18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4674 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4674  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  324  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.533703 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5202  hypothetical protein  99.38 
 
 		 161 aa  321  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730727  normal  0.1349 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21520  hypothetical protein  75.51 
 
 		 167 aa  229  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0847336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1832  hypothetical protein  68.99 
 
 		 163 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2849  isochorismatase hydrolase  68.03 
 
 		 159 aa  216  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.403126 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3321  hypothetical protein  66.67 
 
 		 161 aa  213  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2562  hypothetical protein  66.67 
 
 		 161 aa  213  9e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.559467  normal  0.419528 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3153  hypothetical protein  65.99 
 
 		 161 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678742  normal  0.723292 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5205  hypothetical protein  63.7 
 
 		 168 aa  184  6e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5127  hypothetical protein  61.9 
 
 		 154 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.152283 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4664  hypothetical protein  61.22 
 
 		 154 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1133  hypothetical protein  35.56 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0774875  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0774  hypothetical protein  32.21 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0101  hypothetical protein  29.05 
 
 		 148 aa  44.7  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0099  hypothetical protein  29.05 
 
 		 148 aa  44.7  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2408  isochorismatase hydrolase  29.24 
 
 		 208 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796246  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  26.03 
 
 		 180 aa  41.2  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  36.73 
 
 		 181 aa  40.4  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>