More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1605 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1605  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 305 aa  618  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3786  LysR family transcriptional regulator  62.28 
 
 		 302 aa  368  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2474  LysR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 307 aa  271  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2194  LysR family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 307 aa  269  4e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.569492 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0619  LysR family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 301 aa  251  8.000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.415419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2523  transcriptional regulator, LysR family  43.15 
 
 		 300 aa  246  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0173  LysR family transcriptional regulator  43.34 
 
 		 298 aa  246  4e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0103543  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0952  LysR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 304 aa  231  8.000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0893  LysR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 304 aa  231  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1403  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 304 aa  230  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0881  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 316 aa  228  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1766  LysR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 308 aa  227  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0384  transcriptional regulator, LysR family  41.98 
 
 		 293 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0197813 
 
 
-
 
NC_004310  BR1833  LysR family transcriptional regulator  41.39 
 
 		 301 aa  223  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2863  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 315 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753001 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6740  transcriptional regulator, LysR family  38.51 
 
 		 317 aa  222  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217872  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0781  transcriptional regulator, LysR family  38.78 
 
 		 314 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4666  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 316 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal  0.172024 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0694  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 329 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 301 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4532  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 316 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.176427  normal  0.951111 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0688  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.78 
 
 		 315 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4668  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 316 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0417  transcriptional regulator, LysR family  43.58 
 
 		 293 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234573  hitchhiker  0.000746298 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0835  transcriptional regulator LysR family  39.93 
 
 		 293 aa  218  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3258  transcriptional regulator, LysR family  40.27 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0242  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 318 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5824  transcriptional regulator, LysR family  37.84 
 
 		 317 aa  215  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3298  LysR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 313 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.683062  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4030  LysR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 313 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.653642  normal  0.928184 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3318  LysR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 293 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3293  hypothetical protein  38.81 
 
 		 312 aa  212  7e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0766  LysR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 338 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.207763 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0323  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 293 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.23256 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1089  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 300 aa  210  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1792  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 295 aa  209  4e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4540  LysR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 339 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0590293  normal  0.826937 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3476  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0142034 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3578  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 317 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4317  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 319 aa  205  9e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4049  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 319 aa  205  9e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0950657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1718  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 305 aa  202  6e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1425  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16380  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1814  transcriptional regulator, LysR family  38.6 
 
 		 303 aa  200  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2010  LysR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 303 aa  200  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2606  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 295 aa  199  6e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681878 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3357  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 295 aa  198  7e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.485418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0074  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 295 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.183793  hitchhiker  0.0000000265009 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3705  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217893  normal  0.044305 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0071  LysR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.328388  hitchhiker  0.00942011 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0071  LysR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000017949 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0055  LysR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10670  transcriptional regulator, LysR family  39.25 
 
 		 296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.370922  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4478  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 297 aa  191  9e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.515823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1560  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3444  LysR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 323 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3951  LysR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 319 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.358181 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2031  LysR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 319 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.810813  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3246  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 296 aa  188  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.742909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4214  transcriptional regulator, LysR family  39.72 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1139  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 306 aa  185  8e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2522  transcriptional regulator, LysR family  38.43 
 
 		 295 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0653  LysR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3247  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 301 aa  179  4.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0937  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1390  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2965  LysR family transcriptional regulator  37.83 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1608  LysR family transcriptional regulator  37.83 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0270866 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5018  LysR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 294 aa  175  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.448472 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8528  transcriptional regulator, LysR family  35.69 
 
 		 298 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4928  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.595965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2152  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 318 aa  170  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0854  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 316 aa  168  9e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3868  transcriptional regulator, LysR family  32.88 
 
 		 315 aa  168  9e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3421  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5961  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 307 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3048  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.104991 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1158  LysR substrate-binding  32.75 
 
 		 317 aa  163  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1317  transcriptional regulator, LysR family  32.75 
 
 		 298 aa  162  6e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01514  transcriptional regulatory protein  30.1 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1559  transcriptional regulator, LysR family  34.62 
 
 		 298 aa  157  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206276  normal  0.500122 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1107  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 298 aa  156  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1914  LysR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 300 aa  154  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0771  transcriptional regulator, LysR family  35.84 
 
 		 299 aa  152  5.9999999999999996e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2448  LysR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1746  HTH-type transcriptional regulator  36.75 
 
 		 297 aa  149  5e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.747991 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1470  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 323 aa  149  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.644584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1750  transcriptional regulator, LysR family  28.96 
 
 		 324 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286779  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3972  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 313 aa  147  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1321  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 301 aa  146  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.517525  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3295  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 291 aa  143  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4291  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 297 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4075  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 297 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2950  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 297 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3448  LysR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 291 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1595  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 297 aa  142  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0923411 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1898  LysR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 294 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>