84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1936 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1936  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
205 aa  422  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0127219 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  28.76 
 
 
190 aa  56.6  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0886  phenazine biosynthesis protein PhzD  30 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3382  phenazine biosynthesis protein PhzD  30 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  28.67 
 
 
192 aa  53.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4467  Isochorismatase  30.63 
 
 
201 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.813691 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  24.14 
 
 
188 aa  51.6  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  26.78 
 
 
187 aa  51.6  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  26.95 
 
 
172 aa  50.4  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  27.16 
 
 
204 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  25.48 
 
 
192 aa  50.8  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  26.92 
 
 
221 aa  49.7  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
226 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09450  phenazine biosynthesis protein PhzD  32.72 
 
 
207 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39925  phenazine biosynthesis protein PhzD  32.72 
 
 
207 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
226 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  28.74 
 
 
237 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  26.49 
 
 
193 aa  48.9  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  26 
 
 
206 aa  48.9  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0305346 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1133  hypothetical protein  25.15 
 
 
159 aa  48.5  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0774875  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  25.9 
 
 
207 aa  48.1  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2408  isochorismatase hydrolase  27.37 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796246  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1023  isochorismatase hydrolase  32.26 
 
 
191 aa  47.4  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.228804  normal  0.0648547 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2986  isochorismatase hydrolase  28.74 
 
 
204 aa  47.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.688868 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  28.26 
 
 
213 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  26.37 
 
 
228 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  26.49 
 
 
190 aa  47  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  29.14 
 
 
225 aa  47  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  31.9 
 
 
226 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1569  isochorismatase  25.44 
 
 
207 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0910481  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 
248 aa  46.2  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3684  isochorismatase hydrolase  30.59 
 
 
207 aa  46.2  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  27.33 
 
 
192 aa  46.6  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7116  isochorismatase hydrolase  27.53 
 
 
192 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.902933  normal  0.0479285 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2383  isochorismatase  28 
 
 
218 aa  46.2  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1301  isochorismatase hydrolase  31.61 
 
 
194 aa  46.2  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2805  isochorismatase hydrolase  26.59 
 
 
208 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3109  isochorismatase hydrolase  37.33 
 
 
207 aa  45.8  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456789  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0062  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 
203 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2989  isochorismatase hydrolase  28.35 
 
 
192 aa  45.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.486684  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  30.48 
 
 
191 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  28.15 
 
 
204 aa  45.8  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  26.09 
 
 
217 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  29.47 
 
 
252 aa  45.4  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0248  isochorismatase hydrolase  27.03 
 
 
185 aa  45.4  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  25.77 
 
 
189 aa  45.1  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1758  isochorismatase hydrolase  33.68 
 
 
181 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  25.58 
 
 
226 aa  44.7  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1230  isochorismatase hydrolase  25.97 
 
 
174 aa  44.3  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  31.25 
 
 
244 aa  44.7  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3600  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 
208 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.572531  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  25.15 
 
 
227 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  24.53 
 
 
193 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  28.74 
 
 
209 aa  44.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0430  isochorismatase hydrolase  27.93 
 
 
184 aa  44.7  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.650644  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  23.86 
 
 
245 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  24.34 
 
 
193 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3737  Isochorismatase  25.24 
 
 
287 aa  43.9  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248742  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  30.43 
 
 
217 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  22.93 
 
 
200 aa  43.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  24.37 
 
 
246 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  24.4 
 
 
222 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  27.84 
 
 
233 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  28.87 
 
 
190 aa  42.7  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  26.67 
 
 
182 aa  42.7  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  25.32 
 
 
180 aa  42.4  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  26.81 
 
 
201 aa  42.7  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3825  isochorismatase hydrolase  29.46 
 
 
204 aa  42.7  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  27.98 
 
 
230 aa  42.4  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  29.35 
 
 
231 aa  42.4  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1766  isochorismatase hydrolase  25.68 
 
 
226 aa  42  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  30.43 
 
 
224 aa  42  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1100  isochorismatase hydrolase  30.26 
 
 
215 aa  42  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07441  isochorismatase hydrolase family protein  27.91 
 
 
206 aa  42  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0995992 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4551  isochorismatase hydrolase  30.43 
 
 
223 aa  41.6  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28453  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5346  isochorismatase hydrolase  25 
 
 
217 aa  41.6  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  0.524133 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  26.78 
 
 
200 aa  41.6  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  29.2 
 
 
190 aa  41.6  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  27.97 
 
 
199 aa  41.6  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2624  isochorismatase hydrolase  28.3 
 
 
226 aa  41.6  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.722886  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  26.78 
 
 
195 aa  41.6  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2838  isochorismatase hydrolase  25.73 
 
 
174 aa  41.6  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102988  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2663  isochorismatase hydrolase  27.45 
 
 
202 aa  41.6  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0767391  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1636  isochorismatase hydrolase  29.65 
 
 
203 aa  41.2  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26206  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>