66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1919 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1919  glycosy hydrolase family protein  100 
 
 		 345 aa  721    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3783  glycosyl hydrolase family 88  33.55 
 
 		 363 aa  169  7e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4039  glycosyl hydrolase family 88  32 
 
 		 346 aa  164  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0820  glycosyl hydrolase family 88  31.75 
 
 		 379 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0713  glycosyl hydrolase family 88  31.53 
 
 		 362 aa  158  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3379  glycosyl hydrolase family 88  30.13 
 
 		 379 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3541  glycosyl hydrolase family 88  29.81 
 
 		 379 aa  156  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.591399  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0661  glycosyl hydrolase family 88  30.25 
 
 		 369 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3673  glycosyl hydrolase family 88  30.82 
 
 		 368 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0854  glycosyl hydrolase family 88  30.16 
 
 		 379 aa  153  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5758  hypothetical protein  31.19 
 
 		 364 aa  152  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.489527  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3524  glycosyl hydrolase family 88  30.5 
 
 		 368 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2443  glycosy hydrolase family protein  30.91 
 
 		 379 aa  149  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2071  glycosyl hydrolase, family 88  30.13 
 
 		 379 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000233336 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2126  glycosyl hydrolase, family 88  29.81 
 
 		 379 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000763601 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1211  glycosyl hydrolase, family 88  29.81 
 
 		 379 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2066  glycosyl hydrolase, family 88  29.21 
 
 		 379 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.0470712 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1335  glycosyl hydrolase, family 88  28.89 
 
 		 379 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103644 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0846  hypothetical protein  29.02 
 
 		 374 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5078  glycosyl hydrolase family 88  30.72 
 
 		 364 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.958101  normal  0.117982 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5358  glycosyl hydrolase family 88  30.41 
 
 		 364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.622605  normal  0.178388 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03196  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  29.65 
 
 		 370 aa  139  7e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.389014 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3108  glycosyl hydrolase family 88  31.2 
 
 		 574 aa  106  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285148  normal  0.618959 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0449  glycosyl hydrolase family 88  30.45 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08260  conserved hypothetical protein  28.74 
 
 		 458 aa  98.6  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.632375  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2470  glycosyl hydrolase family 88  24.68 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4685  glycosyl hydrolase family 88  24.37 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.558962  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1344  glycosy hydrolase family protein  27.97 
 
 		 473 aa  82  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0452  glycosyl hydrolase family 88  24.5 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2381  glycosyl hydrolase family 88  23.58 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0456  glycosyl hydrolase family 88  25.89 
 
 		 462 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2741  glycosyl hydrolase family 88  24.9 
 
 		 639 aa  70.9  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.578666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1360  glycosy hydrolase family protein  25 
 
 		 753 aa  70.9  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576113  normal  0.691294 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4250  glycosy hydrolase family protein  23.99 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.478117  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5505  glycosyl hydrolase family 88  25 
 
 		 629 aa  70.1  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0777464  hitchhiker  0.00601524 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2306  glycosyl hydrolase family 88  22.01 
 
 		 386 aa  67.4  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.375805  normal  0.0432907 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4252  glycosy hydrolase family protein  22.54 
 
 		 399 aa  66.2  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239169  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0696  glycosyl hydrolase family 88  22.56 
 
 		 362 aa  66.6  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0203  glycosy hydrolase family protein  19.39 
 
 		 375 aa  66.2  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000431819  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2300  glycosyl hydrolase family 88  26.39 
 
 		 363 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00753245  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4251  glycosy hydrolase family protein  24.75 
 
 		 401 aa  63.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166912  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2808  hypothetical protein  24.69 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000299929 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1289  glycosyl hydrolase family 88  24.83 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2882  glycosyl hydrolase family 88  24.27 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5409  glycosyl hydrolase family 88  23.32 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000034973  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0951  DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit  23.39 
 
 		 827 aa  60.5  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607652  hitchhiker  0.00000495983 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2704  glycosy hydrolase family protein  26.95 
 
 		 358 aa  60.5  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.592912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  25.29 
 
 		 865 aa  60.5  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2540  glycosyl hydrolase family 88  25.55 
 
 		 402 aa  59.3  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2841  glycosyl hydrolase family 88  23.26 
 
 		 612 aa  59.3  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.137267  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0962  glycosy hydrolase family protein  20.92 
 
 		 369 aa  59.3  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5387  glycosyl hydrolase family 88  25.71 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0230208 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5981  di-transpoly-cis-decaprenylcistransferase  22.99 
 
 		 371 aa  55.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1024  glycosyl hydrolase family 88  26.49 
 
 		 644 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1282  hypothetical protein  21.59 
 
 		 427 aa  53.5  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000326624  normal  0.558668 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1750  glycosy hydrolase family protein  22.31 
 
 		 319 aa  53.5  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1376  glycosy hydrolase family protein  26.81 
 
 		 823 aa  51.6  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0639822  normal  0.967141 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0933  glycosy hydrolase family protein  21.21 
 
 		 352 aa  50.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3368  glycosy hydrolase family protein  21.21 
 
 		 352 aa  50.1  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.65377 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0986  glycosy hydrolase family protein  21.21 
 
 		 352 aa  50.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1549  glycosyl hydrolase family 88  21.35 
 
 		 345 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09383  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  25.09 
 
 		 378 aa  47.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.318478 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2294  glycosyl hydrolase family 88  24.84 
 
 		 433 aa  47.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  hitchhiker  0.00963008 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3978  glycosyl hydrolase family 88  20.88 
 
 		 368 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.380372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1806  glycosyl hydrolase family 88  21.85 
 
 		 378 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0863  glycosyl hydrolase family 88  22.17 
 
 		 744 aa  43.5  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>