More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1425 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1425  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 301 aa  608  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16380  LysR family transcriptional regulator  98.67 
 
 		 301 aa  598  1e-170  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3357  LysR family transcriptional regulator  72.79 
 
 		 295 aa  455  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.485418  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0055  LysR family transcriptional regulator  73.13 
 
 		 295 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0074  LysR family transcriptional regulator  72.11 
 
 		 295 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.183793  hitchhiker  0.0000000265009 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0071  LysR family transcriptional regulator  72.79 
 
 		 295 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.328388  hitchhiker  0.00942011 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0071  LysR family transcriptional regulator  72.45 
 
 		 295 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000017949 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0694  LysR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 329 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3258  transcriptional regulator, LysR family  46.05 
 
 		 298 aa  256  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2606  LysR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 295 aa  249  5e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681878 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0688  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40.86 
 
 		 315 aa  247  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0781  transcriptional regulator, LysR family  41 
 
 		 314 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4532  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 316 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.176427  normal  0.951111 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4668  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2010  LysR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 303 aa  241  7.999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1814  transcriptional regulator, LysR family  44.44 
 
 		 303 aa  241  7.999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4666  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 316 aa  241  9e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal  0.172024 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1089  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 300 aa  239  5e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4928  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 307 aa  239  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.595965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4317  LysR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 319 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4049  LysR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 319 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0950657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4540  LysR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 339 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0590293  normal  0.826937 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2194  LysR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 307 aa  236  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.569492 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0619  LysR family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 301 aa  235  5.0000000000000005e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.415419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3476  LysR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0142034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0766  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 338 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.207763 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0242  LysR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 318 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1403  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 304 aa  230  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 301 aa  228  7e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2474  LysR family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 307 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10670  transcriptional regulator, LysR family  45.08 
 
 		 296 aa  223  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.370922  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1560  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 291 aa  223  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0952  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0417  transcriptional regulator, LysR family  39.59 
 
 		 293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234573  hitchhiker  0.000746298 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0893  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 304 aa  220  3e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 293 aa  218  7e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5961  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 307 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2031  LysR family transcriptional regulator  41.47 
 
 		 319 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.810813  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3578  LysR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 317 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1833  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 301 aa  217  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3951  LysR family transcriptional regulator  41 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.358181 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0384  transcriptional regulator, LysR family  38.91 
 
 		 293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0197813 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3786  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1766  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 308 aa  215  8e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3444  LysR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 323 aa  215  8e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0173  LysR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 298 aa  215  8e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0103543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3705  LysR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217893  normal  0.044305 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0323  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 293 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.23256 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2863  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 315 aa  206  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753001 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5018  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 294 aa  206  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.448472 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0835  transcriptional regulator LysR family  37.88 
 
 		 293 aa  206  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1317  transcriptional regulator, LysR family  39.18 
 
 		 298 aa  206  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8528  transcriptional regulator, LysR family  39.18 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1158  LysR substrate-binding  38.83 
 
 		 317 aa  204  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2523  transcriptional regulator, LysR family  37.11 
 
 		 300 aa  203  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1605  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 305 aa  201  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6740  transcriptional regulator, LysR family  37.8 
 
 		 317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3318  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3421  LysR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 305 aa  196  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5824  transcriptional regulator, LysR family  37.8 
 
 		 317 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1559  transcriptional regulator, LysR family  42.27 
 
 		 298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206276  normal  0.500122 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0937  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 332 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3298  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 313 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.683062  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4030  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.653642  normal  0.928184 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0881  LysR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 316 aa  193  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0653  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 325 aa  192  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3868  transcriptional regulator, LysR family  34.25 
 
 		 315 aa  191  9e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3293  hypothetical protein  35.91 
 
 		 312 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4214  transcriptional regulator, LysR family  39.5 
 
 		 304 aa  189  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1139  LysR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 306 aa  189  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2522  transcriptional regulator, LysR family  39.3 
 
 		 295 aa  186  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2965  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 297 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1608  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 297 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0270866 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0854  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 316 aa  186  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1792  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 295 aa  182  9.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5011  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 306 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01514  transcriptional regulatory protein  36.04 
 
 		 289 aa  176  6e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1750  transcriptional regulator, LysR family  35.46 
 
 		 324 aa  175  8e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286779  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1390  LysR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4478  LysR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.515823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3247  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 301 aa  172  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1718  LysR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2152  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 318 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3246  LysR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 296 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.742909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3048  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.104991 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7356  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1898  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 297 aa  149  8e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01990  transcriptional regulator transcription regulator protein  32.66 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2478  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.585884  normal  0.517095 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  31.69 
 
 		 294 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3295  LysR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 291 aa  145  9e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 291 aa  143  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2448  LysR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4075  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 297 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4291  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 297 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3448  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 291 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3911  transcriptional regulator, LysR family  34.9 
 
 		 298 aa  138  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3798  transcriptional regulator, LysR family  34.9 
 
 		 298 aa  138  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.244352 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3487  LysR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475425  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>