More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1259 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1259  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 284 aa  557  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1154  LysR family transcriptional regulator  70.88 
 
 		 300 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2769  LysR family transcriptional regulator  62.99 
 
 		 301 aa  356  2.9999999999999997e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3834  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  60.99 
 
 		 295 aa  354  1e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0492  transcriptional regulator, LysR family  65.25 
 
 		 283 aa  345  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0963862 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6201  transcriptional regulator, LysR family  64.66 
 
 		 334 aa  344  8e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4731  helix-turn-helix, Fis-type  64.23 
 
 		 288 aa  344  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210244  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0448  transcriptional regulator, LysR family  64.77 
 
 		 283 aa  342  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.631201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4165  LysR family transcriptional regulator  62.19 
 
 		 289 aa  337  9e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6115  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  62.55 
 
 		 289 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2385  LysR family transcriptional regulator  63.35 
 
 		 289 aa  324  1e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0716599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4767  LysR family transcriptional regulator  56.18 
 
 		 286 aa  298  8e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2725  LysR family transcriptional regulator  50.55 
 
 		 283 aa  268  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2895  LysR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 313 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521914  normal  0.0431936 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0372  transcriptional regulator, LysR family  36.56 
 
 		 313 aa  165  9e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103497  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0359  transcriptional regulator, LysR family  36.92 
 
 		 313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0121795  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 294 aa  163  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0343  LysR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 313 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294854  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7356  LysR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 305 aa  161  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2448  LysR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 303 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1441  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 322 aa  152  4e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1039  transcriptional regulator, LysR family  37.18 
 
 		 311 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0977  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.465087  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7466  LysR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 291 aa  146  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 301 aa  146  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3786  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 302 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3448  LysR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  32.75 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1335  LysR family transcriptional regulator  35.13 
 
 		 290 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4291  LysR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4075  LysR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1517  LysR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000321062  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5632  LysR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 290 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090076  normal  0.419487 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1155  LysR family transcriptional regulator  37.81 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0046037  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0242  LysR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 318 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3700  LysR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 306 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4668  LysR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 306 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35051  normal  0.639352 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4514  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 292 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.973008 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4540  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 339 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0590293  normal  0.826937 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4282  LysR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 288 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.352562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33750  LysR family transcriptional regulator protein  31.94 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3487  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2194  LysR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 307 aa  136  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.569492 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0722  LysR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 294 aa  136  5e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1898  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 297 aa  135  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3977  transcriptional regulatory protein  30.28 
 
 		 315 aa  136  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.121113 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1371  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 308 aa  135  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1833  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 301 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3293  LysR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 301 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185242  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2226  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 286 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.359853  normal  0.0898053 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3578  LysR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 317 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4317  LysR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 319 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49680  transcriptional regulator  31.71 
 
 		 291 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4049  LysR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 319 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0950657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4058  LysR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 306 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal  0.387119 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1036  transcriptional regulator, LysR family  35.02 
 
 		 294 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0173  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 298 aa  132  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0103543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1766  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 308 aa  132  6e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3476  LysR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 319 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0142034 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0384  transcriptional regulator, LysR family  31.8 
 
 		 293 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0197813 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5018  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 294 aa  132  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.448472 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3951  LysR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.358181 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3444  LysR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0417  transcriptional regulator, LysR family  31.8 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234573  hitchhiker  0.000746298 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0619  LysR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.415419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2886  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0958949  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2031  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 319 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.810813  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0835  transcriptional regulator LysR family  32.17 
 
 		 293 aa  129  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3295  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 291 aa  129  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1814  transcriptional regulator, LysR family  34.03 
 
 		 303 aa  129  6e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0952  LysR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 304 aa  129  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6141  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 290 aa  129  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2010  LysR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 303 aa  129  6e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0688  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.46 
 
 		 315 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1089  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 300 aa  129  7.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0893  LysR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 304 aa  129  8.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2474  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2606  LysR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681878 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5824  transcriptional regulator, LysR family  31.83 
 
 		 317 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2478  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 319 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.585884  normal  0.517095 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0555  transcriptional regulator LysR family  33.57 
 
 		 280 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1750  transcriptional regulator, LysR family  29.5 
 
 		 324 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286779  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3308  transcription regulator protein  31.16 
 
 		 294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.31701  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1915  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.8 
 
 		 281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4668  LysR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 316 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5961  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 307 aa  125  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4532  LysR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 316 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.176427  normal  0.951111 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3318  LysR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 293 aa  125  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0781  transcriptional regulator, LysR family  27.56 
 
 		 314 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0323  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 293 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.23256 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6740  transcriptional regulator, LysR family  31.03 
 
 		 317 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1158  LysR substrate-binding  31.14 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326337 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1348  LysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.283314  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8528  transcriptional regulator, LysR family  30.74 
 
 		 298 aa  123  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3357  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 295 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.485418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4928  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.595965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1403  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 304 aa  122  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0854  LysR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 316 aa  122  8e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>