70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1578 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1578  glycosyl hydrolase family 88  100 
 
 		 379 aa  790    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.998372 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1806  glycosyl hydrolase family 88  65.17 
 
 		 378 aa  510  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4236  glycosy hydrolase family protein  58.97 
 
 		 374 aa  442  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3978  glycosyl hydrolase family 88  37.54 
 
 		 368 aa  199  5e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.380372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0962  glycosy hydrolase family protein  36.09 
 
 		 369 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2306  glycosyl hydrolase family 88  33.5 
 
 		 386 aa  195  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.375805  normal  0.0432907 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2294  glycosyl hydrolase family 88  35.24 
 
 		 433 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  hitchhiker  0.00963008 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1289  glycosyl hydrolase family 88  33.93 
 
 		 372 aa  192  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1376  glycosy hydrolase family protein  32.4 
 
 		 823 aa  170  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0639822  normal  0.967141 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2117  glycosyl hydrolase family 88  31.69 
 
 		 623 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0986  glycosy hydrolase family protein  31.34 
 
 		 352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3368  glycosy hydrolase family protein  31.34 
 
 		 352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.65377 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0933  glycosy hydrolase family protein  31.34 
 
 		 352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2300  glycosyl hydrolase family 88  32.6 
 
 		 363 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00753245  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0863  glycosyl hydrolase family 88  32.84 
 
 		 744 aa  155  9e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1282  hypothetical protein  33.14 
 
 		 427 aa  152  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000326624  normal  0.558668 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3946  hypothetical protein  29.22 
 
 		 389 aa  145  8.000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1344  glycosy hydrolase family protein  27.56 
 
 		 473 aa  94.7  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3108  glycosyl hydrolase family 88  27 
 
 		 574 aa  86.7  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285148  normal  0.618959 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4251  glycosy hydrolase family protein  28.09 
 
 		 401 aa  85.5  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166912  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2704  glycosy hydrolase family protein  31.88 
 
 		 358 aa  84.3  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.592912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0456  glycosyl hydrolase family 88  26.11 
 
 		 462 aa  83.6  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0452  glycosyl hydrolase family 88  27.08 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2470  glycosyl hydrolase family 88  28.51 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1360  glycosy hydrolase family protein  26.51 
 
 		 753 aa  79.7  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576113  normal  0.691294 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5505  glycosyl hydrolase family 88  25 
 
 		 629 aa  79.7  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0777464  hitchhiker  0.00601524 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0449  glycosyl hydrolase family 88  25.45 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  24.9 
 
 		 865 aa  77.4  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4252  glycosy hydrolase family protein  24.51 
 
 		 399 aa  76.3  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239169  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5409  glycosyl hydrolase family 88  38.24 
 
 		 376 aa  72.8  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000034973  normal  0.118478 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07828  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  30.25 
 
 		 383 aa  72  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.091215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1024  glycosyl hydrolase family 88  27.66 
 
 		 644 aa  70.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4685  glycosyl hydrolase family 88  27.27 
 
 		 349 aa  69.7  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.558962  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0696  glycosyl hydrolase family 88  24.56 
 
 		 362 aa  69.7  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0203  glycosy hydrolase family protein  23.98 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000431819  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2882  glycosyl hydrolase family 88  22.52 
 
 		 392 aa  69.3  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3783  glycosyl hydrolase family 88  23.79 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09383  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  30.86 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.318478 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4250  glycosy hydrolase family protein  28.81 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.478117  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2741  glycosyl hydrolase family 88  23 
 
 		 639 aa  66.6  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.578666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1211  glycosyl hydrolase, family 88  26.18 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5358  glycosyl hydrolase family 88  26.09 
 
 		 364 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.622605  normal  0.178388 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2126  glycosyl hydrolase, family 88  26.18 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000763601 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2071  glycosyl hydrolase, family 88  26.18 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000233336 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0854  glycosyl hydrolase family 88  26.09 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1335  glycosyl hydrolase, family 88  26.18 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103644 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5387  glycosyl hydrolase family 88  22.32 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0230208 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2066  glycosyl hydrolase, family 88  26.18 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.0470712 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0820  glycosyl hydrolase family 88  24 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0846  hypothetical protein  25.67 
 
 		 374 aa  62.4  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3541  glycosyl hydrolase family 88  25.89 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.591399  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3379  glycosyl hydrolase family 88  26.06 
 
 		 379 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5078  glycosyl hydrolase family 88  26.09 
 
 		 364 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.958101  normal  0.117982 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2808  hypothetical protein  28.09 
 
 		 402 aa  62  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000299929 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0951  DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit  27.43 
 
 		 827 aa  60.8  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607652  hitchhiker  0.00000495983 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2443  glycosy hydrolase family protein  25.13 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4039  glycosyl hydrolase family 88  24.64 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2381  glycosyl hydrolase family 88  30.3 
 
 		 373 aa  57  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1549  glycosyl hydrolase family 88  24.77 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5758  hypothetical protein  23.61 
 
 		 364 aa  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.489527  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03196  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  24.64 
 
 		 370 aa  51.2  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.389014 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3673  glycosyl hydrolase family 88  23.04 
 
 		 368 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3524  glycosyl hydrolase family 88  22.51 
 
 		 368 aa  47.8  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2841  glycosyl hydrolase family 88  22.22 
 
 		 612 aa  47  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.137267  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1919  glycosy hydrolase family protein  23.05 
 
 		 345 aa  46.2  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2540  glycosyl hydrolase family 88  24.58 
 
 		 402 aa  44.3  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08260  conserved hypothetical protein  22.75 
 
 		 458 aa  44.7  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.632375  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1750  glycosy hydrolase family protein  24.29 
 
 		 319 aa  43.9  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10505  cell wall glycosyl hydrolase YteR, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14630)  24.29 
 
 		 367 aa  43.9  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.841717 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0661  glycosyl hydrolase family 88  22.51 
 
 		 369 aa  43.5  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>