63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1376 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1376  glycosy hydrolase family protein  100 
 
 		 823 aa  1679    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0639822  normal  0.967141 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0962  glycosy hydrolase family protein  50.59 
 
 		 369 aa  337  5e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2306  glycosyl hydrolase family 88  39.33 
 
 		 386 aa  298  2e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.375805  normal  0.0432907 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1282  hypothetical protein  39.56 
 
 		 427 aa  274  5.000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000326624  normal  0.558668 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2294  glycosyl hydrolase family 88  39.94 
 
 		 433 aa  270  8e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  hitchhiker  0.00963008 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1289  glycosyl hydrolase family 88  39.4 
 
 		 372 aa  263  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3946  hypothetical protein  37.46 
 
 		 389 aa  244  7e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0863  glycosyl hydrolase family 88  38.96 
 
 		 744 aa  243  9e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3978  glycosyl hydrolase family 88  37.24 
 
 		 368 aa  239  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.380372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2300  glycosyl hydrolase family 88  36.67 
 
 		 363 aa  228  4e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00753245  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3368  glycosy hydrolase family protein  34.49 
 
 		 352 aa  196  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.65377 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0986  glycosy hydrolase family protein  34.49 
 
 		 352 aa  196  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0933  glycosy hydrolase family protein  34.49 
 
 		 352 aa  196  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1806  glycosyl hydrolase family 88  33.95 
 
 		 378 aa  186  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4236  glycosy hydrolase family protein  32.41 
 
 		 374 aa  172  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1578  glycosyl hydrolase family 88  31.78 
 
 		 379 aa  157  9e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.998372 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2117  glycosyl hydrolase family 88  31.61 
 
 		 623 aa  139  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0953  hypothetical protein  27.14 
 
 		 471 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.346417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4945  hypothetical protein  34.01 
 
 		 456 aa  102  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00172024  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1344  glycosy hydrolase family protein  32.74 
 
 		 473 aa  99  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2704  glycosy hydrolase family protein  32.58 
 
 		 358 aa  94  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.592912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0452  glycosyl hydrolase family 88  30.27 
 
 		 381 aa  93.2  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0456  glycosyl hydrolase family 88  31.39 
 
 		 462 aa  92.8  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5409  glycosyl hydrolase family 88  25.89 
 
 		 376 aa  92  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000034973  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0449  glycosyl hydrolase family 88  27.44 
 
 		 410 aa  82.4  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1360  glycosy hydrolase family protein  28.63 
 
 		 753 aa  82.4  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576113  normal  0.691294 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2470  glycosyl hydrolase family 88  27.95 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3108  glycosyl hydrolase family 88  28 
 
 		 574 aa  80.9  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285148  normal  0.618959 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4685  glycosyl hydrolase family 88  29.58 
 
 		 349 aa  79.7  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.558962  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4251  glycosy hydrolase family protein  25.09 
 
 		 401 aa  75.5  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166912  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4252  glycosy hydrolase family protein  27.14 
 
 		 399 aa  74.3  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239169  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09383  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  35.85 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.318478 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2808  hypothetical protein  30.51 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000299929 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4250  glycosy hydrolase family protein  22.99 
 
 		 397 aa  66.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.478117  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07828  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  31.25 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.091215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  26.26 
 
 		 865 aa  63.5  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3783  glycosyl hydrolase family 88  22.22 
 
 		 363 aa  62.4  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5505  glycosyl hydrolase family 88  23.67 
 
 		 629 aa  58.9  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0777464  hitchhiker  0.00601524 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1211  glycosyl hydrolase, family 88  25.42 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2126  glycosyl hydrolase, family 88  25.42 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000763601 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2071  glycosyl hydrolase, family 88  25.42 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000233336 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1335  glycosyl hydrolase, family 88  25.42 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103644 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2066  glycosyl hydrolase, family 88  25.42 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.0470712 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5358  glycosyl hydrolase family 88  24.23 
 
 		 364 aa  57  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.622605  normal  0.178388 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1024  glycosyl hydrolase family 88  25.53 
 
 		 644 aa  55.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2741  glycosyl hydrolase family 88  22.79 
 
 		 639 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.578666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2443  glycosy hydrolase family protein  25.42 
 
 		 379 aa  54.3  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5078  glycosyl hydrolase family 88  23.35 
 
 		 364 aa  53.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.958101  normal  0.117982 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0951  DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit  23.46 
 
 		 827 aa  52.4  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607652  hitchhiker  0.00000495983 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4039  glycosyl hydrolase family 88  21.76 
 
 		 346 aa  52.4  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1919  glycosy hydrolase family protein  26.81 
 
 		 345 aa  51.2  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0854  glycosyl hydrolase family 88  22.8 
 
 		 379 aa  51.2  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3379  glycosyl hydrolase family 88  21.78 
 
 		 379 aa  50.4  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3541  glycosyl hydrolase family 88  21.78 
 
 		 379 aa  50.8  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.591399  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0820  glycosyl hydrolase family 88  22.28 
 
 		 379 aa  49.7  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0846  hypothetical protein  22.08 
 
 		 374 aa  49.7  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0696  glycosyl hydrolase family 88  21.58 
 
 		 362 aa  50.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03196  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  24.47 
 
 		 370 aa  48.9  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.389014 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5758  hypothetical protein  24.71 
 
 		 364 aa  48.5  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.489527  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1087  hypothetical protein  28.02 
 
 		 375 aa  48.1  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.344662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2381  glycosyl hydrolase family 88  28.16 
 
 		 373 aa  46.6  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1750  glycosy hydrolase family protein  23.93 
 
 		 319 aa  44.7  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0661  glycosyl hydrolase family 88  27.81 
 
 		 369 aa  44.3  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>