72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2126 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2071  glycosyl hydrolase, family 88  99.47 
 
 		 379 aa  788    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000233336 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2126  glycosyl hydrolase, family 88  100 
 
 		 379 aa  792    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000763601 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2066  glycosyl hydrolase, family 88  99.47 
 
 		 379 aa  786    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.0470712 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1211  glycosyl hydrolase, family 88  99.74 
 
 		 379 aa  790    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2443  glycosy hydrolase family protein  87.6 
 
 		 379 aa  708    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1335  glycosyl hydrolase, family 88  98.94 
 
 		 379 aa  783    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103644 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3541  glycosyl hydrolase family 88  75.73 
 
 		 379 aa  624  1e-177  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.591399  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3379  glycosyl hydrolase family 88  75.73 
 
 		 379 aa  620  1e-176  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0820  glycosyl hydrolase family 88  75.2 
 
 		 379 aa  618  1e-176  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0854  glycosyl hydrolase family 88  74.67 
 
 		 379 aa  616  1e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0846  hypothetical protein  67.03 
 
 		 374 aa  541  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03196  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  65.19 
 
 		 370 aa  486  1e-136  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.389014 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3783  glycosyl hydrolase family 88  59.41 
 
 		 363 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08260  conserved hypothetical protein  40.05 
 
 		 458 aa  290  3e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.632375  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5078  glycosyl hydrolase family 88  44.48 
 
 		 364 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.958101  normal  0.117982 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5358  glycosyl hydrolase family 88  44.23 
 
 		 364 aa  279  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.622605  normal  0.178388 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5758  hypothetical protein  43.59 
 
 		 364 aa  277  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.489527  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0661  glycosyl hydrolase family 88  40.69 
 
 		 369 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4039  glycosyl hydrolase family 88  42.9 
 
 		 346 aa  268  1e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3524  glycosyl hydrolase family 88  43.4 
 
 		 368 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3673  glycosyl hydrolase family 88  43.08 
 
 		 368 aa  263  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0713  glycosyl hydrolase family 88  38.98 
 
 		 362 aa  263  4.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1919  glycosy hydrolase family protein  29.81 
 
 		 345 aa  145  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0449  glycosyl hydrolase family 88  33.46 
 
 		 410 aa  138  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1344  glycosy hydrolase family protein  31.65 
 
 		 473 aa  117  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4685  glycosyl hydrolase family 88  30.22 
 
 		 349 aa  116  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.558962  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2470  glycosyl hydrolase family 88  29.66 
 
 		 393 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0456  glycosyl hydrolase family 88  32.68 
 
 		 462 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4250  glycosy hydrolase family protein  27.44 
 
 		 397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.478117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5387  glycosyl hydrolase family 88  29.3 
 
 		 391 aa  105  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0230208 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2882  glycosyl hydrolase family 88  27.24 
 
 		 392 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4251  glycosy hydrolase family protein  30.35 
 
 		 401 aa  99.4  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166912  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5505  glycosyl hydrolase family 88  28.62 
 
 		 629 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0777464  hitchhiker  0.00601524 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3108  glycosyl hydrolase family 88  26.94 
 
 		 574 aa  97.8  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285148  normal  0.618959 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0951  DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit  27.11 
 
 		 827 aa  97.8  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607652  hitchhiker  0.00000495983 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5409  glycosyl hydrolase family 88  29.11 
 
 		 376 aa  96.7  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000034973  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2741  glycosyl hydrolase family 88  28.07 
 
 		 639 aa  96.3  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.578666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  26.69 
 
 		 865 aa  92.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2841  glycosyl hydrolase family 88  26.18 
 
 		 612 aa  90.5  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.137267  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2381  glycosyl hydrolase family 88  25.69 
 
 		 373 aa  89.7  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0452  glycosyl hydrolase family 88  23.25 
 
 		 381 aa  89  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1549  glycosyl hydrolase family 88  32.14 
 
 		 345 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1024  glycosyl hydrolase family 88  29.7 
 
 		 644 aa  87  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4252  glycosy hydrolase family protein  25.32 
 
 		 399 aa  81.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239169  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1360  glycosy hydrolase family protein  26.61 
 
 		 753 aa  78.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576113  normal  0.691294 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0203  glycosy hydrolase family protein  23.98 
 
 		 375 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000431819  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2704  glycosy hydrolase family protein  23.64 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.592912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0863  glycosyl hydrolase family 88  29.02 
 
 		 744 aa  74.7  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0696  glycosyl hydrolase family 88  24.84 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2808  hypothetical protein  22.7 
 
 		 402 aa  73.2  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000299929 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09383  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  29.59 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.318478 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5981  di-transpoly-cis-decaprenylcistransferase  25.7 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4236  glycosy hydrolase family protein  29.31 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1750  glycosy hydrolase family protein  25.37 
 
 		 319 aa  62  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1289  glycosyl hydrolase family 88  23.89 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0933  glycosy hydrolase family protein  26.01 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0986  glycosy hydrolase family protein  26.01 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3368  glycosy hydrolase family protein  26.01 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.65377 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1578  glycosyl hydrolase family 88  25.67 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.998372 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1376  glycosy hydrolase family protein  25.42 
 
 		 823 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0639822  normal  0.967141 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3978  glycosyl hydrolase family 88  25.14 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.380372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0962  glycosy hydrolase family protein  26.4 
 
 		 369 aa  57  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1806  glycosyl hydrolase family 88  23.89 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2306  glycosyl hydrolase family 88  25 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.375805  normal  0.0432907 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2294  glycosyl hydrolase family 88  25.42 
 
 		 433 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  hitchhiker  0.00963008 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2117  glycosyl hydrolase family 88  25.96 
 
 		 623 aa  50.1  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10505  cell wall glycosyl hydrolase YteR, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14630)  24.34 
 
 		 367 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.841717 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3946  hypothetical protein  24.61 
 
 		 389 aa  47.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2300  glycosyl hydrolase family 88  21.86 
 
 		 363 aa  47.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00753245  normal  0.0687608 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07828  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  24.7 
 
 		 383 aa  47.4  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.091215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2540  glycosyl hydrolase family 88  26.28 
 
 		 402 aa  46.6  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1282  hypothetical protein  23.12 
 
 		 427 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000326624  normal  0.558668 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>