More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2152 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2152  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 318 aa  647    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2194  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.569492 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1089  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 301 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0417  transcriptional regulator, LysR family  38.91 
 
 		 293 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234573  hitchhiker  0.000746298 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3786  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 302 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0384  transcriptional regulator, LysR family  37.2 
 
 		 293 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0197813 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5088  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 317 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.375083 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4789  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 317 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.187704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4703  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 317 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3258  transcriptional regulator, LysR family  36.64 
 
 		 298 aa  165  8e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1560  LysR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 291 aa  165  8e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0771  transcriptional regulator, LysR family  36.03 
 
 		 299 aa  165  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3247  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1605  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2523  transcriptional regulator, LysR family  35.84 
 
 		 300 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0893  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0323  LysR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 293 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.23256 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0576  transcriptional regulator, LysR family  34.69 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.268348 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0952  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 304 aa  159  5e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2606  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 295 aa  159  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681878 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 293 aa  159  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1321  LysR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 301 aa  159  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.517525  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0619  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 301 aa  159  8e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.415419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0881  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 316 aa  158  9e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1470  LysR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.644584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0173  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 298 aa  157  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0103543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1425  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 301 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1833  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 301 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1766  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 308 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2010  LysR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 303 aa  155  7e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0835  transcriptional regulator LysR family  35.49 
 
 		 293 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4928  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 307 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.595965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1403  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 304 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1814  transcriptional regulator, LysR family  36.46 
 
 		 303 aa  155  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1139  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2863  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753001 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16380  LysR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3318  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 293 aa  152  7e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3293  hypothetical protein  35.23 
 
 		 312 aa  152  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3476  LysR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 319 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0142034 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3705  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 300 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217893  normal  0.044305 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0653  LysR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 325 aa  150  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0364  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 311 aa  150  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4540  LysR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 339 aa  149  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0590293  normal  0.826937 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4049  LysR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 319 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0950657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4317  LysR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 319 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5961  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 307 aa  148  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2522  transcriptional regulator, LysR family  36.16 
 
 		 295 aa  148  9e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5632  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090076  normal  0.419487 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5301  LysR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320011 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1317  transcriptional regulator, LysR family  35 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3246  LysR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.742909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0688  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.56 
 
 		 315 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3298  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 313 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.683062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4668  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 306 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35051  normal  0.639352 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0242  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 318 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5018  LysR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 294 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.448472 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3700  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 306 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1155  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0046037  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4030  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.653642  normal  0.928184 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3421  LysR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 305 aa  146  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3578  LysR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 317 aa  146  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0071  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 295 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.328388  hitchhiker  0.00942011 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01514  transcriptional regulatory protein  32.53 
 
 		 289 aa  145  7.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5824  transcriptional regulator, LysR family  31.6 
 
 		 317 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1792  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 295 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4214  transcriptional regulator, LysR family  37.27 
 
 		 304 aa  145  9e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0055  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 295 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4514  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 292 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.973008 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8528  transcriptional regulator, LysR family  35.47 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4058  LysR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal  0.387119 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0781  transcriptional regulator, LysR family  32.88 
 
 		 314 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1158  LysR substrate-binding  33.93 
 
 		 317 aa  143  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326337 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0071  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 295 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000017949 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0766  LysR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 338 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.207763 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0694  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 329 aa  142  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0074  LysR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 295 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.183793  hitchhiker  0.0000000265009 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4532  LysR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 316 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.176427  normal  0.951111 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4668  LysR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 316 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2965  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 297 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4666  LysR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal  0.172024 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1608  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 297 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0270866 
 
 
-
 
NC_003296  RS01990  transcriptional regulator transcription regulator protein  36.3 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6740  transcriptional regulator, LysR family  31.29 
 
 		 317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3444  LysR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 323 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2474  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 307 aa  139  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0937  LysR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 332 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3951  LysR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 319 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.358181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3357  LysR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.485418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4478  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 297 aa  138  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.515823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2031  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.810813  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5011  transcriptional regulator, LysR family  32.41 
 
 		 306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3868  transcriptional regulator, LysR family  30.48 
 
 		 315 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01360  transcriptional regulator  33.22 
 
 		 296 aa  135  9e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1390  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 297 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1750  transcriptional regulator, LysR family  32.06 
 
 		 324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286779  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 294 aa  132  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1914  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 300 aa  132  6e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0979  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  30.82 
 
 		 295 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>