More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7356 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7356  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 305 aa  617  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1335  LysR family transcriptional regulator  47.16 
 
 		 290 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1517  LysR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 332 aa  246  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000321062  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7466  LysR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 290 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146793  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01990  transcriptional regulator transcription regulator protein  47.31 
 
 		 302 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2557  LysR family transcriptional regulator  45.91 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.748722  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3369  LysR family transcriptional regulator  45.55 
 
 		 283 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00237825  normal  0.187078 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1348  LysR family transcriptional regulator  44.49 
 
 		 286 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.283314  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0876  transcriptional regulator, LysR family  43.1 
 
 		 296 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3073  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  42.09 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.857861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2389  LysR family transcriptional regulator  45.2 
 
 		 283 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3433  transcriptional regulator LysR family  46.26 
 
 		 297 aa  219  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3207  transcriptional regulator, LysR family  39.8 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118279  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5963  transcriptional regulator, LysR family  42.75 
 
 		 297 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0185947 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0126  LysR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 287 aa  208  9e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0673  LysR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 290 aa  202  5e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.294522 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0555  transcriptional regulator LysR family  43.17 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3798  transcriptional regulator, LysR family  46.24 
 
 		 298 aa  199  6e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.244352 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3911  transcriptional regulator, LysR family  46.24 
 
 		 298 aa  199  6e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6193  LysR family transcriptional regulator  48.55 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1155  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 304 aa  188  9e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0046037  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2895  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 313 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521914  normal  0.0431936 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5632  LysR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 290 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090076  normal  0.419487 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3700  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4668  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35051  normal  0.639352 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4514  LysR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 292 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.973008 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4058  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal  0.387119 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0359  transcriptional regulator, LysR family  37.28 
 
 		 313 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0121795  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0372  transcriptional regulator, LysR family  36.92 
 
 		 313 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103497  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0343  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 313 aa  175  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294854  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0619  LysR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 301 aa  172  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.415419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3834  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.31 
 
 		 295 aa  171  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2725  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 283 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1039  transcriptional regulator, LysR family  38.35 
 
 		 311 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6740  transcriptional regulator, LysR family  34.63 
 
 		 317 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0977  LysR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 311 aa  165  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.465087  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1814  transcriptional regulator, LysR family  35.66 
 
 		 303 aa  163  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2010  LysR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 303 aa  163  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 294 aa  163  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5824  transcriptional regulator, LysR family  34.04 
 
 		 317 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2194  LysR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 307 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.569492 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4291  LysR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3487  LysR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4075  LysR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2448  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 303 aa  162  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3448  LysR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 291 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2474  LysR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 307 aa  159  8e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 291 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1441  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 322 aa  156  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3258  transcriptional regulator, LysR family  34.75 
 
 		 298 aa  156  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4731  helix-turn-helix, Fis-type  32.98 
 
 		 288 aa  155  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210244  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6201  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 334 aa  155  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0798  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 299 aa  154  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.748427  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  33.92 
 
 		 294 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2606  LysR family transcriptional regulator  34.49 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681878 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2523  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 		 300 aa  153  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 301 aa  152  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1560  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0937  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1478  LysR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3293  LysR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 301 aa  149  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185242  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3977  transcriptional regulatory protein  31.93 
 
 		 315 aa  149  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.121113 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1403  LysR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 304 aa  149  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0881  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 316 aa  149  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0952  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3944  transcriptional regulator, LysR family  35.87 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3868  transcriptional regulator, LysR family  34.97 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0893  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 304 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1036  transcriptional regulator, LysR family  36.2 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1898  LysR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2478  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.585884  normal  0.517095 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8528  transcriptional regulator, LysR family  31.8 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1259  LysR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1154  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0706  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.265048  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4165  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 289 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3705  LysR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 300 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217893  normal  0.044305 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4282  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 288 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.352562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2863  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753001 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1425  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5018  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.448472 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0492  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0963862 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2769  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 301 aa  144  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1750  transcriptional regulator, LysR family  31.91 
 
 		 324 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286779  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16380  LysR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 301 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4345  LysR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 315 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1158  LysR substrate-binding  31.82 
 
 		 317 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326337 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5834  LysR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3786  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5026  LysR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111623  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0173  LysR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0103543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2385  LysR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 289 aa  139  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0716599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33750  LysR family transcriptional regulator protein  32.98 
 
 		 293 aa  140  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1915  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.66 
 
 		 281 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1199  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 313 aa  139  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0448  transcriptional regulator, LysR family  32.59 
 
 		 283 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.631201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3295  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 291 aa  139  8.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3045  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1317  transcriptional regulator, LysR family  32.16 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4030  LysR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.653642  normal  0.928184 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>