20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_21520 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_21520  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  333  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0847336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1832  hypothetical protein  87.82 
 
 		 163 aa  281  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4674  hypothetical protein  75.51 
 
 		 161 aa  229  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.533703 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5202  hypothetical protein  75.51 
 
 		 161 aa  228  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730727  normal  0.1349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3153  hypothetical protein  65.38 
 
 		 161 aa  217  6e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678742  normal  0.723292 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2849  isochorismatase hydrolase  63.46 
 
 		 159 aa  217  6e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.403126 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2562  hypothetical protein  64.1 
 
 		 161 aa  214  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.559467  normal  0.419528 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3321  hypothetical protein  64.1 
 
 		 161 aa  214  5e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5205  hypothetical protein  63.23 
 
 		 168 aa  194  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5127  hypothetical protein  62.34 
 
 		 154 aa  194  7e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.152283 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4664  hypothetical protein  63.64 
 
 		 154 aa  192  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1133  hypothetical protein  32.88 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0774875  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0774  hypothetical protein  27.92 
 
 		 151 aa  47.8  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2408  isochorismatase hydrolase  37.08 
 
 		 208 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796246  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  26.42 
 
 		 224 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  24.44 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  23.89 
 
 		 181 aa  42  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  22.38 
 
 		 180 aa  41.2  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3825  isochorismatase hydrolase  24.73 
 
 		 204 aa  40.8  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  24.73 
 
 		 193 aa  40.8  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>