More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3832 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3832  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 290 aa  564  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.524021 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4796  transcriptional regulator, LysR family  60.34 
 
 		 292 aa  310  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511675  normal  0.87125 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4279  LysR substrate-binding  59.45 
 
 		 334 aa  310  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4646  transcriptional regulator, LysR family  59.52 
 
 		 312 aa  298  9e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0479434  normal  0.927807 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2367  LysR family transcriptional regulator  55.36 
 
 		 299 aa  290  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2844  transcriptional regulator, LysR family  52.94 
 
 		 300 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.223887  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1371  LysR family transcriptional regulator  48.29 
 
 		 308 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5946  transcriptional regulator LysR family  46.26 
 
 		 312 aa  251  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3779  LysR family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 292 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.750193 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3052  LysR family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 292 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0148  LysR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.148101  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3293  LysR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 301 aa  217  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185242  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1860  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 328 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0547107 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3974  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 328 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.140467 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3189  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 279 aa  190  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3944  transcriptional regulator, LysR family  39.66 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3977  transcriptional regulatory protein  35.76 
 
 		 315 aa  168  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.121113 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0722  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 294 aa  163  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2895  LysR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 313 aa  158  9e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521914  normal  0.0431936 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2886  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0958949  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 294 aa  156  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1135  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 299 aa  155  8e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0556811  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0977  LysR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 311 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.465087  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03181  transcription regulator protein  36.84 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.30577 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1039  transcriptional regulator, LysR family  38.16 
 
 		 311 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2289  transcriptional regulator, LysR family  36.12 
 
 		 293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4568  transcriptional regulator, LysR family  35.79 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.759587 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0343  LysR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294854  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3188  LysR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.708036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0359  transcriptional regulator, LysR family  35.02 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0121795  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2478  LysR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 319 aa  149  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.585884  normal  0.517095 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0372  transcriptional regulator, LysR family  34.66 
 
 		 313 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103497  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4310  LysR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 304 aa  145  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_003296  RS01990  transcriptional regulator transcription regulator protein  35.92 
 
 		 302 aa  145  9e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7466  LysR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0881  LysR family transcriptional regulator  34 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3368  transcriptional regulator, LysR family  34.04 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1792  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 295 aa  143  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2707  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.43 
 
 		 295 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0135797  normal  0.0584976 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0706  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 293 aa  143  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.265048  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 291 aa  142  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0386  transcriptional regulator, LysR family  34.04 
 
 		 298 aa  142  7e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447442 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0825  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 303 aa  142  9e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5300  LysR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 349 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.233752 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5348  LysR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5209  LysR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 349 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405506  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5018  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.448472 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5859  transcriptional regulator, LysR family  34.46 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2474  LysR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  33.79 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3600  LysR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 307 aa  137  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0857675  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2194  LysR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.569492 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0173  LysR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 290 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130123 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0840  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 288 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4075  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 297 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4291  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 297 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1441  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 322 aa  135  9e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0761  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 306 aa  135  9e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3448  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 291 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1036  transcriptional regulator, LysR family  36.75 
 
 		 294 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1782  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4345  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3003  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 292 aa  132  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal  0.209917 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7356  LysR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 305 aa  132  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195647  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4668  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4666  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal  0.172024 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4532  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.176427  normal  0.951111 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3045  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1898  LysR family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3318  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5834  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5026  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111623  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3487  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3834  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.27 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4405  LysR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4420  transcriptional regulator, LysR family  36.86 
 
 		 316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.395777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1089  LysR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 300 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49680  transcriptional regulator  31.4 
 
 		 291 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3792  LysR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 296 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0906845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6201  transcriptional regulator, LysR family  34.09 
 
 		 334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4165  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5828  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 296 aa  129  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0653  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 325 aa  129  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3295  LysR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 291 aa  129  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4282  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 288 aa  129  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.352562  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2903  transcriptional regulator, LysR family  34.66 
 
 		 300 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0770921  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3421  LysR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5824  transcriptional regulator, LysR family  29.93 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4049  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0950657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4540  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0590293  normal  0.826937 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3476  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0142034 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2031  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.810813  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3048  LysR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.104991 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4317  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6740  transcriptional regulator, LysR family  30.2 
 
 		 317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0412  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 319 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2010  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 303 aa  125  6e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1814  transcriptional regulator, LysR family  30.93 
 
 		 303 aa  125  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1565  transcriptional regulator, LysR family  31.69 
 
 		 302 aa  125  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>