70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1549 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1549  glycosyl hydrolase family 88  100 
 
 		 345 aa  701    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4685  glycosyl hydrolase family 88  36.42 
 
 		 349 aa  193  4e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.558962  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5758  hypothetical protein  34.21 
 
 		 364 aa  109  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.489527  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4251  glycosy hydrolase family protein  29.7 
 
 		 401 aa  107  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166912  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5078  glycosyl hydrolase family 88  31.58 
 
 		 364 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.958101  normal  0.117982 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4250  glycosy hydrolase family protein  28.69 
 
 		 397 aa  104  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.478117  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2470  glycosyl hydrolase family 88  32.72 
 
 		 393 aa  103  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5358  glycosyl hydrolase family 88  27.56 
 
 		 364 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.622605  normal  0.178388 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3541  glycosyl hydrolase family 88  28.87 
 
 		 379 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.591399  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0820  glycosyl hydrolase family 88  28.45 
 
 		 379 aa  99  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1024  glycosyl hydrolase family 88  29.38 
 
 		 644 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3379  glycosyl hydrolase family 88  28.45 
 
 		 379 aa  98.2  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0854  glycosyl hydrolase family 88  28.03 
 
 		 379 aa  92  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2071  glycosyl hydrolase, family 88  28.79 
 
 		 379 aa  89.7  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000233336 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1211  glycosyl hydrolase, family 88  28.79 
 
 		 379 aa  89.4  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2126  glycosyl hydrolase, family 88  28.79 
 
 		 379 aa  89.4  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000763601 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1335  glycosyl hydrolase, family 88  28.79 
 
 		 379 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103644 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5505  glycosyl hydrolase family 88  28.63 
 
 		 629 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0777464  hitchhiker  0.00601524 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  29.74 
 
 		 865 aa  89  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4039  glycosyl hydrolase family 88  25 
 
 		 346 aa  89  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2066  glycosyl hydrolase, family 88  28.79 
 
 		 379 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.0470712 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2381  glycosyl hydrolase family 88  27.49 
 
 		 373 aa  88.2  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4252  glycosy hydrolase family protein  25.34 
 
 		 399 aa  87  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239169  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1344  glycosy hydrolase family protein  32.02 
 
 		 473 aa  87  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0696  glycosyl hydrolase family 88  26.1 
 
 		 362 aa  87.4  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2443  glycosy hydrolase family protein  27.23 
 
 		 379 aa  86.7  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3108  glycosyl hydrolase family 88  31.75 
 
 		 574 aa  85.5  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285148  normal  0.618959 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0951  DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit  28.15 
 
 		 827 aa  83.6  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607652  hitchhiker  0.00000495983 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1750  glycosy hydrolase family protein  24.24 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0456  glycosyl hydrolase family 88  30.54 
 
 		 462 aa  82.8  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5981  di-transpoly-cis-decaprenylcistransferase  27.09 
 
 		 371 aa  80.9  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2741  glycosyl hydrolase family 88  25.53 
 
 		 639 aa  79  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.578666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3524  glycosyl hydrolase family 88  29.8 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3673  glycosyl hydrolase family 88  29.8 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0846  hypothetical protein  27.55 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3783  glycosyl hydrolase family 88  26.26 
 
 		 363 aa  75.9  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5409  glycosyl hydrolase family 88  24.67 
 
 		 376 aa  75.9  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000034973  normal  0.118478 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03196  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  25.52 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.389014 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0449  glycosyl hydrolase family 88  27.49 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0203  glycosy hydrolase family protein  24.8 
 
 		 375 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000431819  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2882  glycosyl hydrolase family 88  26.16 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2841  glycosyl hydrolase family 88  27.68 
 
 		 612 aa  73.2  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.137267  normal  0.120992 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09383  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  27.36 
 
 		 378 aa  72.8  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.318478 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0713  glycosyl hydrolase family 88  28.79 
 
 		 362 aa  72  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5387  glycosyl hydrolase family 88  29.15 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0230208 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1360  glycosy hydrolase family protein  29.78 
 
 		 753 aa  69.7  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576113  normal  0.691294 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0661  glycosyl hydrolase family 88  28.28 
 
 		 369 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06720  expressed protein  26.62 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4236  glycosy hydrolase family protein  26.59 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3946  hypothetical protein  28.02 
 
 		 389 aa  59.7  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0452  glycosyl hydrolase family 88  22.81 
 
 		 381 aa  59.3  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1919  glycosy hydrolase family protein  23.19 
 
 		 345 aa  59.3  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08260  conserved hypothetical protein  24.39 
 
 		 458 aa  58.9  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.632375  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1806  glycosyl hydrolase family 88  25 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2540  glycosyl hydrolase family 88  27.59 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3978  glycosyl hydrolase family 88  28.5 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.380372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1578  glycosyl hydrolase family 88  23.85 
 
 		 379 aa  56.2  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.998372 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02080  hypothetical protein  22.62 
 
 		 541 aa  54.7  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.237802  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2808  hypothetical protein  24.64 
 
 		 402 aa  52.8  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000299929 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0933  glycosy hydrolase family protein  25.81 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3368  glycosy hydrolase family protein  25.81 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.65377 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0986  glycosy hydrolase family protein  25.81 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2704  glycosy hydrolase family protein  22.87 
 
 		 358 aa  51.2  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.592912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1289  glycosyl hydrolase family 88  22.67 
 
 		 372 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0962  glycosy hydrolase family protein  26.83 
 
 		 369 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2300  glycosyl hydrolase family 88  23.46 
 
 		 363 aa  46.6  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00753245  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2306  glycosyl hydrolase family 88  29.14 
 
 		 386 aa  46.6  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.375805  normal  0.0432907 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07828  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  24.26 
 
 		 383 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.091215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2294  glycosyl hydrolase family 88  26.67 
 
 		 433 aa  43.9  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  hitchhiker  0.00963008 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1282  hypothetical protein  23.56 
 
 		 427 aa  43.5  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000326624  normal  0.558668 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>