More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0148 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0148  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 307 aa  623  1e-177  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.148101  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3189  LysR family transcriptional regulator  47.19 
 
 		 279 aa  250  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1371  LysR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 308 aa  241  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3779  LysR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 292 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.750193 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5946  transcriptional regulator LysR family  40.42 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3832  LysR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 290 aa  217  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.524021 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3052  LysR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 292 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3293  LysR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 301 aa  206  4e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185242  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2367  LysR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 299 aa  205  9e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2844  transcriptional regulator, LysR family  40.79 
 
 		 300 aa  199  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.223887  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4279  LysR substrate-binding  42.25 
 
 		 334 aa  195  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4646  transcriptional regulator, LysR family  42.75 
 
 		 312 aa  188  9e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0479434  normal  0.927807 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4796  transcriptional regulator, LysR family  39.1 
 
 		 292 aa  183  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511675  normal  0.87125 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3977  transcriptional regulatory protein  35.92 
 
 		 315 aa  176  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.121113 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4178  LysR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 294 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3974  LysR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 328 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.140467 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2886  LysR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 299 aa  169  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0958949  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1860  LysR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 328 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0547107 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1565  transcriptional regulator, LysR family  34.14 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3178  transcriptional regulator, LysR family  37.06 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3503  transcriptional regulator, LysR family  36.75 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.061821 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4310  LysR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3308  transcription regulator protein  36.07 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.31701  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2895  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521914  normal  0.0431936 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1782  LysR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 302 aa  159  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5348  LysR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 290 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261949 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 294 aa  156  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5209  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 349 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405506  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5300  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 349 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.233752 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0173  LysR family transcriptional regulator  35.13 
 
 		 290 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130123 
 
 
-
 
NC_003296  RS03181  transcription regulator protein  36.88 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.30577 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0722  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 294 aa  147  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3188  LysR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 291 aa  147  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.708036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0825  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 303 aa  146  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0343  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 313 aa  145  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294854  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0372  transcriptional regulator, LysR family  33.77 
 
 		 313 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103497  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0359  transcriptional regulator, LysR family  33.77 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0121795  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1039  transcriptional regulator, LysR family  35.64 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1135  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0556811  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2707  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.94 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0135797  normal  0.0584976 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0977  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.465087  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2478  LysR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 319 aa  139  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.585884  normal  0.517095 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1441  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 322 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0706  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.265048  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2973  putative transcriptional regulator  35.42 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35250  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.587508 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0840  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 288 aa  136  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 291 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4568  transcriptional regulator, LysR family  32.19 
 
 		 298 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.759587 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0412  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 319 aa  132  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744171  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2903  transcriptional regulator, LysR family  35.19 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0770921  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0761  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 306 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0386  transcriptional regulator, LysR family  31.42 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447442 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3944  transcriptional regulator, LysR family  32.28 
 
 		 296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4075  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4291  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0355  transcriptional regulator  30.27 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.837334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3448  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2599  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513186 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3368  transcriptional regulator, LysR family  31.08 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5996  transcriptional regulator, LysR family  32.53 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0861093  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3003  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal  0.209917 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1036  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 294 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3318  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2474  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1898  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 297 aa  123  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1335  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 290 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33750  LysR family transcriptional regulator protein  31.74 
 
 		 293 aa  122  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6141  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 290 aa  123  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3487  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 293 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2454  LysR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.262838 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1459  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 313 aa  122  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4581  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.325536 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1055  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.234404  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1665  LysR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1517  LysR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000321062  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3839  LysR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2881  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2716  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0320253 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0822  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895804 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4610  transcriptional regulator, LysR family  30.88 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2289  transcriptional regulator, LysR family  32.23 
 
 		 293 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6804  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 307 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2522  transcriptional regulator, LysR family  32.86 
 
 		 295 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2194  LysR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 307 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.569492 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3295  LysR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 291 aa  119  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2754  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 296 aa  119  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4514  LysR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 292 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.973008 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1452  LysR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 297 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1833  LysR family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 301 aa  119  7.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1511  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 307 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_004310  BR1498  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1449  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1139  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7466  LysR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0921  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4214  transcriptional regulator, LysR family  31.34 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1163  LysR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 302 aa  118  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0513679  normal  0.0450168 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>