60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1282 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1282  hypothetical protein  100 
 
 		 427 aa  888    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000326624  normal  0.558668 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0962  glycosy hydrolase family protein  39.84 
 
 		 369 aa  284  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1376  glycosy hydrolase family protein  39.56 
 
 		 823 aa  273  3e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0639822  normal  0.967141 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0863  glycosyl hydrolase family 88  39.37 
 
 		 744 aa  270  2e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2294  glycosyl hydrolase family 88  38.3 
 
 		 433 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  hitchhiker  0.00963008 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3946  hypothetical protein  39.83 
 
 		 389 aa  268  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3978  glycosyl hydrolase family 88  38.48 
 
 		 368 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.380372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2306  glycosyl hydrolase family 88  36.94 
 
 		 386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.375805  normal  0.0432907 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1289  glycosyl hydrolase family 88  37.47 
 
 		 372 aa  245  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3368  glycosy hydrolase family protein  36.54 
 
 		 352 aa  216  5e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.65377 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0986  glycosy hydrolase family protein  36.54 
 
 		 352 aa  216  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0933  glycosy hydrolase family protein  36.54 
 
 		 352 aa  216  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2300  glycosyl hydrolase family 88  31.67 
 
 		 363 aa  213  7e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00753245  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1806  glycosyl hydrolase family 88  30.87 
 
 		 378 aa  160  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4236  glycosy hydrolase family protein  31.97 
 
 		 374 aa  144  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2117  glycosyl hydrolase family 88  35.37 
 
 		 623 aa  144  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1578  glycosyl hydrolase family 88  32.84 
 
 		 379 aa  141  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.998372 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1360  glycosy hydrolase family protein  30.94 
 
 		 753 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576113  normal  0.691294 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5409  glycosyl hydrolase family 88  28.4 
 
 		 376 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000034973  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0456  glycosyl hydrolase family 88  28.83 
 
 		 462 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3108  glycosyl hydrolase family 88  29.22 
 
 		 574 aa  92.8  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285148  normal  0.618959 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0449  glycosyl hydrolase family 88  24.52 
 
 		 410 aa  90.9  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1344  glycosy hydrolase family protein  27.15 
 
 		 473 aa  89.7  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0452  glycosyl hydrolase family 88  27.98 
 
 		 381 aa  87.8  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2704  glycosy hydrolase family protein  27.53 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.592912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3783  glycosyl hydrolase family 88  29 
 
 		 363 aa  72.8  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4685  glycosyl hydrolase family 88  28.04 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.558962  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0951  DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit  26.4 
 
 		 827 aa  65.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607652  hitchhiker  0.00000495983 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3379  glycosyl hydrolase family 88  26.11 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2381  glycosyl hydrolase family 88  25.1 
 
 		 373 aa  63.2  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3541  glycosyl hydrolase family 88  25.62 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.591399  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5758  hypothetical protein  24.63 
 
 		 364 aa  61.6  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.489527  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2470  glycosyl hydrolase family 88  25.32 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5358  glycosyl hydrolase family 88  24.24 
 
 		 364 aa  60.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.622605  normal  0.178388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4250  glycosy hydrolase family protein  23.83 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.478117  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4252  glycosy hydrolase family protein  24.28 
 
 		 399 aa  59.7  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239169  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0846  hypothetical protein  24.62 
 
 		 374 aa  59.7  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4251  glycosy hydrolase family protein  22.84 
 
 		 401 aa  59.7  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166912  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1750  glycosy hydrolase family protein  25.65 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4039  glycosyl hydrolase family 88  25.36 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5078  glycosyl hydrolase family 88  24.24 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.958101  normal  0.117982 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0820  glycosyl hydrolase family 88  25 
 
 		 379 aa  55.8  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0854  glycosyl hydrolase family 88  25.25 
 
 		 379 aa  56.2  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2841  glycosyl hydrolase family 88  21.69 
 
 		 612 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.137267  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2808  hypothetical protein  29.13 
 
 		 402 aa  55.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000299929 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03196  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  25.89 
 
 		 370 aa  54.3  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.389014 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1919  glycosy hydrolase family protein  21.59 
 
 		 345 aa  53.5  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09383  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  24.38 
 
 		 378 aa  51.6  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.318478 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  19.05 
 
 		 865 aa  50.8  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1024  glycosyl hydrolase family 88  22.13 
 
 		 644 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5505  glycosyl hydrolase family 88  21.62 
 
 		 629 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0777464  hitchhiker  0.00601524 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2540  glycosyl hydrolase family 88  23.84 
 
 		 402 aa  48.9  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2882  glycosyl hydrolase family 88  22.28 
 
 		 392 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0661  glycosyl hydrolase family 88  22.73 
 
 		 369 aa  47.8  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0203  glycosy hydrolase family protein  24.47 
 
 		 375 aa  46.2  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000431819  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2071  glycosyl hydrolase, family 88  23.12 
 
 		 379 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000233336 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2126  glycosyl hydrolase, family 88  23.12 
 
 		 379 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000763601 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1211  glycosyl hydrolase, family 88  23.12 
 
 		 379 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2066  glycosyl hydrolase, family 88  23.12 
 
 		 379 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.0470712 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1335  glycosyl hydrolase, family 88  23.12 
 
 		 379 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103644 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>