71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5358 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5358  glycosyl hydrolase family 88  100 
 
 		 364 aa  745    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.622605  normal  0.178388 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5078  glycosyl hydrolase family 88  95.88 
 
 		 364 aa  723    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.958101  normal  0.117982 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5758  hypothetical protein  79.49 
 
 		 364 aa  582  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.489527  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0661  glycosyl hydrolase family 88  54.36 
 
 		 369 aa  377  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0713  glycosyl hydrolase family 88  55.56 
 
 		 362 aa  377  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3673  glycosyl hydrolase family 88  54.72 
 
 		 368 aa  373  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3524  glycosyl hydrolase family 88  54.72 
 
 		 368 aa  374  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0846  hypothetical protein  47.27 
 
 		 374 aa  313  3.9999999999999997e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3783  glycosyl hydrolase family 88  44.17 
 
 		 363 aa  289  6e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3379  glycosyl hydrolase family 88  44.87 
 
 		 379 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0820  glycosyl hydrolase family 88  45.51 
 
 		 379 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0854  glycosyl hydrolase family 88  44.87 
 
 		 379 aa  286  5e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3541  glycosyl hydrolase family 88  44.23 
 
 		 379 aa  281  9e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.591399  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2071  glycosyl hydrolase, family 88  44.23 
 
 		 379 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000233336 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1211  glycosyl hydrolase, family 88  44.23 
 
 		 379 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2126  glycosyl hydrolase, family 88  44.23 
 
 		 379 aa  279  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000763601 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2066  glycosyl hydrolase, family 88  44.23 
 
 		 379 aa  278  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.0470712 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1335  glycosyl hydrolase, family 88  44.23 
 
 		 379 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103644 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2443  glycosy hydrolase family protein  42.95 
 
 		 379 aa  273  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4039  glycosyl hydrolase family 88  42.35 
 
 		 346 aa  268  1e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03196  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  40.5 
 
 		 370 aa  241  2e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.389014 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08260  conserved hypothetical protein  41.76 
 
 		 458 aa  238  1e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.632375  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1919  glycosy hydrolase family protein  30.41 
 
 		 345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3108  glycosyl hydrolase family 88  30.92 
 
 		 574 aa  126  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285148  normal  0.618959 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4685  glycosyl hydrolase family 88  35.32 
 
 		 349 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.558962  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0456  glycosyl hydrolase family 88  31.02 
 
 		 462 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0449  glycosyl hydrolase family 88  28.06 
 
 		 410 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2470  glycosyl hydrolase family 88  26.32 
 
 		 393 aa  98.6  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1549  glycosyl hydrolase family 88  27.81 
 
 		 345 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1344  glycosy hydrolase family protein  31.33 
 
 		 473 aa  95.1  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0951  DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit  28.46 
 
 		 827 aa  94.4  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607652  hitchhiker  0.00000495983 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2882  glycosyl hydrolase family 88  28.12 
 
 		 392 aa  87.8  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0452  glycosyl hydrolase family 88  28.15 
 
 		 381 aa  87.4  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1750  glycosy hydrolase family protein  25.46 
 
 		 319 aa  86.3  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5409  glycosyl hydrolase family 88  27.36 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000034973  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1360  glycosy hydrolase family protein  28.21 
 
 		 753 aa  83.6  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576113  normal  0.691294 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4252  glycosy hydrolase family protein  23.47 
 
 		 399 aa  82.8  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239169  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4236  glycosy hydrolase family protein  27.45 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2381  glycosyl hydrolase family 88  23.47 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5387  glycosyl hydrolase family 88  26.55 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0230208 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1024  glycosyl hydrolase family 88  30.28 
 
 		 644 aa  79.3  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4250  glycosy hydrolase family protein  27.4 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.478117  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5505  glycosyl hydrolase family 88  24.48 
 
 		 629 aa  77.4  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0777464  hitchhiker  0.00601524 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0203  glycosy hydrolase family protein  26.37 
 
 		 375 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000431819  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0696  glycosyl hydrolase family 88  21.94 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4251  glycosy hydrolase family protein  25.42 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166912  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2841  glycosyl hydrolase family 88  24.68 
 
 		 612 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.137267  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  28.44 
 
 		 865 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0962  glycosy hydrolase family protein  29.26 
 
 		 369 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1806  glycosyl hydrolase family 88  27.8 
 
 		 378 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3946  hypothetical protein  29.51 
 
 		 389 aa  69.7  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2741  glycosyl hydrolase family 88  25 
 
 		 639 aa  68.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.578666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0986  glycosy hydrolase family protein  32.46 
 
 		 352 aa  67  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3368  glycosy hydrolase family protein  32.46 
 
 		 352 aa  67  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.65377 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0933  glycosy hydrolase family protein  32.46 
 
 		 352 aa  67  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0863  glycosyl hydrolase family 88  27.36 
 
 		 744 aa  66.6  0.0000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2704  glycosy hydrolase family protein  27.78 
 
 		 358 aa  66.2  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.592912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1289  glycosyl hydrolase family 88  30.48 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2306  glycosyl hydrolase family 88  23.65 
 
 		 386 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.375805  normal  0.0432907 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5981  di-transpoly-cis-decaprenylcistransferase  26.61 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3978  glycosyl hydrolase family 88  27.59 
 
 		 368 aa  61.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.380372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1578  glycosyl hydrolase family 88  25.89 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.998372 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1282  hypothetical protein  24.24 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000326624  normal  0.558668 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2300  glycosyl hydrolase family 88  26.37 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00753245  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2808  hypothetical protein  23.48 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000299929 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09383  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  26.42 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.318478 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1376  glycosy hydrolase family protein  24.23 
 
 		 823 aa  57.4  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0639822  normal  0.967141 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2294  glycosyl hydrolase family 88  25.76 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  hitchhiker  0.00963008 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06720  expressed protein  26.92 
 
 		 422 aa  56.6  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0349  unsaturated glucuronyl hydrolase  29.73 
 
 		 388 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07828  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  27.42 
 
 		 383 aa  43.5  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.091215  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>