More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2175 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2175  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 304 aa  612  9.999999999999999e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.823288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1763  HTH-type transcriptional regulator  78.26 
 
 		 300 aa  489  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0895  LysR family transcriptional regulator  76.01 
 
 		 297 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.163696 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2950  LysR family transcriptional regulator  75.34 
 
 		 297 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1595  LysR family transcriptional regulator  75 
 
 		 297 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0923411 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3972  LysR family transcriptional regulator  72.24 
 
 		 313 aa  454  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1119  LysR family transcriptional regulator  70.76 
 
 		 301 aa  449  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2899  LysR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 322 aa  268  7e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4610  transcriptional regulator, LysR family  48.44 
 
 		 307 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3202  transcriptional regulator, LysR family  48.28 
 
 		 294 aa  265  5.999999999999999e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.276424  normal  0.7211 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0055  LysR family transcriptional regulator  49.31 
 
 		 294 aa  265  5.999999999999999e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1452  LysR family transcriptional regulator  47.28 
 
 		 297 aa  265  7e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1511  LysR family transcriptional regulator  47.28 
 
 		 307 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3839  LysR family transcriptional regulator  47.6 
 
 		 307 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2754  LysR family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 296 aa  261  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6804  LysR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 307 aa  260  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1665  LysR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 301 aa  259  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2440  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 300 aa  258  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0826701  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2454  LysR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 297 aa  257  2e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.262838 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2111  LysR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0551561  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1449  LysR family transcriptional regulator  45.52 
 
 		 301 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0562  LysR family transcriptional regulator  47.26 
 
 		 296 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00274587  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_004310  BR1498  LysR family transcriptional regulator  45.52 
 
 		 301 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2881  LysR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 307 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0980  LysR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 301 aa  251  7e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1027  transcriptional regulator, LysR family  46.58 
 
 		 296 aa  251  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.781525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1222  transcriptional regulator, LysR family  46.58 
 
 		 296 aa  251  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3141  transcriptional regulator LysR family  42.36 
 
 		 304 aa  251  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1093  LysR substrate-binding  46.58 
 
 		 296 aa  251  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2722  transcriptional regulator, LysR family  42.01 
 
 		 303 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0910097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1247  LysR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 298 aa  249  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329564  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5828  transcriptional regulator, LysR family  46.74 
 
 		 296 aa  249  4e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2983  transcriptional regulator, LysR family  41.67 
 
 		 303 aa  248  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0899022 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3792  LysR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 296 aa  245  6e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0906845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2147  LysR family transcriptional regulator  44.82 
 
 		 297 aa  245  6e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.576835 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0417  transcriptional regulator, LysR family  35.81 
 
 		 293 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234573  hitchhiker  0.000746298 
 
 
-
 
NC_004310  BR1833  LysR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 301 aa  163  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0835  transcriptional regulator LysR family  33.9 
 
 		 293 aa  164  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 293 aa  162  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1766  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3610  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 302 aa  155  8e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4214  transcriptional regulator, LysR family  34.74 
 
 		 304 aa  153  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0384  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 293 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0197813 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3318  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 293 aa  152  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2522  transcriptional regulator, LysR family  34.86 
 
 		 295 aa  152  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0323  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 293 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.23256 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3247  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1139  LysR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 306 aa  149  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4581  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 298 aa  142  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.325536 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2961  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 292 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06921  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 289 aa  142  9e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0619  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.415419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5772  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189164  normal  0.699702 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000927  transcriptional regulator  30.69 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1792  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 295 aa  140  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3786  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 302 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3295  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 291 aa  139  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2711  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5996  transcriptional regulator, LysR family  34.34 
 
 		 296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0861093  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2194  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 307 aa  136  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.569492 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 302 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5603  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 359 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.469593 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0822  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 309 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895804 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5256  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 359 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4625  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 331 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00069577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6638  LysR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0517  LysR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1682  putative transcriptional regulator  32.23 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177927  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3600  LysR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 307 aa  133  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0857675  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  30.2 
 
 		 335 aa  133  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1366  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.36 
 
 		 298 aa  133  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2250  LysR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 302 aa  132  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 304 aa  132  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3807  transcriptional regulator, LysR family  29.12 
 
 		 301 aa  132  9e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.832757  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2420  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1939  transcriptional regulator, LysR family  30.93 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.775483 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5274  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0091  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2478  LysR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.585884  normal  0.517095 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0123  transcriptional regulator  29.01 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2533  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2405  transcriptional regulator, LysR family  31.36 
 
 		 345 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0747  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  28.18 
 
 		 290 aa  130  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.796071  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3549  LyrR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 299 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0372  LysR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 292 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1328  LysR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 307 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.277671 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3236  LysR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 299 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0163272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2527  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 292 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000458  transcriptional regulator  28.42 
 
 		 330 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1605  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 305 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1124  LysR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 298 aa  129  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4060  transcriptional regulator, LysR family protein  30.14 
 
 		 288 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.833958  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0831  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 296 aa  129  9.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  28.28 
 
 		 297 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0808  transcriptional regulator, LysR family  28.47 
 
 		 294 aa  128  9.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5018  LysR family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.448472 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1557  transcriptional regulator, LysR family  31.01 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2409  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.687274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>