11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0099 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0101  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  305  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0099  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  305  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2120  hypothetical protein  75.65 
 
 		 125 aa  187  5e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0432407 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1133  hypothetical protein  44.14 
 
 		 159 aa  120  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0774875  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0774  hypothetical protein  34.9 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2562  hypothetical protein  25.36 
 
 		 161 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.559467  normal  0.419528 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3153  hypothetical protein  25.36 
 
 		 161 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678742  normal  0.723292 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3321  hypothetical protein  26.02 
 
 		 161 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2849  isochorismatase hydrolase  27.05 
 
 		 159 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.403126 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5202  hypothetical protein  29.05 
 
 		 161 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730727  normal  0.1349 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4674  hypothetical protein  29.05 
 
 		 161 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.533703 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>