More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0706 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0706  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 293 aa  585  1e-166  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.265048  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3295  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 291 aa  159  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5996  transcriptional regulator, LysR family  38.01 
 
 		 296 aa  158  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0861093  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1371  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0359  transcriptional regulator, LysR family  36.52 
 
 		 313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0121795  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0372  transcriptional regulator, LysR family  36.52 
 
 		 313 aa  152  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103497  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1748  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.056741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0825  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 303 aa  149  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3293  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 301 aa  149  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185242  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0343  LysR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294854  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3810  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 299 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418833  hitchhiker  0.00695796 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0937  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2577  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2721  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5824  transcriptional regulator, LysR family  32.53 
 
 		 317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0997  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0921  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 291 aa  145  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4581  LysR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 298 aa  145  7.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.325536 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7356  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 305 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6740  transcriptional regulator, LysR family  32.18 
 
 		 317 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6141  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5946  transcriptional regulator LysR family  32.29 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0649  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.33789 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1039  transcriptional regulator, LysR family  36.95 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1403  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3832  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 290 aa  143  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.524021 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3202  transcriptional regulator, LysR family  34.45 
 
 		 298 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1988  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 302 aa  143  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3528  transcriptional regulator, LysR family  34.45 
 
 		 298 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0086237 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0798  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  142  9e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.748427  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0977  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.465087  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49680  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5834  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5026  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111623  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1163  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0513679  normal  0.0450168 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2194  LysR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 307 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.569492 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3045  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0127  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 295 aa  140  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4697  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2895  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 313 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521914  normal  0.0431936 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5018  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 294 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.448472 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2989  transcriptional regulator, LysR family  34.02 
 
 		 299 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0878749 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0071  LysR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 295 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.328388  hitchhiker  0.00942011 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2367  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 299 aa  139  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0148  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.148101  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2844  transcriptional regulator, LysR family  31.71 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.223887  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5492  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28545 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0881  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4790  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 328 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4282  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.352562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0822  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 309 aa  136  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895804 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2478  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 319 aa  136  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.585884  normal  0.517095 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5666  LysR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 306 aa  136  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.381574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3868  transcriptional regulator, LysR family  31.36 
 
 		 315 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1750  transcriptional regulator, LysR family  32.27 
 
 		 324 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286779  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4175  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 299 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.825344  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0952  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 304 aa  136  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0071  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 295 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000017949 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4345  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 315 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0893  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 304 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0074  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 295 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.183793  hitchhiker  0.0000000265009 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2728  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 		 299 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0055  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5772  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189164  normal  0.699702 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2950  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 297 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1595  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 297 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0923411 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3334  transcription regulator protein  33.33 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2899  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 322 aa  132  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6804  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 307 aa  132  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2010  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1814  transcriptional regulator, LysR family  33.8 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3839  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 307 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4279  LysR substrate-binding  33.1 
 
 		 334 aa  130  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0835  transcriptional regulator LysR family  32.87 
 
 		 293 aa  129  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 293 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0895  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 297 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.163696 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3189  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4796  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 292 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511675  normal  0.87125 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1512  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 307 aa  129  5.0000000000000004e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.607249  normal  0.542943 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1511  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 307 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1036  transcriptional regulator, LysR family  35.25 
 
 		 294 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  32.63 
 
 		 294 aa  128  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1119  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33750  LysR family transcriptional regulator protein  31.94 
 
 		 293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1833  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4646  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0479434  normal  0.927807 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2454  LysR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.262838 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0384  transcriptional regulator, LysR family  34.25 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0197813 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0323  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.23256 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4610  transcriptional regulator, LysR family  29.33 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3977  transcriptional regulatory protein  30.14 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.121113 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1441  LysR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 322 aa  127  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0511  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 293 aa  127  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3213  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.772963  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0979  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  28.92 
 
 		 295 aa  126  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1452  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 297 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3779  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 292 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.750193 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>