13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4664 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4664  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  308  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5127  hypothetical protein  94.16 
 
 		 154 aa  290  6e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.152283 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5205  hypothetical protein  82.35 
 
 		 168 aa  249  9.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21520  hypothetical protein  63.64 
 
 		 167 aa  192  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0847336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2849  isochorismatase hydrolase  57.79 
 
 		 159 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.403126 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1832  hypothetical protein  61.69 
 
 		 163 aa  185  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3153  hypothetical protein  57.14 
 
 		 161 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678742  normal  0.723292 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4674  hypothetical protein  61.22 
 
 		 161 aa  178  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.533703 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3321  hypothetical protein  57.14 
 
 		 161 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2562  hypothetical protein  55.84 
 
 		 161 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.559467  normal  0.419528 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5202  hypothetical protein  61.22 
 
 		 161 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730727  normal  0.1349 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0774  hypothetical protein  32.67 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1133  hypothetical protein  29.84 
 
 		 159 aa  50.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0774875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>