19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1133 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1133  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  328  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0774875  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0099  hypothetical protein  44.14 
 
 		 148 aa  120  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0101  hypothetical protein  44.14 
 
 		 148 aa  120  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2562  hypothetical protein  37.04 
 
 		 161 aa  90.5  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.559467  normal  0.419528 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3321  hypothetical protein  37.04 
 
 		 161 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3153  hypothetical protein  36.3 
 
 		 161 aa  89  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678742  normal  0.723292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0774  hypothetical protein  40.54 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2849  isochorismatase hydrolase  35.56 
 
 		 159 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.403126 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2120  hypothetical protein  41.13 
 
 		 125 aa  85.1  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0432407 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5202  hypothetical protein  35.56 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730727  normal  0.1349 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4674  hypothetical protein  35.56 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.533703 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1832  hypothetical protein  34.25 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21520  hypothetical protein  32.88 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0847336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5127  hypothetical protein  29.17 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.152283 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5205  hypothetical protein  29.17 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4664  hypothetical protein  29.84 
 
 		 154 aa  50.8  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1936  isochorismatase hydrolase  25.15 
 
 		 205 aa  48.5  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0127219 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2717  isochorismatase hydrolase  29.29 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0482  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 		 187 aa  41.2  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.717591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>