More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0921 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0921  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 300 aa  599  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4697  LysR family transcriptional regulator  89.6 
 
 		 299 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4175  LysR family transcriptional regulator  89.6 
 
 		 299 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.825344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5492  LysR family transcriptional regulator  89.33 
 
 		 300 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28545 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4790  LysR family transcriptional regulator  89.33 
 
 		 328 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3810  LysR family transcriptional regulator  87.5 
 
 		 299 aa  489  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418833  hitchhiker  0.00695796 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0997  LysR family transcriptional regulator  64.41 
 
 		 315 aa  367  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2577  LysR family transcriptional regulator  64.41 
 
 		 315 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2721  LysR family transcriptional regulator  64.41 
 
 		 322 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3202  transcriptional regulator, LysR family  61.3 
 
 		 298 aa  355  5.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3528  transcriptional regulator, LysR family  60.48 
 
 		 298 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0086237 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3334  transcription regulator protein  61.99 
 
 		 298 aa  349  4e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1988  LysR family transcriptional regulator  56.9 
 
 		 302 aa  322  7e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5666  LysR family transcriptional regulator  56.51 
 
 		 306 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.381574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02817  transcriptional regulator LysR family  56.12 
 
 		 304 aa  306  2.0000000000000002e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3145  transcriptional regulator LysR family  54.05 
 
 		 300 aa  305  5.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.813565  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5772  LysR family transcriptional regulator  59.86 
 
 		 299 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189164  normal  0.699702 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5996  transcriptional regulator, LysR family  57.09 
 
 		 296 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0861093  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2989  transcriptional regulator, LysR family  57.29 
 
 		 299 aa  298  9e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0878749 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2728  transcriptional regulator, LysR family  55.29 
 
 		 299 aa  289  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0649  LysR family transcriptional regulator  54.83 
 
 		 301 aa  285  7e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.33789 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0822  LysR family transcriptional regulator  51.2 
 
 		 309 aa  266  2.9999999999999995e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895804 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1637  transcriptional regulator, LysR family  52.88 
 
 		 298 aa  265  8e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0972264 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4581  LysR family transcriptional regulator  49.31 
 
 		 298 aa  259  4e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.325536 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0511  LysR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 293 aa  257  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1459  LysR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 313 aa  236  3e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3213  LysR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.772963  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3491  LysR family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 325 aa  208  8e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155572  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1979  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 318 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00673932 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1363  LysR family transcriptional regulator  68.21 
 
 		 152 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.290883  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1559  LysR family transcriptional regulator  68.21 
 
 		 152 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0127  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 295 aa  199  5e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1512  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 307 aa  197  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.607249  normal  0.542943 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2937  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 318 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0798  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.748427  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1748  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 303 aa  179  5.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.056741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  36.33 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1441  LysR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 322 aa  165  8e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0706  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 293 aa  162  9e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.265048  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0825  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 303 aa  155  6e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1163  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 302 aa  155  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0513679  normal  0.0450168 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5026  LysR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 315 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111623  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5834  LysR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 315 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1833  LysR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 301 aa  153  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4345  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1766  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2606  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681878 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3295  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 291 aa  149  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2010  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 303 aa  149  5e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1814  transcriptional regulator, LysR family  33.92 
 
 		 303 aa  149  6e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1390  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3045  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 297 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3705  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217893  normal  0.044305 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0384  transcriptional regulator, LysR family  31.69 
 
 		 293 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0197813 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49680  transcriptional regulator  36.43 
 
 		 291 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 291 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0323  LysR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.23256 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2478  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.585884  normal  0.517095 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0372  transcriptional regulator, LysR family  35.64 
 
 		 313 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103497  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0359  transcriptional regulator, LysR family  36.61 
 
 		 313 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0121795  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4478  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.515823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4291  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 297 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4075  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 297 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1608  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 297 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0270866 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2965  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 297 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4282  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 288 aa  142  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.352562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1750  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 324 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286779  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3448  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6141  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0835  transcriptional regulator LysR family  34.39 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33750  LysR family transcriptional regulator protein  32.53 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3293  LysR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 301 aa  140  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185242  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0071  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000017949 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0343  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 313 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294854  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0071  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 295 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.328388  hitchhiker  0.00942011 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2523  transcriptional regulator, LysR family  31.25 
 
 		 300 aa  139  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2769  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 301 aa  139  7.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0417  transcriptional regulator, LysR family  31.34 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234573  hitchhiker  0.000746298 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3318  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 293 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 294 aa  136  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3258  transcriptional regulator, LysR family  31.94 
 
 		 298 aa  136  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1139  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 306 aa  136  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7356  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 305 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3786  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 302 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4317  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 319 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1317  transcriptional regulator, LysR family  34.24 
 
 		 298 aa  135  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4049  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 319 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0950657  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0055  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 295 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5018  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 294 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.448472 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3476  LysR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 319 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0142034 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3487  LysR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 293 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0412  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1158  LysR substrate-binding  33.22 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326337 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0979  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  29.68 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0074  LysR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.183793  hitchhiker  0.0000000265009 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3834  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.21 
 
 		 295 aa  132  6e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0881  LysR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 316 aa  132  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3247  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 301 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3868  transcriptional regulator, LysR family  32.34 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>