More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2716 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1055  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 309 aa  586  1e-166  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.234404  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2716  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 292 aa  585  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0320253 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3003  LysR family transcriptional regulator  87.33 
 
 		 292 aa  531  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal  0.209917 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2599  LysR family transcriptional regulator  59.66 
 
 		 292 aa  354  7.999999999999999e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513186 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0761  LysR family transcriptional regulator  58.28 
 
 		 306 aa  335  5e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0355  transcriptional regulator  56.51 
 
 		 293 aa  322  6e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.837334  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3600  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 307 aa  172  5.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0857675  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1371  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2474  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0412  LysR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  32.52 
 
 		 294 aa  136  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4075  LysR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 297 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4291  LysR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 297 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3448  LysR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 291 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3832  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.524021 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1792  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3318  LysR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0148  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 307 aa  127  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.148101  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3487  LysR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5946  transcriptional regulator LysR family  30.53 
 
 		 312 aa  125  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2895  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 313 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521914  normal  0.0431936 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3295  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2950  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 297 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1595  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 297 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0923411 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3868  transcriptional regulator, LysR family  30.51 
 
 		 315 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0937  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 332 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5834  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 315 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5026  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 315 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111623  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33750  LysR family transcriptional regulator protein  30.34 
 
 		 293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1317  transcriptional regulator, LysR family  32.42 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2478  LysR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 319 aa  120  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.585884  normal  0.517095 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5996  transcriptional regulator, LysR family  31.86 
 
 		 296 aa  119  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0861093  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1517  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 332 aa  119  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000321062  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0619  LysR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 301 aa  119  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.415419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4345  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 315 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3045  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8528  transcriptional regulator, LysR family  31.76 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1833  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1158  LysR substrate-binding  32.08 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326337 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1155  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0046037  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2367  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0895  LysR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.163696 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1766  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3202  transcriptional regulator, LysR family  34.1 
 
 		 294 aa  116  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.276424  normal  0.7211 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2844  transcriptional regulator, LysR family  30.5 
 
 		 300 aa  115  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.223887  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6141  LysR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1750  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286779  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3972  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5828  transcriptional regulator, LysR family  30.74 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1763  HTH-type transcriptional regulator  29.86 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4581  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 298 aa  114  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.325536 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4668  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 306 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35051  normal  0.639352 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3792  LysR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 296 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0906845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3700  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 306 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01990  transcriptional regulator transcription regulator protein  33.81 
 
 		 302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1560  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0825  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 293 aa  113  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0706  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 293 aa  112  5e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.265048  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2175  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 304 aa  112  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.823288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3189  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 279 aa  112  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4514  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 292 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.973008 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3705  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217893  normal  0.044305 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3834  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.96 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1039  transcriptional regulator, LysR family  31.83 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5018  LysR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.448472 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3977  transcriptional regulatory protein  31.62 
 
 		 315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.121113 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3258  transcriptional regulator, LysR family  30.21 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2194  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.569492 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4282  LysR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.352562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2606  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681878 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4540  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 339 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0590293  normal  0.826937 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5632  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090076  normal  0.419487 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3202  transcriptional regulator, LysR family  29.45 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4279  LysR substrate-binding  30.85 
 
 		 334 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2010  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 303 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1814  transcriptional regulator, LysR family  30.1 
 
 		 303 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 294 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0173  LysR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 298 aa  108  9.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0103543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1135  LysR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0556811  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4405  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1119  LysR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4049  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0950657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4317  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4058  LysR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal  0.387119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7356  LysR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3476  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0142034 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0977  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 311 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.465087  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4610  transcriptional regulator, LysR family  27.12 
 
 		 307 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0055  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 294 aa  105  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3528  transcriptional regulator, LysR family  28.08 
 
 		 298 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0086237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3786  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 302 aa  105  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0822  LysR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 309 aa  105  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895804 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5666  LysR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 306 aa  105  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.381574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0649  LysR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 301 aa  105  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.33789 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0242  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 318 aa  105  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0562  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 296 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00274587  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2147  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 297 aa  104  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.576835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>