More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0372 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0372  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 313 aa  607  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103497  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0359  transcriptional regulator, LysR family  98.72 
 
 		 313 aa  598  1e-170  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0121795  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0343  LysR family transcriptional regulator  96.47 
 
 		 313 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294854  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2895  LysR family transcriptional regulator  71.79 
 
 		 313 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521914  normal  0.0431936 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0977  LysR family transcriptional regulator  65.44 
 
 		 311 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.465087  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1039  transcriptional regulator, LysR family  64.77 
 
 		 311 aa  348  4e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1036  transcriptional regulator, LysR family  62.75 
 
 		 294 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01990  transcriptional regulator transcription regulator protein  45.21 
 
 		 302 aa  209  5e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7466  LysR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 290 aa  192  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 294 aa  190  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3798  transcriptional regulator, LysR family  43.71 
 
 		 298 aa  186  6e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.244352 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3911  transcriptional regulator, LysR family  43.71 
 
 		 298 aa  186  6e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1335  LysR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 290 aa  179  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3293  LysR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185242  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1199  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 313 aa  177  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7356  LysR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 305 aa  176  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5632  LysR family transcriptional regulator  40.42 
 
 		 290 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090076  normal  0.419487 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3700  LysR family transcriptional regulator  40.42 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4668  LysR family transcriptional regulator  40.42 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35051  normal  0.639352 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1155  LysR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0046037  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3944  transcriptional regulator, LysR family  40.41 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2769  LysR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 301 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5018  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 294 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.448472 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4514  LysR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 292 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.973008 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4058  LysR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 306 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal  0.387119 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1517  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 332 aa  169  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000321062  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1441  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 322 aa  169  8e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6740  transcriptional regulator, LysR family  36.62 
 
 		 317 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2448  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 303 aa  166  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3048  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.104991 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5824  transcriptional regulator, LysR family  35.92 
 
 		 317 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6201  transcriptional regulator, LysR family  33.46 
 
 		 334 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4291  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4075  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2194  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 307 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.569492 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3448  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 291 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5946  transcriptional regulator LysR family  34.46 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1089  LysR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 300 aa  159  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3487  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 293 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3834  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.69 
 
 		 295 aa  158  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2010  LysR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 303 aa  158  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1139  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0071  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000017949 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2725  LysR family transcriptional regulator  34.28 
 
 		 283 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0126  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 287 aa  156  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0071  LysR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 295 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.328388  hitchhiker  0.00942011 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1705  transcriptional regulator, LysR family  40.4 
 
 		 302 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368943  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3433  transcriptional regulator LysR family  36.33 
 
 		 297 aa  156  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1814  transcriptional regulator, LysR family  33.9 
 
 		 303 aa  155  6e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1403  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 304 aa  155  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2385  LysR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 289 aa  155  7e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0716599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3295  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 291 aa  155  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3705  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 300 aa  155  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217893  normal  0.044305 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1560  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 291 aa  155  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0055  LysR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 295 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1371  LysR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0952  LysR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 304 aa  153  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1750  transcriptional regulator, LysR family  34.28 
 
 		 324 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286779  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2242  LysR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 301 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163141  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2478  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 319 aa  152  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.585884  normal  0.517095 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1898  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 297 aa  153  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1632  transcriptional regulator, LysR family  39.74 
 
 		 302 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0893  LysR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 304 aa  152  5.9999999999999996e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0074  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.183793  hitchhiker  0.0000000265009 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0706  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.265048  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0492  transcriptional regulator, LysR family  35.58 
 
 		 283 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0963862 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1259  LysR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 284 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4214  transcriptional regulator, LysR family  36.84 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2367  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2863  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753001 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0555  transcriptional regulator LysR family  36.3 
 
 		 280 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3357  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 295 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.485418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3832  LysR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 290 aa  149  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.524021 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  35.23 
 
 		 294 aa  149  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 301 aa  149  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0653  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 291 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4666  LysR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal  0.172024 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1150  LysR family transcriptional regulator  39 
 
 		 300 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4668  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4731  helix-turn-helix, Fis-type  33.33 
 
 		 288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210244  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6193  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 288 aa  146  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0876  transcriptional regulator, LysR family  32.63 
 
 		 296 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3207  transcriptional regulator, LysR family  29.68 
 
 		 302 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118279  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3974  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 328 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.140467 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0722  LysR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 294 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4532  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 316 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.176427  normal  0.951111 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2389  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 283 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0148  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 307 aa  144  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.148101  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6115  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.72 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1860  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0547107 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0881  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5963  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0185947 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4540  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0590293  normal  0.826937 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0937  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 332 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1478  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 287 aa  144  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1348  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 286 aa  143  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.283314  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2844  transcriptional regulator, LysR family  32.66 
 
 		 300 aa  143  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.223887  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0173  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 298 aa  143  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0103543  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3369  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 283 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00237825  normal  0.187078 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>