More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2385 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2385  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 289 aa  567  1e-161  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0716599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2769  LysR family transcriptional regulator  66.2 
 
 		 301 aa  386  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0492  transcriptional regulator, LysR family  62.64 
 
 		 283 aa  326  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0963862 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1154  LysR family transcriptional regulator  63.5 
 
 		 300 aa  323  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1259  LysR family transcriptional regulator  62.84 
 
 		 284 aa  319  3e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4731  helix-turn-helix, Fis-type  61.17 
 
 		 288 aa  318  6e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210244  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0448  transcriptional regulator, LysR family  62.64 
 
 		 283 aa  318  6e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.631201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6115  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  61 
 
 		 289 aa  309  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4165  LysR family transcriptional regulator  57.41 
 
 		 289 aa  306  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6201  transcriptional regulator, LysR family  57.95 
 
 		 334 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3834  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  53.71 
 
 		 295 aa  301  1e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2725  LysR family transcriptional regulator  50.36 
 
 		 283 aa  271  6e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4767  LysR family transcriptional regulator  51.34 
 
 		 286 aa  268  7e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1441  LysR family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0372  transcriptional regulator, LysR family  39.02 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103497  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0343  LysR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 313 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294854  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0359  transcriptional regulator, LysR family  38.68 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0121795  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 294 aa  158  8e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2895  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 313 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521914  normal  0.0431936 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 291 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7356  LysR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 305 aa  152  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 301 aa  149  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2448  LysR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 303 aa  149  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3786  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2194  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 307 aa  143  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.569492 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1039  transcriptional regulator, LysR family  36.13 
 
 		 311 aa  142  9e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1155  LysR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 304 aa  142  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0046037  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_003296  RS01990  transcriptional regulator transcription regulator protein  37.37 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7466  LysR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0977  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.465087  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0619  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.415419  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0952  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 304 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5824  transcriptional regulator, LysR family  34.97 
 
 		 317 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0893  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 304 aa  139  4.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6740  transcriptional regulator, LysR family  35.31 
 
 		 317 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2010  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 303 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1814  transcriptional regulator, LysR family  35.71 
 
 		 303 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4282  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.352562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4514  LysR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.973008 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0688  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.04 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2577  LysR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0242  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 318 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0384  transcriptional regulator, LysR family  33.69 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0197813 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  33.92 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1403  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0997  LysR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2721  LysR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0781  transcriptional regulator, LysR family  32.04 
 
 		 314 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2606  LysR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 295 aa  136  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681878 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3700  LysR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 306 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4668  LysR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 306 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35051  normal  0.639352 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0417  transcriptional regulator, LysR family  34.04 
 
 		 293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234573  hitchhiker  0.000746298 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1898  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 297 aa  135  9e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4697  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 299 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0766  LysR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.207763 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6141  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 290 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4175  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 299 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.825344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33750  LysR family transcriptional regulator protein  33.93 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1335  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4540  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0590293  normal  0.826937 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5632  LysR family transcriptional regulator  37.81 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090076  normal  0.419487 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0835  transcriptional regulator LysR family  35.27 
 
 		 293 aa  133  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4666  LysR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 316 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal  0.172024 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3476  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0142034 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2478  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 319 aa  132  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.585884  normal  0.517095 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 293 aa  132  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0173  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 298 aa  132  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0103543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2863  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 315 aa  132  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753001 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1750  transcriptional regulator, LysR family  30.28 
 
 		 324 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286779  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3045  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 297 aa  132  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4668  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 316 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4532  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.176427  normal  0.951111 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0921  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3810  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 299 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418833  hitchhiker  0.00695796 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4317  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4049  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0950657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2523  transcriptional regulator, LysR family  31.47 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5018  LysR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.448472 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2031  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.810813  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3911  transcriptional regulator, LysR family  35.82 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3951  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.358181 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3798  transcriptional regulator, LysR family  35.82 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.244352 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3444  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3318  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 293 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49680  transcriptional regulator  32.98 
 
 		 291 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1833  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 301 aa  129  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3298  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 313 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.683062  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1517  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 332 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000321062  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4030  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 313 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.653642  normal  0.928184 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4345  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 315 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1371  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 308 aa  129  8.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3293  hypothetical protein  32.76 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5026  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111623  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5834  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1766  LysR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5492  LysR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28545 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4790  LysR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8528  transcriptional regulator, LysR family  32.18 
 
 		 298 aa  126  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3258  transcriptional regulator, LysR family  32.86 
 
 		 298 aa  126  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2474  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  normal  0.197273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>