More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2147 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2147  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 297 aa  602  1.0000000000000001e-171  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.576835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6804  LysR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 307 aa  311  9e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2754  LysR family transcriptional regulator  52.7 
 
 		 296 aa  309  4e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3839  LysR family transcriptional regulator  51.01 
 
 		 307 aa  308  8e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2899  LysR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 322 aa  305  7e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1511  LysR family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 307 aa  298  7e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4610  transcriptional regulator, LysR family  49.32 
 
 		 307 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1452  LysR family transcriptional regulator  48.99 
 
 		 297 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2881  LysR family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 307 aa  296  4e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2454  LysR family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 297 aa  295  9e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.262838 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1665  LysR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 301 aa  288  6e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0980  LysR family transcriptional regulator  46.82 
 
 		 301 aa  286  2e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1498  LysR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 301 aa  285  7e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1449  LysR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 301 aa  285  7e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2111  LysR family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 296 aa  280  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0551561  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2440  LysR family transcriptional regulator  48.47 
 
 		 300 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0826701  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5828  transcriptional regulator, LysR family  47.12 
 
 		 296 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0055  LysR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 294 aa  272  5.000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1247  LysR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 298 aa  271  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329564  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3792  LysR family transcriptional regulator  46.78 
 
 		 296 aa  270  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0906845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2722  transcriptional regulator, LysR family  41.89 
 
 		 303 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0910097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0562  LysR family transcriptional regulator  46.44 
 
 		 296 aa  266  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00274587  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2983  transcriptional regulator, LysR family  41.89 
 
 		 303 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0899022 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1093  LysR substrate-binding  45.76 
 
 		 296 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1222  transcriptional regulator, LysR family  45.76 
 
 		 296 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1027  transcriptional regulator, LysR family  45.42 
 
 		 296 aa  263  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.781525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3141  transcriptional regulator LysR family  41.55 
 
 		 304 aa  262  4e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0895  LysR family transcriptional regulator  45.82 
 
 		 297 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.163696 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1595  LysR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 297 aa  258  6e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0923411 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2950  LysR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 297 aa  258  7e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3972  LysR family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 313 aa  256  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3202  transcriptional regulator, LysR family  45.02 
 
 		 294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.276424  normal  0.7211 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1763  HTH-type transcriptional regulator  44.52 
 
 		 300 aa  246  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1119  LysR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 301 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2175  LysR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 304 aa  242  6e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.823288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4262  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 350 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.294051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1564  transcriptional regulator, LysR family  31.99 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0571861  normal  0.229966 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06921  transcriptional regulator  31.74 
 
 		 289 aa  142  8e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1210  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.467633  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 303 aa  140  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1833  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 301 aa  140  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3640  LysR family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.101202 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0931  LysR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0129  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 294 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.868323  normal  0.261598 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000927  transcriptional regulator  30.61 
 
 		 289 aa  139  7.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3094  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 301 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.473286  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1766  LysR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1211  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159802  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2409  LysR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.687274  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3600  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0857675  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0991  transcriptional regulator, LysR family  32.01 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00933399  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3902  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7632  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0988  transcriptional regulator, LysR family  32.01 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.882538  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2223  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.499839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5398  transcriptional regulator, LysR family  32.66 
 
 		 295 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187721  normal  0.0384441 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1939  transcriptional regulator, LysR family  31.29 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.775483 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2420  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0145  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0927  LysR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 313 aa  136  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.503807  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2522  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 295 aa  136  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0131  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2924  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.842726  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0266  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 289 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2533  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 299 aa  135  8e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2053  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 291 aa  135  9e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1033  LysR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 298 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6313  transcriptional regulator, LysR family  30.58 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3311  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 294 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  30.34 
 
 		 307 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3270  transcriptional regulator, LysR family  36.36 
 
 		 316 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0353308  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6129  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0839  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2527  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5648  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2734  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3549  LyrR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4434  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5764  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6611  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2192  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.257142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0131  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4471  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190503  normal  0.801309 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1328  LysR family transcriptional regulator  32.25 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.277671 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2175  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6055  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 294 aa  133  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.031905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 298 aa  133  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3247  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 301 aa  134  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0123  transcriptional regulator  29.9 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0121  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 296 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2586  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0277024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4487  LysR family transcriptional regulator  32.25 
 
 		 307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1785  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1439  transcriptional regulator, LysR family  32.19 
 
 		 300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.267648  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  30.03 
 
 		 335 aa  132  6.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1475  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 325 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4009  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 311 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  28.97 
 
 		 302 aa  132  9e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>