More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3189 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3189  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 279 aa  571  1.0000000000000001e-162  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0148  LysR family transcriptional regulator  47.19 
 
 		 307 aa  250  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.148101  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1371  LysR family transcriptional regulator  44.4 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2367  LysR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5946  transcriptional regulator LysR family  39.23 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2844  transcriptional regulator, LysR family  39.77 
 
 		 300 aa  192  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.223887  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3832  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 290 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.524021 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3779  LysR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.750193 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3052  LysR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3293  LysR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 301 aa  168  9e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185242  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4279  LysR substrate-binding  37.02 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4796  transcriptional regulator, LysR family  39 
 
 		 292 aa  166  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511675  normal  0.87125 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4646  transcriptional regulator, LysR family  37.02 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0479434  normal  0.927807 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3977  transcriptional regulatory protein  34.27 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.121113 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2895  LysR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 313 aa  148  8e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521914  normal  0.0431936 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1565  transcriptional regulator, LysR family  31.4 
 
 		 302 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4178  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3308  transcription regulator protein  33.73 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.31701  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3178  transcriptional regulator, LysR family  33.07 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5348  LysR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261949 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3503  transcriptional regulator, LysR family  32.68 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.061821 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5209  LysR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 349 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405506  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5300  LysR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 349 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.233752 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1782  LysR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 302 aa  142  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0173  LysR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 290 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130123 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1860  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 328 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0547107 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4568  transcriptional regulator, LysR family  34.65 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.759587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3974  LysR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 328 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.140467 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0359  transcriptional regulator, LysR family  32.38 
 
 		 313 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0121795  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3188  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 291 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.708036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0372  transcriptional regulator, LysR family  32.03 
 
 		 313 aa  135  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103497  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2886  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 299 aa  135  9e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0958949  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4310  LysR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 304 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0343  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294854  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1135  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 299 aa  133  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0556811  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0386  transcriptional regulator, LysR family  33.2 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447442 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4345  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5834  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5026  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111623  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0706  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 293 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.265048  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 294 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1039  transcriptional regulator, LysR family  35.09 
 
 		 311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3368  transcriptional regulator, LysR family  33.2 
 
 		 298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3448  LysR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 291 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4075  LysR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 297 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4291  LysR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 297 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3487  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 293 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0722  LysR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 294 aa  128  9.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0977  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.465087  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2707  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.88 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0135797  normal  0.0584976 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3045  LysR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 297 aa  126  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  31.68 
 
 		 294 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2454  LysR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.262838 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3839  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 307 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2903  transcriptional regulator, LysR family  31.48 
 
 		 300 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0770921  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1441  LysR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 322 aa  122  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6804  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 307 aa  122  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1452  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 297 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0355  transcriptional regulator  31.27 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.837334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4610  transcriptional regulator, LysR family  31.14 
 
 		 307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1511  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6115  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.05 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0412  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 319 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2725  LysR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 283 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0825  LysR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 303 aa  119  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2599  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2973  putative transcriptional regulator  33.06 
 
 		 295 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2147  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 297 aa  118  9e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.576835 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35250  LysR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.587508 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0840  LysR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6141  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3491  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155572  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0173  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0103543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33750  LysR family transcriptional regulator protein  34.92 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03181  transcription regulator protein  33.21 
 
 		 328 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.30577 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1665  LysR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 301 aa  116  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 293 aa  115  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1898  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 297 aa  115  6.9999999999999995e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2474  LysR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 307 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5859  transcriptional regulator, LysR family  32.02 
 
 		 315 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1833  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 301 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2881  LysR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2289  transcriptional regulator, LysR family  31.62 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1036  transcriptional regulator, LysR family  33.58 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3318  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 293 aa  113  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7356  LysR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49680  transcriptional regulator  31.75 
 
 		 291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1766  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 308 aa  112  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1449  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1498  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4282  LysR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.352562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4405  LysR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0822  LysR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 309 aa  109  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895804 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2716  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0320253 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1403  LysR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1055  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 309 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.234404  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2899  LysR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 322 aa  109  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4581  LysR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 298 aa  109  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.325536 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0952  LysR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 304 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>