More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2886 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2886  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 299 aa  613  1e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0958949  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5946  transcriptional regulator LysR family  35.79 
 
 		 312 aa  192  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1371  LysR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 308 aa  179  4.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0148  LysR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 307 aa  179  5.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.148101  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2367  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 299 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2844  transcriptional regulator, LysR family  35.25 
 
 		 300 aa  169  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.223887  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3832  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 290 aa  166  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.524021 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2769  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3779  LysR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.750193 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3052  LysR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2478  LysR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 319 aa  160  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.585884  normal  0.517095 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4279  LysR substrate-binding  32.99 
 
 		 334 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3293  LysR family transcriptional regulator  34.28 
 
 		 301 aa  157  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185242  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4646  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 312 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0479434  normal  0.927807 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3977  transcriptional regulatory protein  31.53 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.121113 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4310  LysR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 304 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4796  transcriptional regulator, LysR family  32.19 
 
 		 292 aa  150  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511675  normal  0.87125 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3834  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.25 
 
 		 295 aa  148  9e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2707  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.51 
 
 		 295 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0135797  normal  0.0584976 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5348  LysR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 290 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261949 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5300  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 349 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.233752 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5209  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 349 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405506  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3189  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1135  LysR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0556811  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0492  transcriptional regulator, LysR family  35.42 
 
 		 283 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0963862 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3368  transcriptional regulator, LysR family  31.63 
 
 		 298 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1039  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 311 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2895  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521914  normal  0.0431936 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4568  transcriptional regulator, LysR family  31.31 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.759587 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0977  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.465087  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0173  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 290 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130123 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0386  transcriptional regulator, LysR family  31.29 
 
 		 298 aa  136  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447442 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6115  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.58 
 
 		 289 aa  135  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3974  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 328 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.140467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1860  LysR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0547107 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1259  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 284 aa  133  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2903  transcriptional regulator, LysR family  31.64 
 
 		 300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0770921  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35250  LysR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 298 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.587508 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2289  transcriptional regulator, LysR family  31.35 
 
 		 293 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4731  helix-turn-helix, Fis-type  29.86 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210244  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1441  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0722  LysR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2973  putative transcriptional regulator  32.27 
 
 		 295 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3295  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4165  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4178  LysR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 294 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0937  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 332 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1154  LysR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2725  LysR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3944  transcriptional regulator, LysR family  30.66 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01990  transcriptional regulator transcription regulator protein  32.29 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1898  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 297 aa  124  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7356  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2385  LysR family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 289 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0716599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0343  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 313 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294854  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1565  transcriptional regulator, LysR family  26.16 
 
 		 302 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0706  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 293 aa  123  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.265048  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 		 294 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4767  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 286 aa  122  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1335  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 290 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1517  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 332 aa  122  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000321062  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6201  transcriptional regulator, LysR family  30.34 
 
 		 334 aa  122  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1782  LysR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 302 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0372  transcriptional regulator, LysR family  30.39 
 
 		 313 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103497  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1199  LysR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1036  transcriptional regulator, LysR family  32.06 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0359  transcriptional regulator, LysR family  30.39 
 
 		 313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0121795  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4282  LysR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.352562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3188  LysR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.708036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3868  transcriptional regulator, LysR family  28.28 
 
 		 315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0448  transcriptional regulator, LysR family  32.29 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.631201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2111  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0551561  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4345  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3298  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 313 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.683062  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4030  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 313 aa  118  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.653642  normal  0.928184 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1665  LysR family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5834  LysR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5026  LysR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111623  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2881  LysR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6804  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3705  LysR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217893  normal  0.044305 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3448  LysR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 291 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1792  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 295 aa  116  6e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3178  transcriptional regulator, LysR family  25.18 
 
 		 293 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5859  transcriptional regulator, LysR family  29.41 
 
 		 315 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3433  transcriptional regulator LysR family  30.63 
 
 		 297 aa  115  8.999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4291  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 297 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4075  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 297 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2010  LysR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2454  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.262838 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2754  LysR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 296 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1814  transcriptional regulator, LysR family  29.45 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0562  LysR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 296 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00274587  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3293  hypothetical protein  30.61 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0555  transcriptional regulator LysR family  32.07 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3308  transcription regulator protein  28.07 
 
 		 294 aa  113  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.31701  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_004310  BR1498  LysR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3045  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>