More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1898 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_1898  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
297 aa  607  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1150  LysR family transcriptional regulator  61.2 
 
 
300 aa  337  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1199  LysR family transcriptional regulator  49.13 
 
 
313 aa  281  6.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1478  LysR family transcriptional regulator  42.36 
 
 
287 aa  262  4e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3661  LysR family transcriptional regulator  45.96 
 
 
288 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0821537  normal  0.180517 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 
294 aa  206  4e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2194  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
307 aa  176  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.569492 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2474  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
291 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49680  transcriptional regulator  37.24 
 
 
291 aa  168  9e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01990  transcriptional regulator transcription regulator protein  34.67 
 
 
302 aa  168  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1750  transcriptional regulator, LysR family  32.2 
 
 
324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286779  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  35.96 
 
 
294 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6141  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
290 aa  162  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0074  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 
295 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.183793  hitchhiker  0.0000000265009 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0417  transcriptional regulator, LysR family  33.69 
 
 
293 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234573  hitchhiker  0.000746298 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3448  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
291 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4291  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
297 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4075  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
297 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605755  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5632  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
290 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090076  normal  0.419487 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3700  LysR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
306 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0835  transcriptional regulator LysR family  32.52 
 
 
293 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4668  LysR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
306 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35051  normal  0.639352 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0881  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 
316 aa  159  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1155  LysR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
304 aa  159  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0046037  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3045  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 
297 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4282  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 
288 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.352562  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4514  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
292 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.973008 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0619  LysR family transcriptional regulator  32.51 
 
 
301 aa  156  5.0000000000000005e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.415419  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0071  LysR family transcriptional regulator  30.24 
 
 
295 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000017949 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0055  LysR family transcriptional regulator  30.24 
 
 
295 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0359  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 
313 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0121795  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3487  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
293 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475425  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3798  transcriptional regulator, LysR family  34.78 
 
 
298 aa  153  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.244352 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3911  transcriptional regulator, LysR family  34.78 
 
 
298 aa  153  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0071  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
295 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.328388  hitchhiker  0.00942011 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0372  transcriptional regulator, LysR family  32.77 
 
 
313 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103497  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0937  LysR family transcriptional regulator  29.58 
 
 
332 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0239089  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1089  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 
300 aa  152  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0343  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
313 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294854  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5946  transcriptional regulator LysR family  36.14 
 
 
312 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0384  transcriptional regulator, LysR family  31.93 
 
 
293 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0197813 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1441  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
322 aa  151  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4405  LysR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
298 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2863  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 
315 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.753001 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0173  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
298 aa  149  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0103543  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0952  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
304 aa  149  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2448  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 
303 aa  149  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0893  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
304 aa  149  7e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1403  LysR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
304 aa  148  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0412  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744171  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5834  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 
315 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3944  transcriptional regulator, LysR family  32.56 
 
 
296 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5026  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 
315 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111623  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7356  LysR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195647  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4345  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2895  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
313 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521914  normal  0.0431936 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
293 aa  145  9e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4058  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 
306 aa  145  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal  0.387119 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7466  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
290 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146793  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1335  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
290 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1833  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
301 aa  143  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5824  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 
317 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0323  LysR family transcriptional regulator  29.72 
 
 
293 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.23256 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3247  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
301 aa  142  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1792  LysR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
295 aa  142  8e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1766  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
308 aa  142  8e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1425  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 
301 aa  142  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3868  transcriptional regulator, LysR family  28.19 
 
 
315 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1371  LysR family transcriptional regulator  31.32 
 
 
308 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6740  transcriptional regulator, LysR family  32.75 
 
 
317 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217872  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16380  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 
301 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4156  transcriptional regulator, LysR family  31.82 
 
 
290 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.638472 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0876  transcriptional regulator, LysR family  31.45 
 
 
296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3295  LysR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
291 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1158  LysR substrate-binding  29.41 
 
 
317 aa  139  7e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.326337 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2557  LysR family transcriptional regulator  30.25 
 
 
283 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.748722  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5011  transcriptional regulator, LysR family  30.48 
 
 
306 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3421  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 
305 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8528  transcriptional regulator, LysR family  30.1 
 
 
298 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0854  LysR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
316 aa  137  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1605  LysR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4214  transcriptional regulator, LysR family  35.21 
 
 
304 aa  136  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5963  transcriptional regulator, LysR family  30.42 
 
 
297 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0185947 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3357  LysR family transcriptional regulator  27.37 
 
 
295 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.485418  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0825  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
303 aa  135  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0979  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  30.27 
 
 
295 aa  135  8e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2523  transcriptional regulator, LysR family  29.1 
 
 
300 aa  135  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2965  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 
297 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1608  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 
297 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0270866 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3202  transcriptional regulator, LysR family  32.87 
 
 
298 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2478  LysR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
319 aa  135  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.585884  normal  0.517095 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5018  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.448472 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33750  LysR family transcriptional regulator protein  31.51 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1517  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000321062  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3786  LysR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788171  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1317  transcriptional regulator, LysR family  28.37 
 
 
298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3318  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4030  LysR family transcriptional regulator  29.31 
 
 
313 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.653642  normal  0.928184 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>