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0854 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0854  glycosyl hydrolase family 88  100 
 
 		 379 aa  791    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3541  glycosyl hydrolase family 88  86.28 
 
 		 379 aa  698    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.591399  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0820  glycosyl hydrolase family 88  93.14 
 
 		 379 aa  745    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3379  glycosyl hydrolase family 88  86.54 
 
 		 379 aa  698    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1211  glycosyl hydrolase, family 88  74.67 
 
 		 379 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2066  glycosyl hydrolase, family 88  74.67 
 
 		 379 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.0470712 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2126  glycosyl hydrolase, family 88  74.67 
 
 		 379 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000763601 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2071  glycosyl hydrolase, family 88  74.67 
 
 		 379 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000233336 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1335  glycosyl hydrolase, family 88  74.41 
 
 		 379 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103644 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2443  glycosy hydrolase family protein  73.61 
 
 		 379 aa  603  1.0000000000000001e-171  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0846  hypothetical protein  71.77 
 
 		 374 aa  574  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03196  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  61.48 
 
 		 370 aa  466  9.999999999999999e-131  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.389014 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3783  glycosyl hydrolase family 88  61.36 
 
 		 363 aa  460  9.999999999999999e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5078  glycosyl hydrolase family 88  45.19 
 
 		 364 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.958101  normal  0.117982 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08260  conserved hypothetical protein  39.66 
 
 		 458 aa  288  1e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.632375  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5758  hypothetical protein  44.55 
 
 		 364 aa  287  2.9999999999999996e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.489527  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0661  glycosyl hydrolase family 88  44.34 
 
 		 369 aa  286  5e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5358  glycosyl hydrolase family 88  44.87 
 
 		 364 aa  286  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.622605  normal  0.178388 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3673  glycosyl hydrolase family 88  44.37 
 
 		 368 aa  281  9e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3524  glycosyl hydrolase family 88  40.28 
 
 		 368 aa  280  4e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0713  glycosyl hydrolase family 88  43.37 
 
 		 362 aa  279  5e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4039  glycosyl hydrolase family 88  42.77 
 
 		 346 aa  267  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1919  glycosy hydrolase family protein  30.16 
 
 		 345 aa  153  5e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0449  glycosyl hydrolase family 88  32.75 
 
 		 410 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4685  glycosyl hydrolase family 88  29.55 
 
 		 349 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.558962  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0456  glycosyl hydrolase family 88  32.16 
 
 		 462 aa  116  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2470  glycosyl hydrolase family 88  28.65 
 
 		 393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2882  glycosyl hydrolase family 88  28.4 
 
 		 392 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1344  glycosy hydrolase family protein  29.96 
 
 		 473 aa  106  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3108  glycosyl hydrolase family 88  29.13 
 
 		 574 aa  102  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285148  normal  0.618959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5387  glycosyl hydrolase family 88  29.49 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0230208 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4250  glycosy hydrolase family protein  25.5 
 
 		 397 aa  96.3  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.478117  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0951  DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit  28.09 
 
 		 827 aa  92  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607652  hitchhiker  0.00000495983 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1549  glycosyl hydrolase family 88  30.24 
 
 		 345 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2741  glycosyl hydrolase family 88  25.07 
 
 		 639 aa  89.7  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.578666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4251  glycosy hydrolase family protein  27.52 
 
 		 401 aa  89.4  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166912  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0203  glycosy hydrolase family protein  23.84 
 
 		 375 aa  87.8  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000431819  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5409  glycosyl hydrolase family 88  27.98 
 
 		 376 aa  87.4  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000034973  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2841  glycosyl hydrolase family 88  30.15 
 
 		 612 aa  87.4  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.137267  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0452  glycosyl hydrolase family 88  25.31 
 
 		 381 aa  85.9  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5505  glycosyl hydrolase family 88  23.32 
 
 		 629 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0777464  hitchhiker  0.00601524 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1750  glycosy hydrolase family protein  24.77 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2704  glycosy hydrolase family protein  26.29 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.592912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1024  glycosyl hydrolase family 88  27.4 
 
 		 644 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  26.05 
 
 		 865 aa  79  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2381  glycosyl hydrolase family 88  21.21 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0696  glycosyl hydrolase family 88  24.3 
 
 		 362 aa  79.3  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2808  hypothetical protein  22.75 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000299929 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1360  glycosy hydrolase family protein  27.51 
 
 		 753 aa  77  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576113  normal  0.691294 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4252  glycosy hydrolase family protein  24.37 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239169  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5981  di-transpoly-cis-decaprenylcistransferase  27.17 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0986  glycosy hydrolase family protein  26.34 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0933  glycosy hydrolase family protein  26.34 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3368  glycosy hydrolase family protein  25.95 
 
 		 352 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.65377 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09383  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  27.2 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.318478 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0863  glycosyl hydrolase family 88  29.21 
 
 		 744 aa  67.8  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3978  glycosyl hydrolase family 88  25.99 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.380372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0962  glycosy hydrolase family protein  25.11 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1289  glycosyl hydrolase family 88  27.62 
 
 		 372 aa  62  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1806  glycosyl hydrolase family 88  26.54 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4236  glycosy hydrolase family protein  27.98 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1578  glycosyl hydrolase family 88  25.32 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.998372 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2306  glycosyl hydrolase family 88  24.31 
 
 		 386 aa  57.4  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.375805  normal  0.0432907 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1282  hypothetical protein  25.25 
 
 		 427 aa  56.2  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000326624  normal  0.558668 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06720  expressed protein  25.96 
 
 		 422 aa  54.7  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2294  glycosyl hydrolase family 88  24.16 
 
 		 433 aa  54.7  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  hitchhiker  0.00963008 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3946  hypothetical protein  25.57 
 
 		 389 aa  53.1  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1376  glycosy hydrolase family protein  22.8 
 
 		 823 aa  51.6  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0639822  normal  0.967141 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2300  glycosyl hydrolase family 88  30.51 
 
 		 363 aa  50.1  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00753245  normal  0.0687608 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07828  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  26.23 
 
 		 383 aa  47.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.091215  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10505  cell wall glycosyl hydrolase YteR, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14630)  24.63 
 
 		 367 aa  46.6  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.841717 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2540  glycosyl hydrolase family 88  25.09 
 
 		 402 aa  46.6  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>