More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1135 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_1135  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 299 aa  616  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0556811  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3368  transcriptional regulator, LysR family  45.45 
 
 		 298 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4568  transcriptional regulator, LysR family  46.46 
 
 		 298 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.759587 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0386  transcriptional regulator, LysR family  45.45 
 
 		 298 aa  256  4e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447442 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2289  transcriptional regulator, LysR family  44.9 
 
 		 293 aa  250  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5859  transcriptional regulator, LysR family  43.73 
 
 		 315 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3977  transcriptional regulatory protein  31.63 
 
 		 315 aa  159  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.121113 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3293  LysR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 301 aa  156  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185242  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1371  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 308 aa  155  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5946  transcriptional regulator LysR family  32.24 
 
 		 312 aa  155  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3832  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 290 aa  155  8e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.524021 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0722  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 294 aa  149  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2367  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0148  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.148101  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4075  LysR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  32.87 
 
 		 294 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4291  LysR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3448  LysR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3487  LysR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4279  LysR substrate-binding  34.01 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2844  transcriptional regulator, LysR family  32.08 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.223887  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0761  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 306 aa  136  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2599  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 292 aa  135  7.000000000000001e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4796  transcriptional regulator, LysR family  33.9 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511675  normal  0.87125 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4646  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0479434  normal  0.927807 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3189  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 279 aa  133  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2886  LysR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0958949  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1335  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 290 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2474  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 307 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 294 aa  130  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5018  LysR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 294 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.448472 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0881  LysR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0412  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 319 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3188  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 291 aa  129  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.708036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7466  LysR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 290 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0840  LysR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 288 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7356  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 305 aa  129  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195647  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01990  transcriptional regulator transcription regulator protein  31.08 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33750  LysR family transcriptional regulator protein  32.18 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49680  transcriptional regulator  29.84 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3779  LysR family transcriptional regulator  32.25 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.750193 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 301 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6141  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2194  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.569492 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3295  LysR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6740  transcriptional regulator, LysR family  30.1 
 
 		 317 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5824  transcriptional regulator, LysR family  29.41 
 
 		 317 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4282  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 288 aa  125  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.352562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1517  LysR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000321062  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01514  transcriptional regulatory protein  27.08 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2707  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.41 
 
 		 295 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0135797  normal  0.0584976 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3052  LysR family transcriptional regulator  32.25 
 
 		 292 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3045  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 297 aa  122  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0825  LysR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 303 aa  122  7e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0355  transcriptional regulator  29.32 
 
 		 293 aa  122  9e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.837334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3661  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 288 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0821537  normal  0.180517 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5834  LysR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5026  LysR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111623  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1860  LysR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0547107 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1199  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1898  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3974  LysR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 328 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.140467 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0694  LysR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 329 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4767  LysR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 286 aa  116  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2448  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 303 aa  115  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4928  LysR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.595965  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3421  LysR family transcriptional regulator  24.01 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1833  LysR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0173  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0103543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2973  putative transcriptional regulator  30.27 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2523  transcriptional regulator, LysR family  27.12 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03181  transcription regulator protein  33.33 
 
 		 328 aa  113  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.30577 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3476  LysR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 319 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0142034 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0706  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.265048  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4345  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4532  LysR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 316 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.176427  normal  0.951111 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1766  LysR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 308 aa  113  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4540  LysR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 339 aa  112  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0590293  normal  0.826937 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3705  LysR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 300 aa  112  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217893  normal  0.044305 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4668  LysR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 316 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2031  LysR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 319 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.810813  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0619  LysR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 301 aa  112  9e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.415419  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5300  LysR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.233752 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2478  LysR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.585884  normal  0.517095 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5209  LysR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405506  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1478  LysR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4514  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.973008 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4317  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4049  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0950657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3003  LysR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal  0.209917 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1441  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3528  transcriptional regulator, LysR family  29.53 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0086237 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5348  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261949 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2895  LysR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521914  normal  0.0431936 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4666  LysR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal  0.172024 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35250  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.587508 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1155  LysR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 304 aa  109  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0046037  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5632  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 290 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090076  normal  0.419487 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>