More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3893 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 301 aa  595  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0881  LysR family transcriptional regulator  51.93 
 
 		 316 aa  311  5.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0619  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 301 aa  310  2e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.415419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2194  LysR family transcriptional regulator  49 
 
 		 307 aa  290  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.569492 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2474  LysR family transcriptional regulator  51.03 
 
 		 307 aa  287  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  51.19 
 
 		 293 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1833  LysR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 301 aa  280  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0417  transcriptional regulator, LysR family  51.42 
 
 		 293 aa  278  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234573  hitchhiker  0.000746298 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1766  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 308 aa  278  7e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0323  LysR family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 293 aa  278  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.23256 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0384  transcriptional regulator, LysR family  49.65 
 
 		 293 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0197813 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0835  transcriptional regulator LysR family  48.94 
 
 		 293 aa  266  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2523  transcriptional regulator, LysR family  47.35 
 
 		 300 aa  265  8e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3786  LysR family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 302 aa  260  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0173  LysR family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 298 aa  251  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0103543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1089  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 300 aa  251  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3318  LysR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 293 aa  250  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2863  LysR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 315 aa  242  7e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753001 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6740  transcriptional regulator, LysR family  43.49 
 
 		 317 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217872  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4668  LysR family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4532  LysR family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.176427  normal  0.951111 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5824  transcriptional regulator, LysR family  43.15 
 
 		 317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4666  LysR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 316 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal  0.172024 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3247  LysR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 301 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4540  LysR family transcriptional regulator  44.18 
 
 		 339 aa  232  6e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0590293  normal  0.826937 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0694  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 329 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1403  LysR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 304 aa  231  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2522  transcriptional regulator, LysR family  45.58 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0688  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.73 
 
 		 315 aa  228  8e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1139  LysR family transcriptional regulator  45.94 
 
 		 306 aa  228  9e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3476  LysR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 319 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0142034 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4214  transcriptional regulator, LysR family  47.35 
 
 		 304 aa  228  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4317  LysR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 319 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4049  LysR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 319 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0950657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0071  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 295 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000017949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0071  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 295 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.328388  hitchhiker  0.00942011 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0074  LysR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 295 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.183793  hitchhiker  0.0000000265009 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0766  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 338 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.207763 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5018  LysR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 294 aa  225  7e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.448472 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0055  LysR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 295 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0781  transcriptional regulator, LysR family  39 
 
 		 314 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3293  hypothetical protein  40.96 
 
 		 312 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0952  LysR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 304 aa  223  4e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1560  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 291 aa  223  4e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0893  LysR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 304 aa  223  4e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1792  LysR family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 295 aa  223  4e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0242  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 318 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1425  LysR family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 301 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16380  LysR family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 301 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3298  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.683062  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4030  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.653642  normal  0.928184 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3357  LysR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 295 aa  219  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.485418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3578  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 317 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1605  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 305 aa  219  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4928  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 307 aa  216  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.595965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2031  LysR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 319 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.810813  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1390  LysR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 297 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3951  LysR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 319 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.358181 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2606  LysR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681878 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3258  transcriptional regulator, LysR family  40.8 
 
 		 298 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3444  LysR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 323 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2965  LysR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1608  LysR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0270866 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4478  LysR family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 297 aa  209  5e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.515823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0653  LysR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 325 aa  208  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10670  transcriptional regulator, LysR family  41.58 
 
 		 296 aa  208  9e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.370922  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1814  transcriptional regulator, LysR family  40.85 
 
 		 303 aa  208  9e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3421  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 305 aa  208  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2010  LysR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 303 aa  208  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3246  LysR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 296 aa  206  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.742909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3048  LysR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 310 aa  199  5e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.104991 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1718  LysR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 305 aa  198  7.999999999999999e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5961  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 307 aa  198  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1750  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 324 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286779  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0854  LysR family transcriptional regulator  41.81 
 
 		 316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8528  transcriptional regulator, LysR family  39.44 
 
 		 298 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01514  transcriptional regulatory protein  35.64 
 
 		 289 aa  185  7e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3705  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217893  normal  0.044305 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1317  transcriptional regulator, LysR family  38.52 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3868  transcriptional regulator, LysR family  35.07 
 
 		 315 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0937  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 332 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1158  LysR substrate-binding  37.1 
 
 		 317 aa  177  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326337 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2152  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 318 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1914  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 300 aa  174  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1746  HTH-type transcriptional regulator  38.85 
 
 		 297 aa  172  5.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.747991 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1107  LysR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0771  transcriptional regulator, LysR family  39.85 
 
 		 299 aa  168  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1199  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 313 aa  165  9e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1898  LysR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1441  LysR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 322 aa  163  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1559  transcriptional regulator, LysR family  38.03 
 
 		 298 aa  163  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206276  normal  0.500122 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7466  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01360  transcriptional regulator  37.55 
 
 		 296 aa  155  5.0000000000000005e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0576  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 313 aa  155  6e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.268348 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  36.2 
 
 		 294 aa  155  7e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1321  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 301 aa  155  7e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.517525  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5011  transcriptional regulator, LysR family  35.42 
 
 		 306 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4789  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 317 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.187704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4703  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 317 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>