More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1782 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I1782  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 302 aa  598  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1565  transcriptional regulator, LysR family  65.41 
 
 		 302 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4178  LysR family transcriptional regulator  52.74 
 
 		 294 aa  317  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3503  transcriptional regulator, LysR family  47.77 
 
 		 293 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.061821 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3178  transcriptional regulator, LysR family  48.11 
 
 		 293 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3308  transcription regulator protein  48.97 
 
 		 294 aa  263  4e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.31701  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4310  LysR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35250  LysR family transcriptional regulator  45.3 
 
 		 298 aa  231  9e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.587508 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5300  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 349 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.233752 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5209  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 349 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405506  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0173  LysR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 290 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130123 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2973  putative transcriptional regulator  44.95 
 
 		 295 aa  229  6e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5348  LysR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 290 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261949 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2707  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  41.72 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0135797  normal  0.0584976 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2903  transcriptional regulator, LysR family  43.01 
 
 		 300 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0770921  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1371  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 308 aa  169  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0148  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.148101  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5946  transcriptional regulator LysR family  33.68 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3189  LysR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 279 aa  142  6e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3832  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 290 aa  136  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.524021 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3944  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4279  LysR substrate-binding  32.14 
 
 		 334 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4796  transcriptional regulator, LysR family  32.5 
 
 		 292 aa  126  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511675  normal  0.87125 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2474  LysR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6740  transcriptional regulator, LysR family  27.34 
 
 		 317 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0653  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 325 aa  122  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0343  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 313 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294854  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4646  transcriptional regulator, LysR family  32.14 
 
 		 312 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0479434  normal  0.927807 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0359  transcriptional regulator, LysR family  32.75 
 
 		 313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0121795  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0372  transcriptional regulator, LysR family  32.39 
 
 		 313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103497  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3293  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185242  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3974  LysR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.140467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1860  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 328 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0547107 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5824  transcriptional regulator, LysR family  26.74 
 
 		 317 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2895  LysR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 313 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521914  normal  0.0431936 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2886  LysR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0958949  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3052  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 292 aa  116  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 301 aa  116  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3779  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 292 aa  116  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.750193 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2863  LysR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 315 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753001 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4928  LysR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 307 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.595965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2367  LysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2844  transcriptional regulator, LysR family  28.83 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.223887  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4731  helix-turn-helix, Fis-type  32.52 
 
 		 288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210244  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0722  LysR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 294 aa  112  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1898  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 297 aa  112  8.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4514  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 292 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.973008 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0840  LysR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03181  transcription regulator protein  31.93 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.30577 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5961  LysR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3977  transcriptional regulatory protein  28.98 
 
 		 315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.121113 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4058  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal  0.387119 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0937  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4668  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 306 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35051  normal  0.639352 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3700  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 306 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01990  transcriptional regulator transcription regulator protein  32.07 
 
 		 302 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0893  LysR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0952  LysR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1441  LysR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6141  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3293  hypothetical protein  27.11 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1155  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0046037  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1039  transcriptional regulator, LysR family  35.53 
 
 		 311 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 291 aa  106  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3868  transcriptional regulator, LysR family  27.72 
 
 		 315 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5632  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 290 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090076  normal  0.419487 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2385  LysR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 289 aa  106  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0716599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1403  LysR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 304 aa  105  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1750  transcriptional regulator, LysR family  29.86 
 
 		 324 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286779  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0977  LysR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 311 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.465087  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  31.1 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8528  transcriptional regulator, LysR family  29.86 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2194  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.569492 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7466  LysR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5834  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 315 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2152  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 318 aa  102  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3188  LysR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 291 aa  102  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.708036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5026  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 315 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111623  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3298  LysR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 313 aa  102  8e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.683062  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4030  LysR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 313 aa  102  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.653642  normal  0.928184 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2523  transcriptional regulator, LysR family  28.47 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4345  LysR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1317  transcriptional regulator, LysR family  29.21 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2725  LysR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 283 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1552  LysR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 287 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0365883  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1792  LysR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0825  LysR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1259  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 284 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6201  transcriptional regulator, LysR family  30.27 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2769  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3048  LysR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.104991 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0492  transcriptional regulator, LysR family  30.77 
 
 		 283 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0963862 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3213  LysR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 294 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.772963  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3786  LysR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 302 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5018  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 294 aa  99.4  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.448472 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6115  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.03 
 
 		 289 aa  99.4  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3045  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1560  LysR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 291 aa  98.2  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3487  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 293 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475425  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>