72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2071 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2071  glycosyl hydrolase, family 88  100 
 
 
379 aa  792    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000233336 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2126  glycosyl hydrolase, family 88  99.47 
 
 
379 aa  788    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000763601 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2066  glycosyl hydrolase, family 88  99.47 
 
 
379 aa  788    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.0470712 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1211  glycosyl hydrolase, family 88  99.74 
 
 
379 aa  790    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2443  glycosy hydrolase family protein  87.86 
 
 
379 aa  709    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1335  glycosyl hydrolase, family 88  98.94 
 
 
379 aa  785    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000103644 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3541  glycosyl hydrolase family 88  75.99 
 
 
379 aa  625  1e-178  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.591399  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3379  glycosyl hydrolase family 88  75.99 
 
 
379 aa  622  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0820  glycosyl hydrolase family 88  75.2 
 
 
379 aa  617  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0854  glycosyl hydrolase family 88  74.67 
 
 
379 aa  615  1e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0846  hypothetical protein  67.03 
 
 
374 aa  541  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03196  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  65.19 
 
 
370 aa  486  1e-136  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.389014 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3783  glycosyl hydrolase family 88  59.12 
 
 
363 aa  444  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08260  conserved hypothetical protein  40.05 
 
 
458 aa  291  2e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.632375  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5078  glycosyl hydrolase family 88  44.48 
 
 
364 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.958101  normal  0.117982 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5358  glycosyl hydrolase family 88  44.23 
 
 
364 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.622605  normal  0.178388 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5758  hypothetical protein  43.27 
 
 
364 aa  276  4e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.489527  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0661  glycosyl hydrolase family 88  40.69 
 
 
369 aa  275  9e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4039  glycosyl hydrolase family 88  42.9 
 
 
346 aa  267  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3524  glycosyl hydrolase family 88  43.35 
 
 
368 aa  266  5e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0713  glycosyl hydrolase family 88  38.98 
 
 
362 aa  263  3e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3673  glycosyl hydrolase family 88  43.08 
 
 
368 aa  263  4e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1919  glycosy hydrolase family protein  30.13 
 
 
345 aa  145  9e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0449  glycosyl hydrolase family 88  33.46 
 
 
410 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4685  glycosyl hydrolase family 88  30.22 
 
 
349 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.558962  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1344  glycosy hydrolase family protein  31.22 
 
 
473 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2470  glycosyl hydrolase family 88  29.66 
 
 
393 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0456  glycosyl hydrolase family 88  34.5 
 
 
462 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4250  glycosy hydrolase family protein  27.44 
 
 
397 aa  110  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.478117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5387  glycosyl hydrolase family 88  28.98 
 
 
391 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0230208 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2882  glycosyl hydrolase family 88  26.9 
 
 
392 aa  103  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4251  glycosy hydrolase family protein  30.74 
 
 
401 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166912  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3108  glycosyl hydrolase family 88  27.35 
 
 
574 aa  99.4  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285148  normal  0.618959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5409  glycosyl hydrolase family 88  29.54 
 
 
376 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000034973  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5505  glycosyl hydrolase family 88  28.62 
 
 
629 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0777464  hitchhiker  0.00601524 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2741  glycosyl hydrolase family 88  28.42 
 
 
639 aa  97.4  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.578666  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0951  DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit  27.11 
 
 
827 aa  97.1  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607652  hitchhiker  0.00000495983 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  27.01 
 
 
865 aa  93.6  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2841  glycosyl hydrolase family 88  26.18 
 
 
612 aa  90.5  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.137267  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1024  glycosyl hydrolase family 88  30.2 
 
 
644 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1549  glycosyl hydrolase family 88  32.14 
 
 
345 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2381  glycosyl hydrolase family 88  25.35 
 
 
373 aa  87  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0452  glycosyl hydrolase family 88  22.93 
 
 
381 aa  87  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4252  glycosy hydrolase family protein  25 
 
 
399 aa  78.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239169  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1360  glycosy hydrolase family protein  26.61 
 
 
753 aa  78.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576113  normal  0.691294 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2704  glycosy hydrolase family protein  23.64 
 
 
358 aa  76.3  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.592912  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0203  glycosy hydrolase family protein  23.68 
 
 
375 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000431819  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0863  glycosyl hydrolase family 88  29.02 
 
 
744 aa  74.3  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0696  glycosyl hydrolase family 88  24.84 
 
 
362 aa  71.6  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2808  hypothetical protein  22.7 
 
 
402 aa  72  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000299929 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09383  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  29.08 
 
 
378 aa  68.2  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.318478 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5981  di-transpoly-cis-decaprenylcistransferase  25.7 
 
 
371 aa  67.4  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4236  glycosy hydrolase family protein  29.31 
 
 
374 aa  67.4  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1289  glycosyl hydrolase family 88  23.55 
 
 
372 aa  62  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0933  glycosy hydrolase family protein  26.01 
 
 
352 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0986  glycosy hydrolase family protein  26.01 
 
 
352 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3368  glycosy hydrolase family protein  26.01 
 
 
352 aa  60.1  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.65377 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1750  glycosy hydrolase family protein  24.88 
 
 
319 aa  60.1  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1578  glycosyl hydrolase family 88  25.67 
 
 
379 aa  60.1  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.998372 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1376  glycosy hydrolase family protein  25.42 
 
 
823 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0639822  normal  0.967141 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0962  glycosy hydrolase family protein  26.4 
 
 
369 aa  57  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3978  glycosyl hydrolase family 88  25.14 
 
 
368 aa  57  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.380372  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1806  glycosyl hydrolase family 88  23.89 
 
 
378 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2306  glycosyl hydrolase family 88  25 
 
 
386 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.375805  normal  0.0432907 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2294  glycosyl hydrolase family 88  25.42 
 
 
433 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  hitchhiker  0.00963008 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2117  glycosyl hydrolase family 88  26.28 
 
 
623 aa  52.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2540  glycosyl hydrolase family 88  25.64 
 
 
402 aa  48.9  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10505  cell wall glycosyl hydrolase YteR, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14630)  24.34 
 
 
367 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.841717 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3946  hypothetical protein  24.61 
 
 
389 aa  47.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2300  glycosyl hydrolase family 88  21.86 
 
 
363 aa  47  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00753245  normal  0.0687608 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07828  unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase (Eurofung)  24.29 
 
 
383 aa  47.4  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.091215  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1282  hypothetical protein  23.12 
 
 
427 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000326624  normal  0.558668 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>