68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0661 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0713  glycosyl hydrolase family 88  87.91 
 
 		 362 aa  655    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0661  glycosyl hydrolase family 88  100 
 
 		 369 aa  752    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3524  glycosyl hydrolase family 88  77.81 
 
 		 368 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3673  glycosyl hydrolase family 88  77.26 
 
 		 368 aa  566  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5078  glycosyl hydrolase family 88  56.1 
 
 		 364 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.958101  normal  0.117982 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5358  glycosyl hydrolase family 88  54.36 
 
 		 364 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.622605  normal  0.178388 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5758  hypothetical protein  53.82 
 
 		 364 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.489527  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3783  glycosyl hydrolase family 88  46.52 
 
 		 363 aa  296  4e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0820  glycosyl hydrolase family 88  45.31 
 
 		 379 aa  288  1e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0854  glycosyl hydrolase family 88  44.34 
 
 		 379 aa  286  5e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3379  glycosyl hydrolase family 88  44.34 
 
 		 379 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3541  glycosyl hydrolase family 88  44.01 
 
 		 379 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.591399  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0846  hypothetical protein  44.01 
 
 		 374 aa  279  6e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2066  glycosyl hydrolase, family 88  40.69 
 
 		 379 aa  275  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.0470712 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2071  glycosyl hydrolase, family 88  40.69 
 
 		 379 aa  275  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000233336 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1335  glycosyl hydrolase, family 88  40.69 
 
 		 379 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103644 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1211  glycosyl hydrolase, family 88  40.69 
 
 		 379 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2126  glycosyl hydrolase, family 88  40.69 
 
 		 379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000763601 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2443  glycosy hydrolase family protein  41.1 
 
 		 379 aa  265  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4039  glycosyl hydrolase family 88  41.08 
 
 		 346 aa  250  3e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03196  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  38.84 
 
 		 370 aa  239  5.999999999999999e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.389014 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08260  conserved hypothetical protein  41.85 
 
 		 458 aa  199  7e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.632375  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1919  glycosy hydrolase family protein  30.25 
 
 		 345 aa  156  6e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3108  glycosyl hydrolase family 88  33.65 
 
 		 574 aa  115  8.999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285148  normal  0.618959 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2470  glycosyl hydrolase family 88  29.94 
 
 		 393 aa  103  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0449  glycosyl hydrolase family 88  24.59 
 
 		 410 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4685  glycosyl hydrolase family 88  27.31 
 
 		 349 aa  97.1  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.558962  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0456  glycosyl hydrolase family 88  32.57 
 
 		 462 aa  90.5  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2882  glycosyl hydrolase family 88  27.11 
 
 		 392 aa  89  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0696  glycosyl hydrolase family 88  23.75 
 
 		 362 aa  80.5  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1344  glycosy hydrolase family protein  32.27 
 
 		 473 aa  80.5  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2741  glycosyl hydrolase family 88  29.35 
 
 		 639 aa  77.4  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.578666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5505  glycosyl hydrolase family 88  27.18 
 
 		 629 aa  77.4  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0777464  hitchhiker  0.00601524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5387  glycosyl hydrolase family 88  27.18 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0230208 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0951  DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit  28.97 
 
 		 827 aa  75.5  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607652  hitchhiker  0.00000495983 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0863  glycosyl hydrolase family 88  32.32 
 
 		 744 aa  75.5  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1360  glycosy hydrolase family protein  27.5 
 
 		 753 aa  74.7  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576113  normal  0.691294 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1750  glycosy hydrolase family protein  27.73 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4252  glycosy hydrolase family protein  23.13 
 
 		 399 aa  72.8  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239169  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2381  glycosyl hydrolase family 88  22.36 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0962  glycosy hydrolase family protein  28.09 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  31.15 
 
 		 865 aa  68.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5409  glycosyl hydrolase family 88  26.92 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000034973  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4251  glycosy hydrolase family protein  22.38 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166912  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1024  glycosyl hydrolase family 88  27.96 
 
 		 644 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4250  glycosy hydrolase family protein  24.32 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.478117  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1549  glycosyl hydrolase family 88  28.28 
 
 		 345 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3978  glycosyl hydrolase family 88  27.13 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.380372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2841  glycosyl hydrolase family 88  25.85 
 
 		 612 aa  61.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.137267  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2294  glycosyl hydrolase family 88  25.17 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  hitchhiker  0.00963008 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0452  glycosyl hydrolase family 88  23.56 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0203  glycosy hydrolase family protein  23.53 
 
 		 375 aa  57  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000431819  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2300  glycosyl hydrolase family 88  31.79 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00753245  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2704  glycosy hydrolase family protein  27.16 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.592912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4236  glycosy hydrolase family protein  28.14 
 
 		 374 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3946  hypothetical protein  28.49 
 
 		 389 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2306  glycosyl hydrolase family 88  26.67 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.375805  normal  0.0432907 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1289  glycosyl hydrolase family 88  24.28 
 
 		 372 aa  52.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1806  glycosyl hydrolase family 88  26.58 
 
 		 378 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0933  glycosy hydrolase family protein  26.58 
 
 		 352 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3368  glycosy hydrolase family protein  26.13 
 
 		 352 aa  52  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.65377 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0986  glycosy hydrolase family protein  26.58 
 
 		 352 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06720  expressed protein  24.69 
 
 		 422 aa  50.4  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09383  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  29.26 
 
 		 378 aa  50.1  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.318478 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1282  hypothetical protein  22.73 
 
 		 427 aa  47.8  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000326624  normal  0.558668 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2808  hypothetical protein  20.75 
 
 		 402 aa  47.4  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000299929 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1376  glycosy hydrolase family protein  27.81 
 
 		 823 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0639822  normal  0.967141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1578  glycosyl hydrolase family 88  22.58 
 
 		 379 aa  43.1  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.998372 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>