More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0417 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0417  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 293 aa  591  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234573  hitchhiker  0.000746298 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0384  transcriptional regulator, LysR family  93.86 
 
 		 293 aa  559  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0197813 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0323  LysR family transcriptional regulator  80.55 
 
 		 293 aa  492  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.23256 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0835  transcriptional regulator LysR family  77.82 
 
 		 293 aa  472  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  63.36 
 
 		 293 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1833  LysR family transcriptional regulator  61.3 
 
 		 301 aa  377  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1766  LysR family transcriptional regulator  61.3 
 
 		 308 aa  377  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3318  LysR family transcriptional regulator  57.19 
 
 		 293 aa  346  2e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1792  LysR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 295 aa  288  6e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  51.42 
 
 		 301 aa  278  6e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3247  LysR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 301 aa  277  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1139  LysR family transcriptional regulator  50.53 
 
 		 306 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4214  transcriptional regulator, LysR family  49.11 
 
 		 304 aa  268  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2522  transcriptional regulator, LysR family  48.75 
 
 		 295 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2194  LysR family transcriptional regulator  48.49 
 
 		 307 aa  265  7e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.569492 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0619  LysR family transcriptional regulator  45.73 
 
 		 301 aa  255  5e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.415419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0881  LysR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 316 aa  246  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2474  LysR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3786  LysR family transcriptional regulator  44.84 
 
 		 302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1089  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 300 aa  232  6e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4540  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 339 aa  228  8e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0590293  normal  0.826937 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0074  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 295 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.183793  hitchhiker  0.0000000265009 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0055  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 295 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2523  transcriptional regulator, LysR family  41.75 
 
 		 300 aa  226  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0071  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 295 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.328388  hitchhiker  0.00942011 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0071  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 295 aa  225  8e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000017949 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3476  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 319 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0142034 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3357  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 295 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.485418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4317  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 319 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4049  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 319 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0950657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6740  transcriptional regulator, LysR family  41.18 
 
 		 317 aa  218  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2863  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 315 aa  218  7.999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753001 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5824  transcriptional regulator, LysR family  41.18 
 
 		 317 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3293  hypothetical protein  41.9 
 
 		 312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3258  transcriptional regulator, LysR family  37.76 
 
 		 298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16380  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1425  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4030  LysR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 313 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.653642  normal  0.928184 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3298  LysR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 313 aa  212  7e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.683062  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0242  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 318 aa  211  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4478  LysR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 297 aa  211  9e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.515823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1605  LysR family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0688  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.63 
 
 		 315 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3246  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 296 aa  209  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.742909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2606  LysR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 295 aa  209  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681878 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4532  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 316 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.176427  normal  0.951111 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4668  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 316 aa  208  7e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2010  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 303 aa  207  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1814  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 303 aa  207  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5018  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.448472 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4666  LysR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 316 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal  0.172024 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2031  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.810813  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3951  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.358181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0694  LysR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 329 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3444  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 323 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1390  LysR family transcriptional regulator  41.87 
 
 		 297 aa  205  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0173  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0103543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0766  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 338 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.207763 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0781  transcriptional regulator, LysR family  36.27 
 
 		 314 aa  202  7e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3421  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 305 aa  196  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1560  LysR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 291 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1608  LysR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 297 aa  195  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0270866 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2965  LysR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 297 aa  195  6e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3578  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 317 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4928  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.595965  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0952  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 304 aa  191  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0893  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 304 aa  190  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1718  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 305 aa  189  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10670  transcriptional regulator, LysR family  37.41 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.370922  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3705  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 300 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217893  normal  0.044305 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1403  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 304 aa  186  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1914  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0653  LysR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 325 aa  178  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2152  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 318 aa  175  9e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5961  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 307 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01514  transcriptional regulatory protein  34.52 
 
 		 289 aa  170  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1107  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1746  HTH-type transcriptional regulator  36.43 
 
 		 297 aa  169  6e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.747991 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0854  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 316 aa  168  9e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0937  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2175  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 304 aa  166  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.823288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3048  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 310 aa  165  8e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.104991 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  32.07 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3868  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1750  transcriptional regulator, LysR family  31.38 
 
 		 324 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286779  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1898  LysR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8528  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1441  LysR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 322 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1119  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3295  LysR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 291 aa  159  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1763  HTH-type transcriptional regulator  33.56 
 
 		 300 aa  159  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3202  transcriptional regulator, LysR family  34.84 
 
 		 294 aa  159  7e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.276424  normal  0.7211 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1317  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 		 298 aa  158  8e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0364  LysR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 311 aa  157  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3972  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 313 aa  154  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3792  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0906845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4581  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.325536 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0576  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 		 313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.268348 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5828  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>